基因页:snn
概括?
基因 | 8303 |
象征 | snn |
同义词 | - |
描述 | stannin |
参考 | MIM:603032|HGNC:HGNC:11149|ENSEMBL:ENSG00000184602|HPRD:04327|Vega:Otthumg0000000090535 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 16p13 |
Pascal P值 | 0.155 |
Sherlock P值 | 0.113 |
DEG P值 | DEG:Maycox_2009:CC_BA10_FOLD_CHANGE = -1.11:CC_BA10_DISEASE_P = 0.0292:HBB_BA9_FOLD_CHANGE = -1.11:HBB_BA9_DISEASE_P = 0.0232 |
胎儿β | 0.231 |
主持人 | 元 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DEG:Maycox_2009 | 微阵列确定验尸后30000多个mRNA转录本的表达 | 我们包括了51个基因,其表达变化在两个精神分裂症队列之间很常见。 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/SNN_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
Hist1h4a | 0.64 | 0.42 |
Hist1h4b | 0.64 | 0.46 |
Hist1H4C | 0.62 | 0.28 |
Hist1h2ae | 0.57 | 0.27 |
Hist1h2am | 0.57 | 0.25 |
Hist1h2bf | 0.56 | 0.24 |
Hist1H2BJ | 0.56 | 0.23 |
Hist1H1E | 0.55 | 0.24 |
Hist2H2AC | 0.55 | 0.21 |
Hist1H3H | 0.55 | 0.18 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
perp | -0.28 | -0.32 |
SGK1 | -0.26 | -0.24 |
TMEM176A | -0.26 | -0.26 |
TMEM176B | -0.25 | -0.25 |
RP11-178A10.1 | -0.25 | -0.21 |
Elovl7 | -0.24 | -0.28 |
Rhou | -0.24 | -0.22 |
CD97 | -0.24 | -0.26 |
SLC46A3 | -0.24 | -0.24 |
htatip2 | -0.24 | -0.28 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
中村肿瘤区周围与中央DN | 634 | 384 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
周的炎症反应生活 | 485 | 293 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
奥斯曼膀胱癌DN | 406 | 230 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gargalovic对氧化磷脂的反应蓝色DN | 61 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
runx1 runx1t1融合粒细胞的tonks目标向上 | 55 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
tien肠益生菌24小时 | 557 | 331 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
周的炎症反应fima | 544 | 308 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
周炎性反应lps up | 431 | 237 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
甲状腺癌变性DN | 537 | 339 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
buytaert光动力疗法压力 | 811 | 508 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
GC期DN的pasqualucci淋巴瘤 | 165 | 104 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
HADDAD B淋巴细胞祖细胞 | 293 | 193 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Taci的Moreaux多发性骨髓瘤 | 412 | 249 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Basso CD40信号向上 | 101 | 76 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
TACI UP淋巴细胞的淋巴细胞成熟 | 92 | 58 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏病dn | 1237 | 837 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
URS脂肪细胞分化DN | 30 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Durchdewald皮肤致癌DN | 264 | 168 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gavin Foxp3目标集群P7 | 90 | 52 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
促进耐受巨噬细胞DN | 409 | 268 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
海勒被甲基化沉默 | 282 | 183 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Chung水泡细胞毒性DN | 44 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
植洛小儿所有疗法反应dn | 29 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Vantveer乳腺癌ESR1 DN | 240 | 153 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Shedden肺癌良好生存A12 | 317 | 177 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
陈代谢综合征网络 | 1210 | 725 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
croonquist nras发出信号 | 41 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Jison Sickle细胞疾病 | 181 | 106 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
开罗肝脏开发 | 166 | 105 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
raghavachari血小板特异性基因 | 70 | 46 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kim所有疾病少突胶质细胞编号corr up | 756 | 494 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
金双相情感障碍少突胶质细胞密度相关 | 682 | 440 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Chicas RB1目标汇合 | 567 | 365 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
wakabayashi脂肪生成PPARG RXRA绑定8D | 882 | 506 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
寄养KDM1A靶向DN | 211 | 119 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 | 1839年 | 928 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |