SZGR2 - Beplay体育中心

Summary？

基因	8312
象征	AXIN1
Synonyms	Axin \| PPP1R49
Description	轴1
Reference	MIM：603816\|HGNC:HGNC:903\|ENSEMBL：ENSG00000103126\|HPRD:04819\|Vega:OTTHUMG00000064930
基因类型	蛋白质编码
Map location	16p13.3
Pascal p-value	0.019
Sherlock p-value	1.748E-4
胎儿β	0.799
DMG	1 (# studies)
主持人	Cerebellar Hemisphere Myers' cis & trans 元
Support	Ascano FMRP targets

Gene in Data Sources

基因集名称	Method of gene set	Description	信息
CV:PGCnp	Genome-wide Association Study	GWAS
DMG：Wockner_2014	全基因组DNA甲基化分析	该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。	2
Network	Shortest path distance of core genes in the Human protein-protein interaction network	PPI网络中最短路径的贡献：0.0179

Section I. Genetics and epigenetics annotation

Differentially methylated gene

Probe	染色体	位置	Nearest gene	p（dis）	Beta (dis)	fdr（dis）	学习
CG06387245	16	348076	AXIN1	1.61E-5	0.476	0.015	DMG：Wockner_2014
CG10500953	16	346518	AXIN1	9.97e-5	0.202	0.028	DMG：Wockner_2014

eQTL annotation

SNP ID	染色体	位置	主持人	Gene Entrez ID	pvalue	QVALUE	TSS距离	EQTL类型
RS2885415	CHR16	395395	AXIN1	8312		0.08		顺式
RS16993189	Chrx	144666166	AXIN1	8312		0.07		反式

第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

Footnote:
A total of 269 time points ploted, with n=38 fetal samples (x=1:38). Each triangle represents one time point.

时间变化的基因表达（brainspan）

Footnote:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域s; FC: frontal cortex; and TP: temporal-parietal cortex
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

No co-expressed genes in brain regions

第三节。基因本体论注释

分子功能	去学期	证据	神经关键字	PubMed ID
GO:0004871	信号传感器活性	nas		9230313
去：0005515	蛋白质结合	IPI		9601641\|12192039
GO：0042803	蛋白质同构化活性	ISS		-
生物过程	去学期	证据	神经关键字	PubMed ID
去：0007605	声音的感官感知	IEA		-
GO:0006915	凋亡	IEA		-
去：0007309	卵母细胞轴规范	TAS		9230313
GO:0007275	multicellular organismal development	IEA		-
GO:0030178	negative regulation of Wnt receptor signaling pathway	IEA		-
GO:0030163	蛋白质分解代谢过程	IEA		-
GO：0045786	细胞周期的负调控	IEA		-
GO:0046330	JNK级联的积极调节	ISS		-
GO：0060070	Wnt receptor signaling pathway through beta-catenin	我知道了		9601641
Cellular component	去学期	证据	神经关键字	PubMed ID
GO:0005829	细胞质	经验		11955436\|12000790\|12820959 \|15327769\|16753179
去：0005622	细胞内	IEA		-
去：0005634	nucleus	IDA		12072559
去：0005737	cytoplasm	IDA		12072559
GO：0016023	细胞质膜结合的囊泡	IEA		-
GO：0016328	侧质膜	IDA		12072559
GO：0030877	β-catenin破坏复合物	IDA		9601641\|16188939

Section IV. Protein-protein interaction annotation

互动者	别名b	官方全名b	实验	Source	PubMed ID
Anp32a	C15orf1 \|i1pp2a \|lanp \|mapm \|MGC119787 \|MGC150373 \|phap1 \|phapi \|pp32	acidic (leucine-rich) nuclear phosphoprotein 32 family, member A	Two-hybrid	Biogrid	16169070
APC	BTPS2 \|DP2 \|DP2.5 \|dp3 \|GS	adenomatous polyposis coli	重构的复合物 Two-hybrid	Biogrid	9734785
APC	BTPS2 \|DP2 \|DP2.5 \|dp3 \|GS	adenomatous polyposis coli	-	HPRD	11297546
AXIN1	AXIN \| MGC52315	轴1	亲和力捕获 - 韦斯特恩 Two-hybrid	Biogrid	11884395\|16169070
CRMP1	dpysl1 \|DRP-1 \|DRP1	折叠蛋白反应介质蛋白1	Two-hybrid	Biogrid	16169070
CSNK1A1	CK1 \|HLCDGP1 \|Pro2975	酪蛋白激酶1，α1	-	HPRD,BioGRID	11884395
CSNK1E	HCKIE \| MGC10398	酪蛋白激酶1，Epsilon	亲和力捕获 - 韦斯特恩表型抑制	Biogrid	11884395
CSNK1E	HCKIE \| MGC10398	酪蛋白激酶1，Epsilon	-	HPRD	11487578\|12000790
CTNNB1	ctnnb \|DKFZP686D02253 \|FLJ25606 \|FLJ37923	Catenin（cadherin相关蛋白），β1，88KDA	亲和力捕获 - 韦斯特恩重构的复合物 Two-hybrid	Biogrid	9734785\|12805222
CTNNB1	ctnnb \|DKFZP686D02253 \|FLJ25606 \|FLJ37923	Catenin（cadherin相关蛋白），β1，88KDA	-	HPRD	12000790
DAB2	Doc-2 \|DOC2 \|FLJ26626	残疾同源物2，有丝分裂原反应性磷蛋白（果蝇）	重构的复合物	Biogrid	12805222
dixDC1	CCD1 \| KIAA1735	包含1的DIX域	-	HPRD	15262978
DVL1	DVL \| MGC54245	Dish，DSH同源1（果蝇）	亲和力捕获 - 韦斯特恩	Biogrid	10428961
DVL1	DVL \| MGC54245	Dish，DSH同源1（果蝇）	-	HPRD	9482734\|10330403
DVL2	-	Dish，DSH同源2（果蝇）	-	HPRD,BioGRID	10829020
DVL3	KIAA0208	Dish，DSH同源3（果蝇）	亲和力捕获 - 韦斯特恩	Biogrid	12805222
EEF1A1	CCS-3 \|CCS3 \|EEF-1 \|EEF1A \|ef-tu \|EF1A \|FLJ25721 \|graf-1ef \|HNGC：16303 \|leng7 \| MGC102687 \| MGC131894 \| MGC16224 \| PTI1 \| eEF1A-1	真核翻译伸长因子1 alpha 1	Two-hybrid	Biogrid	16169070
GAK	FLJ16629 \|FLJ40395 \|MGC99654	细胞周期蛋白G相关激酶	Two-hybrid	Biogrid	16169070
GSK3B	-	糖原合酶激酶3β	亲和力捕获 - 韦斯特恩重构的复合物 Two-hybrid	Biogrid	9734785\|12511557
LRP5	BMND1 \|evr1 \|EVR4 \|HBM \|LR3 \|LRP7 \|oppg \|操作\|Opta1 \|VBCH2	低密度脂蛋白受体相关蛋白5	-	HPRD,BioGRID	11336703
MAP3K1	MAPKKK1 \| MEKK \| MEKK1	有丝分裂原激活的蛋白激酶激酶激酶1	亲和力捕获 - 韦斯特恩	Biogrid	10829020\|11884395
NCK2	grb4 \|NCKBETA	NCK adaptor protein 2	-	HPRD	11557983
PIAS1	DDXBP1 \|GBP \|gu/rh-ii \|MGC141878 \|MGC141879 \|Zmiz3	protein inhibitor of activated STAT, 1	-	HPRD	12223491
PPP2R5A	B56A \|MGC131915 \|Pr61a	protein phosphatase 2, regulatory subunit B', alpha isoform	亲和力捕获 - 韦斯特恩重构的复合物	Biogrid	11297546
SENP2	Axam2 \|DKFZP762A2316 \|KIAA1331 \|SMT3IP2	SUMO1/sentrin/SMT3 specific peptidase 2	-	HPRD	11997515
SMAD2	JV18 \| JV18-1 \| MADH2 \| MADR2 \| MGC22139 \| MGC34440 \| hMAD-2 \| hSMAD2	SMAD家庭成员2	-	HPRD	11438668
SMAD3	DKFZP586N0721 \|DKFZP686J10186 \|HSPC193 \|HST17436 \|JV15-2 \|madh3 \|MGC60396	SMAD家庭成员3	-	HPRD	11438668
smyd2	HSKM-B \|KMT3C \|MGC119305 \|ZMYND14	设置和mynd域包含2	Affinity Capture-MS	Biogrid	17353931
TSC1	KIAA0243 \|林\|MGC86987 \|TSC	tuberous sclerosis 1	亲和力捕获 - 韦斯特恩	Biogrid	12511557
TSC2	FLJ43106 \| LAM \| TSC4	tuberous sclerosis 2	亲和力捕获 - 韦斯特恩	Biogrid	12511557
UTP14A	KIAA0266 \|NY-CO-16 \|SDCCAG16 \|DJ537K23.3	UTP14，U3小核仁核糖核蛋白，同源物A（酵母）	Two-hybrid	Biogrid	16169070

Section V. Pathway annotation

路径名	路径大小	# SZGR 2.0 genes in pathway	信息
KEGG WNT SIGNALING PATHWAY	151	112	All SZGR 2.0 genes in this pathway
癌症中的KEGG途径	328	259	All SZGR 2.0 genes in this pathway
KEGG结直肠癌	62	47	All SZGR 2.0 genes in this pathway
KEGG ENDOMETRIAL CANCER	52	45	All SZGR 2.0 genes in this pathway
KEGG BASAL CELL CARCINOMA	55	44	All SZGR 2.0 genes in this pathway
BIOCARTA ALK PATHWAY	37	29	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Biocarta GSK3途径	27	26	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Biocarta Pitx2途径	15	15	All SZGR 2.0 genes in this pathway
BIOCARTA PS1 PATHWAY	14	14	All SZGR 2.0 genes in this pathway
BIOCARTA WNT PATHWAY	26	24	All SZGR 2.0 genes in this pathway
wnt信令	89	71	All SZGR 2.0 genes in this pathway
ST WNT BETA CATENIN PATHWAY	34	28	All SZGR 2.0 genes in this pathway
PID Beta catenin deg途径	18	17	All SZGR 2.0 genes in this pathway
PID PS1途径	46	39	All SZGR 2.0 genes in this pathway
PID WNT CANONICAL PATHWAY	20	18	All SZGR 2.0 genes in this pathway
PID MYC PATHWAY	25	22	All SZGR 2.0 genes in this pathway
PID NCADHERIN PATHWAY	33	32	All SZGR 2.0 genes in this pathway
PID TGFBR途径	55	38	All SZGR 2.0 genes in this pathway
REACTOME SIGNALING BY WNT	65	41	All SZGR 2.0 genes in this pathway
REACTOME CTNNB1 PHOSPHORYLATION CASCADE	16	11	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Breuhahn生长因子信号传导肝癌	22	19	All SZGR 2.0 genes in this pathway
ETS1和SP100 DN的Yordy倒数调节	87	48	All SZGR 2.0 genes in this pathway
BUYTAERT PHOTODYNAMIC THERAPY STRESS UP	811	508	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Nikolsky乳腺癌16p13 Amplicon	120	49	All SZGR 2.0 genes in this pathway
羔羊CCND1靶标	19	14	All SZGR 2.0 genes in this pathway
tarte浆细胞与B淋巴细胞DN	38	25	All SZGR 2.0 genes in this pathway
BYSTRYKH HEMATOPOIESIS STEM CELL QTL TRANS	882	572	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Kayo卡路里限制肌肉DN	87	59	All SZGR 2.0 genes in this pathway
SWEET LUNG CANCER KRAS UP	491	316	All SZGR 2.0 genes in this pathway
甜Kras致癌签名	89	56	All SZGR 2.0 genes in this pathway
PILON KLF1 TARGETS DN	1972	1213	All SZGR 2.0 genes in this pathway
BHAT ESR1 TARGETS NOT VIA AKT1 UP	211	131	All SZGR 2.0 genes in this pathway
BHAT ESR1 TARGETS VIA AKT1 UP	281	183	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Krieg缺氧不是通过KDM3A	770	480	All SZGR 2.0 genes in this pathway
ZWANG CLASS 1 TRANSIENTLY INDUCED BY EGF	516	308	All SZGR 2.0 genes in this pathway

第六节。microRNA注释

mirna家族	Target position			miRNA ID	mirna seq
mirna家族	UTR开始	UTR结束	匹配方法	miRNA ID	mirna seq
miR-124/506	433	439	M8	hsa-miR-506	UAAGGCACCCUUCUGAGUAGA
miR-124/506	433	439	M8	HSA-MIR-124^brain	UAAGGCACGCGGUGAAUGCC
miR-128	464	470	M8	hsa-miR-128a	ucacagugaaccggucuuuu
miR-128	464	470	M8	hsa-miR-128b	ucacagugaaccggucuuc
mir-203.1	558	564	M8	hsa-miR-203	ugaaauguuuaggaccacuag
miR-31	454	460	M8	hsa-miR-31	Aggcaagaugcuggcauagcug
miR-493-5p	554	560	M8	HSA-MIR-493-5p	uuguacaugguaggcuuucauu
miR-493-5p	554	560	M8	HSA-MIR-493-5p	uuguacaugguaggcuuucauu
mir-539	560	567	1A，M8	hsa-miR-539	GGAGAAAUUAUCCUUGGUGUGU

SZ：在精神分裂症患者的脑皮质中差异表达的miRNA与使用微阵列进行对照样品进行比较。点击hereto see the list of SZ related miRNAs.
大脑：基于miRNA微阵列表达研究在大脑中表达的miRNA。点击here查看与大脑相关的miRNA列表。

Gene Page:AXIN1