基因页:BAP1
概括?
基因 | 8314 |
象征 | BAP1 |
同义词 | HUCEP-13 | UCHL2 | HUCEP-6 |
描述 | BRCA1相关蛋白1 |
参考 | MIM:603089|HGNC:HGNC:950|Ensembl:ENSG00000163930|HPRD:04366|Vega:Otthumg00000158392 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 3P21.1 |
Pascal P值 | 0.02 |
胎儿β | -0.604 |
主持人 | 皮质 迈尔斯的顺式和跨性别 元 |
支持 | COMPOSITESET Darnell FMRP目标 染色质重塑基因 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
LK:是的 | 全基因组协会研究 | 该数据集包括映射到22个区域的99个基因。CV:RIPKE_2013中还包括24个领先的SNP |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS1249912 | CHR3 | 112390577 | BAP1 | 8314 | 0.15 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/BAP1_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23岁)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
map1lc3a | 0.85 | 0.88 |
TM7SF2 | 0.80 | 0.78 |
def8 | 0.80 | 0.85 |
ABHD14A | 0.79 | 0.87 |
WDR45 | 0.79 | 0.84 |
SCO2 | 0.78 | 0.81 |
CDK5 | 0.78 | 0.83 |
SLC39A3 | 0.77 | 0.84 |
MRPS12 | 0.77 | 0.85 |
rpusd3 | 0.77 | 0.86 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
EIF5B | -0.46 | -0.59 |
NSBP1 | -0.44 | -0.54 |
AF347015.18 | -0.43 | -0.37 |
AC010300.1 | -0.40 | -0.53 |
AF347015.26 | -0.39 | -0.30 |
AC016705.1 | -0.39 | -0.33 |
AF347015.2 | -0.38 | -0.26 |
MT-ATP8 | -0.38 | -0.28 |
Z83840.4 | -0.37 | -0.35 |
AF347015.8 | -0.37 | -0.26 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Gary CD5目标 | 473 | 314 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
多德鼻咽癌 | 1821年 | 933 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
lastowska神经母细胞瘤副本编号dn | 800 | 473 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Perez TP53目标 | 1174 | 695 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Meinhold卵巢癌低级DN | 20 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pujana乳腺癌点燃int网络 | 101 | 73 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
里克曼转移DN | 261 | 155 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
丁肺癌经常突变 | 12 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
西葫芦转移DN | 44 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染20小时 | 240 | 152 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染16小时 | 225 | 139 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
monnier tradiatiation肿瘤逃脱 | 393 | 244 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kyng DNA损坏4NQO或UV | 63 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kyng DNA损坏 | 226 | 164 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yagi AML与11q23重新排列 | 351 | 238 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
fontaine卵泡甲状腺腺瘤DN | 68 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Fontaine甲状腺肿瘤不确定恶性肿瘤DN | 26 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
fontaine乳头状甲状腺癌DN | 80 | 53 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kyng Werner综合征和正常老化DN | 225 | 124 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kim所有疾病少突胶质细胞编号corr up | 756 | 494 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
金双相情感障碍少突胶质细胞密度相关 | 682 | 440 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kim所有疾病Calb1 Corr Up | 548 | 370 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
YU BAP1目标 | 29 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |