概括
基因 8314
象征 BAP1
同义词 HUCEP-13 | UCHL2 | HUCEP-6
描述 BRCA1相关蛋白1
参考 MIM:603089|HGNC:HGNC:950|Ensembl:ENSG00000163930|HPRD:04366|Vega:Otthumg00000158392
基因类型 蛋白质编码
地图位置 3P21.1
Pascal P值 0.02
胎儿β -0.604
主持人 皮质
迈尔斯的顺式和跨性别
支持 COMPOSITESET
Darnell FMRP目标
染色质重塑基因

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
LK:是的 全基因组协会研究 该数据集包括映射到22个区域的99个基因。CV:RIPKE_2013中还包括24个领先的SNP

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS1249912 CHR3 112390577 BAP1 8314 0.15 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23岁)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
map1lc3a 0.85 0.88
TM7SF2 0.80 0.78
def8 0.80 0.85
ABHD14A 0.79 0.87
WDR45 0.79 0.84
SCO2 0.78 0.81
CDK5 0.78 0.83
SLC39A3 0.77 0.84
MRPS12 0.77 0.85
rpusd3 0.77 0.86
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
EIF5B -0.46 -0.59
NSBP1 -0.44 -0.54
AF347015.18 -0.43 -0.37
AC010300.1 -0.40 -0.53
AF347015.26 -0.39 -0.30
AC016705.1 -0.39 -0.33
AF347015.2 -0.38 -0.26
MT-ATP8 -0.38 -0.28
Z83840.4 -0.37 -0.35
AF347015.8 -0.37 -0.26

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Gary CD5目标 473 314 该途径中的所有SZGR 2.0基因
多德鼻咽癌 1821年 933 该途径中的所有SZGR 2.0基因
lastowska神经母细胞瘤副本编号dn 800 473 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Perez TP53目标 1174 695 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meinhold卵巢癌低级DN 20 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pujana乳腺癌点燃int网络 101 73 该途径中的所有SZGR 2.0基因
里克曼转移DN 261 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因
丁肺癌经常突变 12 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因
西葫芦转移DN 44 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染20小时 240 152 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染16小时 225 139 该途径中的所有SZGR 2.0基因
monnier tradiatiation肿瘤逃脱 393 244 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kyng DNA损坏4NQO或UV 63 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kyng DNA损坏 226 164 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yagi AML与11q23重新排列 351 238 该途径中的所有SZGR 2.0基因
fontaine卵泡甲状腺腺瘤DN 68 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Fontaine甲状腺肿瘤不确定恶性肿瘤DN 26 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
fontaine乳头状甲状腺癌DN 80 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kyng Werner综合征和正常老化DN 225 124 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim所有疾病少突胶质细胞编号corr up 756 494 该途径中的所有SZGR 2.0基因
金双相情感障碍少突胶质细胞密度相关 682 440 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim所有疾病Calb1 Corr Up 548 370 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YU BAP1目标 29 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因