基因页面:汽车
总结吗?
GeneID | 833年 |
象征 | 汽车 |
同义词 | CARS1 | CYSRS | MGC: 11246 |
描述 | cysteinyl-tRNA合成酶 |
参考 | MIM: 123859|HGNC: HGNC: 1493|运用:ENSG00000110619|HPRD: 00464|织女:OTTHUMG00000010927 |
基因型 | 蛋白质编码 |
地图上的位置 | 11 p15.5 |
帕斯卡假定值 | 0.646 |
夏洛克假定值 | 0.592 |
胎儿β | -0.684 |
DMG | 1(#研究) |
eGene | 迈尔斯的顺式和反式 |
支持 | Ascano FMRP目标 |
基因数据来源
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
cg03336167 | 11 | 2930995 | 汽车 | 0.003 | -2.163 | DMG: vanEijk_2014 |
eQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
rs6048101 | chr20 | 22429986 | 汽车 | 833年 | 0.11 | 反式 | ||
rs4632416 | chr20 | 22437090 | 汽车 | 833年 | 0.05 | 反式 | ||
rs4459793 | chr20 | 22439811 | 汽车 | 833年 | 0.07 | 反式 | ||
rs6048112 | chr20 | 22442814 | 汽车 | 833年 | 0.1 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
![不可用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/CARS_DE_GTEx.png)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
前10名中的基因 | ||
基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
B2M | 0.71 | 0.74 |
XXbac-BPG116M5.1 | 0.68 | 0.74 |
VAMP5 | 0.68 | 0.72 |
TM4SF1 | 0.68 | 0.70 |
LST1 | 0.67 | 0.66 |
HIGD1B | 0.66 | 0.68 |
循环流化床 | 0.66 | 0.73 |
敝中断 | 0.65 | 0.69 |
IGFBP7 | 0.65 | 0.68 |
IFI27 | 0.64 | 0.64 |
十大负面中的基因 | ||
基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
HNRNPUL2 | -0.58 | -0.57 |
CDC2L2 | -0.57 | -0.57 |
SUPT6H | -0.57 | -0.58 |
PELP1 | -0.57 | -0.61 |
HERC1 | -0.57 | -0.60 |
NOC2L | -0.56 | -0.59 |
SPTAN1 | -0.56 | -0.59 |
SMARCC2 | -0.56 | -0.59 |
MYO18A | -0.56 | -0.55 |
NEURL4 | -0.56 | -0.59 |
第三部分。基因本体论注释
分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0000049 | tRNA绑定 | 小鬼 | 17303165 | |
去:0000049 | tRNA绑定 | NAS | 7987009 | |
去:0000166 | 核苷酸绑定 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0005515 | 蛋白结合 | 新闻学会 | 10908348 | |
去:0005524 | ATP结合 | 艾达 | 17303165 | |
去:0005524 | ATP结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0004817 | cysteine-tRNA连接酶的活动 | 艾达 | 10908348|17303165 | |
去:0004817 | cysteine-tRNA连接酶的活动 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0016874 | 连接酶的活动 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0008270 | 锌离子结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0042803 | 蛋白质homodimerization活动 | 小鬼 | 17303165 | |
去:0046872 | 金属离子结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
去:0006423 | cysteinyl-tRNA氨酰化 | 艾达 | 10908348|17303165 | |
去:0006423 | cysteinyl-tRNA氨酰化 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0006412 | 翻译 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
去:0005737 | 细胞质 | 国际能源机构 | - - - - - - |
部分诉通路注释
路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
---|---|---|---|
KEGG氨酰生物合成 | 41 | 33 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
REACTOME胞质TRNA氨酰化 | 24 | 19 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
REACTOME TRNA氨酰化 | 42 | 34 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
中村肿瘤微环境DN | 46 | 29日 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
刘SOX4 DN的目标 | 309年 | 191年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
加里CD5目标了 | 473年 | 314年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
罗德里格斯甲状腺癌分化不良 | 633年 | 376年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
罗德里格斯甲状腺未分化癌 | 722年 | 443年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
PROVENZANI转移了 | 194年 | 112年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
徐HGF信号不是通过AKT1 48小时 | 35 | 20. | 所有SZGR 2.0基因通路 |
DIRMEIER LMP1回应晚了 | 57 | 41 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
AMUNDSON亚砷酸反应 | 217年 | 143年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
通过ELK3 DN严重缺氧 | 156年 | 106年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
彭亮氨酸剥夺了 | 142年 | 93年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
彭葡萄糖剥夺了 | 48 | 26 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
詹多发性骨髓瘤起来 | 64年 | 46 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
安倍VEGFA目标2小时 | 34 | 21 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
李老化小脑DN | 86年 | 66年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
GAJATE TRABECTEDIN反应 | 67年 | 45 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
曾IRS1目标了 | 113年 | 71年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
曾脂肪形成的潜力了 | 30. | 19 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
KRIGE氨基酸不足 | 29日 | 20. | 所有SZGR 2.0基因通路 |
KRIGE TOSEDOSTAT反应6小时 | 953年 | 554年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
KRIGE TOSEDOSTAT反应24小时 | 783年 | 442年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
马丁内斯RB1目标了 | 673年 | 430年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
马丁内斯TP53的目标了 | 602年 | 364年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
马丁内斯RB1和TP53的目标 | 601年 | 369年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
PODAR ADAPHOSTIN反应 | 147年 | 98年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
陈HOXA5目标9小时 | 223年 | 132年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
布卢姆SALIRASIB反应 | 245年 | 159年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
GRESHOCK癌症拷贝数 | 323年 | 240年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
CHAUHAN METHOXYESTRADIOL反应 | 51 | 32 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
八木AML和11 q23处重新安排 | 351年 | 238年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
格雷戈里合成与伊马替尼致命 | 145年 | 83年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
不是通过P38冯氏TNF响应 | 337年 | 236年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |