基因页:Hist1H2Bl
概括?
基因 | 8340 |
象征 | Hist1H2Bl |
同义词 | H2B/C | H2BFC | DJ97D16.4 |
描述 | 组蛋白簇1,H2BL |
参考 | MIM:602800|HGNC:HGNC:4748|Ensembl:ENSG00000185130|HPRD:11898|Vega:Otthumg0000000014485 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 6p22.1 |
Pascal P值 | 1E-12 |
胎儿β | 0.31 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
CV:GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR:0.033 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/HIST1H2BL_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
scyl1 | 0.89 | 0.86 |
RNF123 | 0.88 | 0.85 |
clcn7 | 0.87 | 0.85 |
iffo1 | 0.87 | 0.88 |
弗林 | 0.87 | 0.86 |
TBC1D17 | 0.87 | 0.83 |
SPG7 | 0.86 | 0.83 |
Rab11fip3 | 0.86 | 0.84 |
ABCB9 | 0.86 | 0.85 |
SBF1 | 0.86 | 0.84 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AF347015.21 | -0.73 | -0.64 |
AF347015.31 | -0.66 | -0.56 |
MT-CO2 | -0.64 | -0.55 |
C1orf54 | -0.64 | -0.64 |
GNG11 | -0.64 | -0.60 |
AF347015.8 | -0.63 | -0.53 |
鼻孔 | -0.61 | -0.51 |
mt-cyb | -0.60 | -0.50 |
AF347015.2 | -0.60 | -0.48 |
AF347015.27 | -0.59 | -0.53 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0003677 | DNA结合 | nas | 9439656 | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0006334 | 核小体组装 | nas | 9439656 | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0000786 | 核小体 | nas | 9439656 | |
去:0005634 | 核 | IEA | - | |
去:0005694 | 染色体 | IEA | - |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
kegg系统性狼疮红斑 | 140 | 100 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome减数分裂 | 116 | 81 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组细胞周期 | 421 | 253 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome RNA Pol I转录 | 89 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome转录 | 210 | 127 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome RNA Pol I RNA Pol III和线粒体转录 | 122 | 80 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome染色体维护 | 122 | 80 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
新CENPA的反应组沉积在丝粒处含有核小体 | 64 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome RNA Pol I启动子开口 | 62 | 49 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome减数分裂重组 | 86 | 62 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome Meiotic Synapsis | 73 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组淀粉样蛋白 | 83 | 63 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
端粒末端的反应组包装 | 48 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome端粒维护 | 75 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ENK UV响应角质形成细胞 | 530 | 342 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nuytten Nipp1靶向 | 769 | 437 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath EED目标 | 1062 | 725 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Shen Smarca2靶向DN | 357 | 212 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Xu GH1自分泌目标 | 268 | 157 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由Foxp3绑定的Marson未刺激 | 1229 | 713 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由E2F4绑定的Marson未刺激 | 728 | 415 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
张TLX目标36hr | 221 | 150 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
张TLX目标60小时 | 293 | 203 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
张TLX目标 | 108 | 78 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
rao由SALL4同工型B绑定 | 517 | 302 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |