概括
基因 8340
象征 Hist1H2Bl
同义词 H2B/C | H2BFC | DJ97D16.4
描述 组蛋白簇1,H2BL
参考 MIM:602800|HGNC:HGNC:4748|Ensembl:ENSG00000185130|HPRD:11898|Vega:Otthumg0000000014485
基因类型 蛋白质编码
地图位置 6p22.1
Pascal P值 1E-12
胎儿β 0.31

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
CV:GWASDB 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 PSR:0.033

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
scyl1 0.89 0.86
RNF123 0.88 0.85
clcn7 0.87 0.85
iffo1 0.87 0.88
弗林 0.87 0.86
TBC1D17 0.87 0.83
SPG7 0.86 0.83
Rab11fip3 0.86 0.84
ABCB9 0.86 0.85
SBF1 0.86 0.84
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.21 -0.73 -0.64
AF347015.31 -0.66 -0.56
MT-CO2 -0.64 -0.55
C1orf54 -0.64 -0.64
GNG11 -0.64 -0.60
AF347015.8 -0.63 -0.53
鼻孔 -0.61 -0.51
mt-cyb -0.60 -0.50
AF347015.2 -0.60 -0.48
AF347015.27 -0.59 -0.53

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0003677 DNA结合 nas 9439656
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0006334 核小体组装 nas 9439656
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0000786 核小体 nas 9439656
去:0005634 IEA -
去:0005694 染色体 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
kegg系统性狼疮红斑 140 100 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome减数分裂 116 81 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组细胞周期 421 253 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome RNA Pol I转录 89 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome转录 210 127 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome RNA Pol I RNA Pol III和线粒体转录 122 80 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome染色体维护 122 80 该途径中的所有SZGR 2.0基因
新CENPA的反应组沉积在丝粒处含有核小体 64 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome RNA Pol I启动子开口 62 49 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome减数分裂重组 86 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome Meiotic Synapsis 73 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组淀粉样蛋白 83 63 该途径中的所有SZGR 2.0基因
端粒末端的反应组包装 48 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome端粒维护 75 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ENK UV响应角质形成细胞 530 342 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten Nipp1靶向 769 437 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath EED目标 1062 725 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shen Smarca2靶向DN 357 212 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Xu GH1自分泌目标 268 157 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由Foxp3绑定的Marson未刺激 1229 713 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由E2F4绑定的Marson未刺激 728 415 该途径中的所有SZGR 2.0基因
张TLX目标36hr 221 150 该途径中的所有SZGR 2.0基因
张TLX目标60小时 293 203 该途径中的所有SZGR 2.0基因
张TLX目标 108 78 该途径中的所有SZGR 2.0基因
rao由SALL4同工型B绑定 517 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因