基因页：Hist1H2BE
概括？
| 基因 | 8344 |
| 象征 | Hist1H2BE |
| 同义词 | H2B.H | H2B/H | H2BFH | DJ221C16.8 |
| 描述 | 组蛋白簇1，H2BE |
| 参考 | MIM：602805|HGNC：HGNC：4753|ENSEMBL：ENSG00000274290|HPRD：11901|Vega：Otthumg0000000014427 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 6p22.2 |
| Pascal P值 | 8.884e-4 |
| 胎儿β | 0.504 |
| 主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
| 支持 | COMPOSITESET |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DNM：Fromer_2014 | 整个外显子组测序分析 | 这项研究报道了WES对623个精神分裂症三重奏的研究，该研究使用基因组DNA报告了DNM。 | |
| GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR：0.033 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
DNM表
DNM表| 基因 | 染色体 | 位置 | 参考 | alt | 成绩单 | AA更改 | 突变类型 | 筛 | CG46 | 特征 | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Hist1H2BE | CHR6 | 26184139 | C | 一个 | NM_003523 | p.39s> y | 错过 | 精神分裂症 | DNM：Fromer_2014 |
EQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS11688718 | CHR2 | 73760938 | Hist1H2BE | 8344 | 0.12 | 反式 | ||
| RS4346412 | CHR2 | 73843570 | Hist1H2BE | 8344 | 0.19 | 反式 | ||
| RS4852939 | CHR2 | 73856768 | Hist1H2BE | 8344 | 0.18 | 反式 | ||
| RS10994209 | Chr10 | 61877705 | Hist1H2BE | 8344 | 0.09 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| trub2 | 0.91 | 0.89 |
| UQCRC1 | 0.91 | 0.92 |
| MRPL38 | 0.91 | 0.88 |
| Ankrd39 | 0.91 | 0.88 |
| WDR45 | 0.90 | 0.90 |
| ERI3 | 0.90 | 0.88 |
| MRPL4 | 0.89 | 0.86 |
| CYC1 | 0.89 | 0.89 |
| neu1 | 0.89 | 0.87 |
| Stoml2 | 0.89 | 0.86 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| AC010300.1 | -0.53 | -0.67 |
| AF347015.18 | -0.53 | -0.47 |
| EIF5B | -0.49 | -0.57 |
| NSBP1 | -0.48 | -0.49 |
| AL139819.3 | -0.47 | -0.46 |
| AC005921.3 | -0.47 | -0.58 |
| MT-ATP8 | -0.47 | -0.38 |
| AF347015.26 | -0.46 | -0.36 |
| C10orf108 | -0.46 | -0.44 |
| AC016705.1 | -0.45 | -0.44 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| kegg系统性狼疮红斑 | 140 | 100 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome减数分裂 | 116 | 81 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 反应组细胞周期 | 421 | 253 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome RNA Pol I转录 | 89 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome转录 | 210 | 127 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome RNA Pol I RNA Pol III和线粒体转录 | 122 | 80 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome染色体维护 | 122 | 80 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 新CENPA的反应组沉积在丝粒处含有核小体 | 64 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome RNA Pol I启动子开口 | 62 | 49 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome减数分裂重组 | 86 | 62 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome Meiotic Synapsis | 73 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 反应组淀粉样蛋白 | 83 | 63 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 端粒末端的反应组包装 | 48 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome端粒维护 | 75 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 通过CD40 DN的Hollmann凋亡 | 267 | 178 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| GAZDA钻石黑芬贫血红斑dn | 493 | 298 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kim WT1靶向DN | 459 | 276 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 罗德里格甲状腺癌的分化不佳 | 633 | 376 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath Myc Max目标 | 775 | 494 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 彭亮氨酸剥夺 | 142 | 93 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| NPM1本地化的Alcalay AML | 140 | 83 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zhan多发性骨髓瘤 | 64 | 46 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lenaour树突状细胞成熟DN | 128 | 90 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| liang被甲基化2沉默2 | 53 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 葡萄病毒感染的Debiasi凋亡 | 314 | 201 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| dazard对紫外线nhek的反应 | 244 | 151 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 外邦紫外线高剂量DN | 312 | 203 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 外邦紫外线高剂量 | 25 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| liang被甲基化沉默 | 32 | 18 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 由Foxp3绑定的Marson未刺激 | 1229 | 713 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 由E2F4绑定的Marson未刺激 | 728 | 415 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| riggi ewing肉瘤祖先 | 430 | 288 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| H3K27ME3 DN的Acevedo肝癌 | 228 | 114 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Bonome卵巢癌的生存次优秀 | 510 | 309 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 由MYC约束 | 1103 | 714 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |