基因页:aph1b
概括?
基因 | 83464 |
象征 | aph1b |
同义词 | APH-1B | Pro1328 | PSFL | TAAV688 |
描述 | APH-1同源物B,伽马分泌酶亚基 |
参考 | MIM:607630|HGNC:HGNC:24080|ENSEMBL:ENSG00000138613|HPRD:06361|Vega:Otthumg00000132863 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 15Q22.2 |
Pascal P值 | 3.584e-4 |
Sherlock P值 | 0.226 |
胎儿β | -0.449 |
支持 | 神经营养蛋白信号传导 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/APH1B_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
RBCK1 | 0.81 | 0.80 |
LMF2 | 0.80 | 0.81 |
tyk2 | 0.80 | 0.76 |
SLC12A9 | 0.78 | 0.77 |
C19orf6 | 0.78 | 0.77 |
ITFG3 | 0.77 | 0.77 |
CDK9 | 0.76 | 0.74 |
C7orf27 | 0.76 | 0.76 |
D2HGDH | 0.76 | 0.77 |
AC004410.1 | 0.76 | 0.77 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AF347015.21 | -0.53 | -0.56 |
AF347015.31 | -0.48 | -0.48 |
clec2b | -0.48 | -0.53 |
Sycp3 | -0.48 | -0.49 |
GNG11 | -0.47 | -0.49 |
MT-CO2 | -0.46 | -0.46 |
AL050337.1 | -0.46 | -0.47 |
AF347015.27 | -0.45 | -0.47 |
C1orf54 | -0.45 | -0.45 |
AF347015.8 | -0.45 | -0.45 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
PID Notch途径 | 59 | 49 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID PS1途径 | 46 | 39 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID P75 NTR途径 | 69 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID Syndecan 3途径 | 17 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NGF的Reactome信号传导 | 217 | 167 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ERBB4的Reactome信号传导 | 90 | 67 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ERBB4的Reactome核信号传导 | 38 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome激活的Notch1将信号传输到细胞核 | 27 | 18 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Notch4的Reactome信号传导 | 12 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Notch2的Reactome信号传导 | 12 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Notch1的Reactome信号传导 | 70 | 46 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Notch3的Reactome信号传导 | 12 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome调节的p75NTR蛋白水解 | 10 | 9 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome NRIF信号是细胞核的细胞死亡 | 15 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome细胞死亡信号通过Nrage NRIF和NADE传导 | 60 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome P75 NTR受体介导的信号传导 | 81 | 61 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Notch的Reactome信号传导 | 103 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Horiuchi WTAP靶向 | 306 | 188 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
furukawa dusp6靶向pci35 | 74 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔卡拉凋亡 | 88 | 60 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
co牛MYCN目标 | 43 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Ross AML带有MLL融合 | 78 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Krige对Tosedostat 6小时的反应 | 953 | 554 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Krige对Tosedostat的反应24小时 | 783 | 442 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Creighton内分泌疗法抗性4 | 307 | 185 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zhan多发性骨髓瘤MF DN | 41 | 28 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |