基因页:ARHGAP24
概括?
基因 | 83478 |
象征 | ARHGAP24 |
同义词 | FILGAP | RC-GAP72 | RCGAP72 | P73 | P73RHOGAP |
描述 | Rho GTPase激活蛋白24 |
参考 | MIM:610586|HGNC:HGNC:25361|ENSEMBL:ENSG00000138639|HPRD:09804|Vega:Otthumg00000130427 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 4Q22.1 |
Pascal P值 | 0.157 |
DEG P值 | DEG:SANDERS_2014:DS1_P = 0.151:DS1_BETA = 0.034900:DS2_P = 6.45E-02:DS2_BETA = 0.093:DS2_FDR = 2.28e-011 |
胎儿β | -0.665 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
CV:GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DEG:Sanders_2013 | 微阵列 | 使用微阵列在413例和446例对照中使用微阵列(LCLS)上的微阵列进行全基因组基因表达谱。 | |
go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关的关键字的命中:1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/ARHGAP24_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0005096 | GTPase激活剂活性 | IEA | - | |
去:0005515 | 蛋白质结合 | IPI | 16862148 | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0001525 | 血管生成 | IEA | - | |
去:0007165 | 信号转导 | IEA | - | |
去:0007275 | 多细胞生物发育 | IEA | - | |
去:0030154 | 细胞分化 | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
GO:0042995 | 细胞投影 | IEA | Axon(GO术语级别:4) | - |
去:0005856 | 细胞骨架 | IEA | - | |
去:0005622 | 细胞内 | IEA | - | |
去:0005737 | 细胞质 | IEA | - | |
GO:0030054 | 细胞连接 | IEA | - |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Rho GTPases的Reactome信号传导 | 113 | 81 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
thum收缩性心力衰竭 | 423 | 283 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
VMYB vs CMYB DN的LIU目标 | 43 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
vecchi胃癌早期DN | 367 | 220 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
甲状腺癌变性DN | 537 | 339 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Petretto心脏质量QTL顺式DN | 24 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
松本自然杀手差分 | 475 | 313 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CUI TCF21目标2 DN | 830 | 547 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Creighton内分泌疗法抗性1 | 528 | 324 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
肝癌DN中的阿塞维多甲基化 | 940 | 425 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bonome卵巢癌的生存最佳逃亡 | 246 | 152 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Izadpanah干细胞脂肪与骨头 | 126 | 92 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bhati G2M被2methoxyestradiol DN逮捕 | 127 | 75 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CCND1 MYC的王肿瘤转化 | 21 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
McMurray TP53 HRAS合作响应DN | 67 | 46 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
林乳腺干细胞向上 | 489 | 314 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 | 1839年 | 928 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang EGF间隔DN | 214 | 124 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
mir-141/200a | 197 | 203 | 1a | HSA-MIR-141 | uaacacugucugugugugugaugg |
HSA-MIR-200A | uaacacugucuguguguguaaacgaugu | ||||
mir-145 | 205 | 211 | M8 | HSA-MIR-145 | guccaguuucccaggaaucccuu |
mir-194 | 199 | 205 | 1a | HSA-MIR-194 | uguaacagcaacuccauga |
mir-21 | 361 | 368 | 1A,M8 | HSA-MIR-21脑 | uagcuuaucagacugauguuga |
HSA-MIR-590 | gagcuuauucauaaaaagugcag | ||||
mir-496 | 555 | 561 | 1a | HSA-MIR-496 | Auuacauggccaaucuc |
mir-9 | 161 | 167 | M8 | HSA-MIR-9SZ | ucuuuguuaucuagcuguauga |
mir-93.hd/291-3p/294/295/302/372/373/520 | 352 | 358 | 1a | HSA-MIR-93脑 | aaagugcuguucgugcagguag |
HSA-MIR-302A | uaagugcuugcauguuuguga | ||||
HSA-MIR-302B | uaagugcuuccauguuuaguag | ||||
HSA-MIR-302C | uaagugcuuccauguucagugg | ||||
HSA-MIR-302D | Uaagugcuauguugugugu | ||||
HSA-MIR-372 | aaagugcugcgacauuugagcgu | ||||
HSA-MIR-373 | Gaagugcuucgauuuggggugu | ||||
HSA-MIR-520E | Aaagugcuuuuuugaggg | ||||
HSA-MIR-520A | aaagugcuucccuuguggugu | ||||
HSA-MIR-520B | aaagugcuuuuuuagaggg | ||||
HSA-MIR-520C | aaagugcuuuuuuaggggug | ||||
HSA-MIR-520D | aaaguguuugugggguggguu | ||||
mir-96 | 521 | 527 | M8 | HSA-MIR-96脑 | uuuggcacuagcacauuuuugc |