概括
基因 83478
象征 ARHGAP24
同义词 FILGAP | RC-GAP72 | RCGAP72 | P73 | P73RHOGAP
描述 Rho GTPase激活蛋白24
参考 MIM:610586|HGNC:HGNC:25361|ENSEMBL:ENSG00000138639|HPRD:09804|Vega:Otthumg00000130427
基因类型 蛋白质编码
地图位置 4Q22.1
Pascal P值 0.157
DEG P值 DEG:SANDERS_2014:DS1_P = 0.151:DS1_BETA = 0.034900:DS2_P = 6.45E-02:DS2_BETA = 0.093:DS2_FDR = 2.28e-011
胎儿β -0.665

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
CV:GWASDB 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DEG:Sanders_2013 微阵列 使用微阵列在413例和446例对照中使用微阵列(LCLS)上的微阵列进行全基因组基因表达谱。
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关的关键字的命中:1

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005096 GTPase激活剂活性 IEA -
去:0005515 蛋白质结合 IPI 16862148
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0001525 血管生成 IEA -
去:0007165 信号转导 IEA -
去:0007275 多细胞生物发育 IEA -
去:0030154 细胞分化 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO:0042995 细胞投影 IEA Axon(GO术语级别:4) -
去:0005856 细胞骨架 IEA -
去:0005622 细胞内 IEA -
去:0005737 细胞质 IEA -
GO:0030054 细胞连接 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Rho GTPases的Reactome信号传导 113 81 该途径中的所有SZGR 2.0基因
thum收缩性心力衰竭 423 283 该途径中的所有SZGR 2.0基因
VMYB vs CMYB DN的LIU目标 43 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
vecchi胃癌早期DN 367 220 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲状腺癌变性DN 537 339 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Petretto心脏质量QTL顺式DN 24 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
松本自然杀手差分 475 313 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CUI TCF21目标2 DN 830 547 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性1 528 324 该途径中的所有SZGR 2.0基因
肝癌DN中的阿塞维多甲基化 940 425 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bonome卵巢癌的生存最佳逃亡 246 152 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Izadpanah干细胞脂肪与骨头 126 92 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bhati G2M被2methoxyestradiol DN逮捕 127 75 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CCND1 MYC的王肿瘤转化 21 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
McMurray TP53 HRAS合作响应DN 67 46 该途径中的所有SZGR 2.0基因
林乳腺干细胞向上 489 314 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 1839年 928 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang EGF间隔DN 214 124 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-141/200a 197 203 1a HSA-MIR-141 uaacacugucugugugugugaugg
HSA-MIR-200A uaacacugucuguguguguaaacgaugu
mir-145 205 211 M8 HSA-MIR-145 guccaguuucccaggaaucccuu
mir-194 199 205 1a HSA-MIR-194 uguaacagcaacuccauga
mir-21 361 368 1A,M8 HSA-MIR-21 uagcuuaucagacugauguuga
HSA-MIR-590 gagcuuauucauaaaaagugcag
mir-496 555 561 1a HSA-MIR-496 Auuacauggccaaucuc
mir-9 161 167 M8 HSA-MIR-9SZ ucuuuguuaucuagcuguauga
mir-93.hd/291-3p/294/295/302/372/373/520 352 358 1a HSA-MIR-93 aaagugcuguucgugcagguag
HSA-MIR-302A uaagugcuugcauguuuguga
HSA-MIR-302B uaagugcuuccauguuuaguag
HSA-MIR-302C uaagugcuuccauguucagugg
HSA-MIR-302D Uaagugcuauguugugugu
HSA-MIR-372 aaagugcugcgacauuugagcgu
HSA-MIR-373 Gaagugcuucgauuuggggugu
HSA-MIR-520E Aaagugcuuuuuugaggg
HSA-MIR-520A aaagugcuucccuuguggugu
HSA-MIR-520B aaagugcuuuuuuagaggg
HSA-MIR-520C aaagugcuuuuuuaggggug
HSA-MIR-520D aaaguguuugugggguggguu
mir-96 521 527 M8 HSA-MIR-96 uuuggcacuagcacauuuuugc