基因页面:SCRT1
总结吗?
GeneID | 83482年 |
象征 | SCRT1 |
同义词 | SCRT | ZNF898 |
描述 | 家庭锌指1 |
参考 | MIM: 605858|HGNC: HGNC: 15950|运用:ENSG00000261678|HPRD: 16166|织女:OTTHUMG00000165229 |
基因型 | 蛋白质编码 |
地图上的位置 | 8 q24.3 |
帕斯卡假定值 | 0.292 |
胎儿β | -0.431 |
DMG | 1(#研究) |
基因数据来源
基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
DMG: Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括4641个不同甲基化探针对应2929个独特的基因之间的精神分裂症患者(n = 24)和控制(n = 24)。 | 1 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
cg07918726 | 8 | 145559963 | SCRT1 | 1.885的军医 | -0.335 | 0.034 | DMG: Wockner_2014 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
![不可用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/SCRT1_DE_GTEx.png)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
前10名中的基因 | ||
基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
STK36 | 0.87 | 0.84 |
HYDIN | 0.86 | 0.83 |
TARBP1 | 0.84 | 0.84 |
KIAA1407 | 0.84 | 0.75 |
THBS3 | 0.84 | 0.77 |
KIAA1683 | 0.83 | 0.77 |
MAPK15 | 0.83 | 0.55 |
AC022382.1 | 0.82 | 0.85 |
CCDC37 | 0.82 | 0.62 |
WSB1 | 0.80 | 0.84 |
十大负面中的基因 | ||
基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AF347015.31 | -0.39 | -0.45 |
ABCG2 | -0.38 | -0.42 |
AF347015.27 | -0.37 | -0.42 |
GIMAP5 | -0.37 | -0.46 |
IFI27 | -0.37 | -0.43 |
MT-CO2 | -0.36 | -0.42 |
TM4SF18 | -0.36 | -0.44 |
COX4I2 | -0.36 | -0.42 |
TM4SF1 | -0.35 | -0.39 |
AF347015.21 | -0.35 | -0.51 |
部分诉通路注释
路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
---|---|---|---|
金正日WT1 DN的目标 | 459年 | 276年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
迈斯纳大脑HCP H3K4ME3和H3K27ME3 | 1069年 | 729年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
迈斯纳人大HCP H3K4ME2和H3K27ME3 | 349年 | 234年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
米凯尔森MCV6 HCP H3K27ME3 | 435年 | 318年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
米凯尔森人大HCP H3K27ME3 | 341年 | 243年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
米凯尔森MEF HCP H3K27ME3 | 590年 | 403年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
若林史江脂肪生成PPARG 8 d | 658年 | 397年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |