基因页:Hist1h3d
概括?
基因 | 8351 |
象征 | Hist1h3d |
同义词 | H3/B | H3FB |
描述 | 组蛋白簇1,H3D |
参考 | MIM:602811|HGNC:HGNC:4767|HPRD:11905| |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 6p22.1 |
Pascal P值 | 0.003 |
胎儿β | 0.951 |
DMG | 1(#研究) |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 1 |
GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR:0.033 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG23601095 | 6 | 26197514 | Hist1h3d | 7.56e-5 | -0.735 | 0.025 | DMG:Wockner_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/HIST1H3D_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
RPS23 | 0.95 | 0.94 |
RPS13P2 | 0.95 | 0.96 |
RPS15A | 0.95 | 0.93 |
RPS11P5 | 0.94 | 0.93 |
RPL37 | 0.93 | 0.88 |
rps3p3 | 0.93 | 0.92 |
RPL18 | 0.93 | 0.85 |
RPL32 | 0.92 | 0.92 |
RPL19P12 | 0.92 | 0.88 |
RPS14 | 0.92 | 0.92 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
ABCB1 | -0.60 | -0.74 |
ZBTB47 | -0.58 | -0.67 |
ptprb | -0.58 | -0.72 |
ATP10A | -0.58 | -0.72 |
EPB41L2 | -0.58 | -0.73 |
PK4P | -0.57 | -0.67 |
EPAS1 | -0.57 | -0.80 |
synm | -0.57 | -0.75 |
MAP3K5 | -0.57 | -0.69 |
EDN3 | -0.57 | -0.70 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
kegg系统性狼疮红斑 | 140 | 100 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome减数分裂 | 116 | 81 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome RNA Pol I转录 | 89 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome转录 | 210 | 127 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome RNA Pol I RNA Pol III和线粒体转录 | 122 | 80 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome RNA Pol I启动子开口 | 62 | 49 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
巨核细胞发育和血小板产生涉及的反应组因素 | 132 | 101 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome减数分裂重组 | 86 | 62 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组止血 | 466 | 331 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组淀粉样蛋白 | 83 | 63 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿霉素的Graessmann凋亡 | 1142 | 669 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Graessmann对MC和阿霉素的反应 | 612 | 367 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Olsson E2F3靶向DN | 49 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath EED目标 | 1062 | 725 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由E2F绑定的REN | 61 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染14小时 | 156 | 101 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
乔治塔斯HSC标记 | 71 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染10小时 | 101 | 69 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由FOXP3绑定的Marson刺激 | 1022 | 619 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由Foxp3绑定的Marson未刺激 | 1229 | 713 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由E2F4绑定的Marson未刺激 | 728 | 415 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
海勒被甲基化沉默 | 282 | 183 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Heller HDAC靶向 | 317 | 208 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Heller HDAC靶向被甲基化的沉默 | 461 | 298 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿隆索转移 | 198 | 128 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
马滕斯三维诺蛋白响应DN | 841 | 431 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
wakabayashi脂肪生成PPARG RXRA绑定8D | 882 | 506 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |