概括
基因 8351
象征 Hist1h3d
同义词 H3/B | H3FB
描述 组蛋白簇1,H3D
参考 MIM:602811|HGNC:HGNC:4767|HPRD:11905|
基因类型 蛋白质编码
地图位置 6p22.1
Pascal P值 0.003
胎儿β 0.951
DMG 1(#研究)

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 1
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 PSR:0.033

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG23601095 6 26197514 Hist1h3d 7.56e-5 -0.735 0.025 DMG:Wockner_2014


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
RPS23 0.95 0.94
RPS13P2 0.95 0.96
RPS15A 0.95 0.93
RPS11P5 0.94 0.93
RPL37 0.93 0.88
rps3p3 0.93 0.92
RPL18 0.93 0.85
RPL32 0.92 0.92
RPL19P12 0.92 0.88
RPS14 0.92 0.92
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
ABCB1 -0.60 -0.74
ZBTB47 -0.58 -0.67
ptprb -0.58 -0.72
ATP10A -0.58 -0.72
EPB41L2 -0.58 -0.73
PK4P -0.57 -0.67
EPAS1 -0.57 -0.80
synm -0.57 -0.75
MAP3K5 -0.57 -0.69
EDN3 -0.57 -0.70

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
kegg系统性狼疮红斑 140 100 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome减数分裂 116 81 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome RNA Pol I转录 89 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome转录 210 127 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome RNA Pol I RNA Pol III和线粒体转录 122 80 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome RNA Pol I启动子开口 62 49 该途径中的所有SZGR 2.0基因
巨核细胞发育和血小板产生涉及的反应组因素 132 101 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome减数分裂重组 86 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组止血 466 331 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组淀粉样蛋白 83 63 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿霉素的Graessmann凋亡 1142 669 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Graessmann对MC和阿霉素的反应 612 367 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Olsson E2F3靶向DN 49 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath EED目标 1062 725 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由E2F绑定的REN 61 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染14小时 156 101 该途径中的所有SZGR 2.0基因
乔治塔斯HSC标记 71 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染10小时 101 69 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由FOXP3绑定的Marson刺激 1022 619 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由Foxp3绑定的Marson未刺激 1229 713 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由E2F4绑定的Marson未刺激 728 415 该途径中的所有SZGR 2.0基因
海勒被甲基化沉默 282 183 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Heller HDAC靶向 317 208 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Heller HDAC靶向被甲基化的沉默 461 298 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿隆索转移 198 128 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马滕斯三维诺蛋白响应DN 841 431 该途径中的所有SZGR 2.0基因
wakabayashi脂肪生成PPARG RXRA绑定8D 882 506 该途径中的所有SZGR 2.0基因