基因页:chst9
概括?
基因 | 83539 |
象征 | chst9 |
同义词 | GALNAC4ST-2 | GALNAC4ST2 |
描述 | 碳水化合物(N-乙酰基半乳糖胺4-0)磺胺转移酶9 |
参考 | MIM:610191|HGNC:HGNC:19898|ENSEMBL:ENSG00000154080|Vega:Otthumg00000179469 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 18Q11.2 |
Pascal P值 | 0.169 |
胎儿β | 0.688 |
主持人 | 伏隔核基底神经节 元 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
CV:GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/CHST9_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
TCEB2 | 0.88 | 0.82 |
TMEM147 | 0.86 | 0.85 |
CHCHD5 | 0.85 | 0.79 |
SSR4 | 0.85 | 0.78 |
AP000350.6 | 0.84 | 0.77 |
NDUFA11 | 0.84 | 0.76 |
polr2i | 0.83 | 0.77 |
C7orf55 | 0.83 | 0.80 |
yif1a | 0.83 | 0.79 |
TRPT1 | 0.83 | 0.74 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
TRIM44 | -0.42 | -0.47 |
AL031003.1 | -0.41 | -0.40 |
VPS13A | -0.41 | -0.41 |
rabgap1l | -0.41 | -0.39 |
USP12 | -0.41 | -0.40 |
mysm1 | -0.40 | -0.41 |
traf3ip1 | -0.40 | -0.39 |
kif5c | -0.40 | -0.39 |
SLK | -0.40 | -0.41 |
AP000758.2 | -0.39 | -0.41 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
反应组软骨素硫酸盐生物合成 | 21 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组软骨素硫酸盐皮肤硫酸盐代谢 | 49 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome糖胺聚糖代谢 | 111 | 69 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
碳水化合物的反应组代谢 | 247 | 154 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sengupta鼻咽癌DN | 349 | 157 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
多德鼻咽癌 | 1821年 | 933 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
哈马凋亡通过Trail Up | 584 | 356 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schaeffer前列腺开发48小时DN | 428 | 306 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
APC和MBD2的Phesse目标 | 20 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |