概括
基因 83539
象征 chst9
同义词 GALNAC4ST-2 | GALNAC4ST2
描述 碳水化合物(N-乙酰基半乳糖胺4-0)磺胺转移酶9
参考 MIM:610191|HGNC:HGNC:19898|ENSEMBL:ENSG00000154080|Vega:Otthumg00000179469
基因类型 蛋白质编码
地图位置 18Q11.2
Pascal P值 0.169
胎儿β 0.688
主持人 伏隔核基底神经节

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
CV:GWASDB 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
TCEB2 0.88 0.82
TMEM147 0.86 0.85
CHCHD5 0.85 0.79
SSR4 0.85 0.78
AP000350.6 0.84 0.77
NDUFA11 0.84 0.76
polr2i 0.83 0.77
C7orf55 0.83 0.80
yif1a 0.83 0.79
TRPT1 0.83 0.74
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
TRIM44 -0.42 -0.47
AL031003.1 -0.41 -0.40
VPS13A -0.41 -0.41
rabgap1l -0.41 -0.39
USP12 -0.41 -0.40
mysm1 -0.40 -0.41
traf3ip1 -0.40 -0.39
kif5c -0.40 -0.39
SLK -0.40 -0.41
AP000758.2 -0.39 -0.41

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
反应组软骨素硫酸盐生物合成 21 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组软骨素硫酸盐皮肤硫酸盐代谢 49 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome糖胺聚糖代谢 111 69 该途径中的所有SZGR 2.0基因
碳水化合物的反应组代谢 247 154 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sengupta鼻咽癌DN 349 157 该途径中的所有SZGR 2.0基因
多德鼻咽癌 1821年 933 该途径中的所有SZGR 2.0基因
哈马凋亡通过Trail Up 584 356 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schaeffer前列腺开发48小时DN 428 306 该途径中的所有SZGR 2.0基因
APC和MBD2的Phesse目标 20 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因