基因页:NUDT12
概括?
基因 | 83594 |
象征 | NUDT12 |
同义词 | - |
描述 | NUDIX水解酶12 |
参考 | MIM:609232|HGNC:HGNC:18826|ENSEMBL:ENSG00000112874|HPRD:10123|Vega:Otthumg00000128739 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 5Q21.2 |
Pascal P值 | 0.025 |
主持人 | 额叶皮质BA9 伏隔核基底神经节 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS11120206 | CHR1 | 206610593 | NUDT12 | 83594 | 0.02 | 反式 | ||
RS2716734 | CHR2 | 39947720 | NUDT12 | 83594 | 0.13 | 反式 | ||
RS2716736 | CHR2 | 39947946 | NUDT12 | 83594 | 0.13 | 反式 | ||
RS9882137 | CHR3 | 29494146 | NUDT12 | 83594 | 0.13 | 反式 | ||
RS16894557 | CHR6 | 28999825 | NUDT12 | 83594 | 0.06 | 反式 | ||
RS10124277 | Chr9 | 8499294 | NUDT12 | 83594 | 0.06 | 反式 | ||
RS7047051 | Chr9 | 38020943 | NUDT12 | 83594 | 0.1 | 反式 | ||
RS12255258 | Chr10 | 106306927 | NUDT12 | 83594 | 0 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/NUDT12_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
ZC3H14 | 0.73 | 0.75 |
rad23b | 0.72 | 0.75 |
terf1 | 0.72 | 0.77 |
tial1 | 0.72 | 0.76 |
FBXO38 | 0.72 | 0.75 |
Ext1 | 0.72 | 0.76 |
COQ7 | 0.72 | 0.75 |
CDC7 | 0.72 | 0.79 |
Cul1 | 0.72 | 0.75 |
VPS45 | 0.72 | 0.74 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
MT-CO2 | -0.68 | -0.72 |
AF347015.31 | -0.66 | -0.71 |
mt-cyb | -0.66 | -0.70 |
AF347015.8 | -0.66 | -0.70 |
AF347015.33 | -0.65 | -0.68 |
AF347015.2 | -0.64 | -0.67 |
AF347015.26 | -0.64 | -0.67 |
AF347015.27 | -0.63 | -0.69 |
AF347015.15 | -0.63 | -0.68 |
AF347015.21 | -0.62 | -0.68 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Kegg Nicotinate和Nicotinamide代谢 | 24 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
kegg过氧化物酶体 | 78 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
周的炎症反应FIMA DN | 284 | 156 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
EWSR1 FLII融合的Kinsey目标 | 1278 | 748 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
哈马凋亡通过Trail Up | 584 | 356 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
darwiche乳头状瘤进度风险 | 74 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Krige对Tosedostat 6小时DN的响应 | 911 | 527 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Krige对Tosedostat 24小时DN的反应 | 1011 | 592 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bruins通过TP53组A的UVC响应 | 898 | 516 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ewsr1 fli1融合DN的TORCHIA目标 | 321 | 200 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
wakabayashi脂肪生成PPARG RXRA绑定8D | 882 | 506 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rattenbacher由Celf1绑定 | 467 | 251 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |