基因页面:CASP3
总结吗?
GeneID | 836年 |
象征 | CASP3 |
同义词 | CPP32 | CPP32B |本来 |
描述 | 半胱天冬酶3 |
参考 | MIM: 600636|HGNC: HGNC: 1504|运用:ENSG00000164305|HPRD: 02799|织女:OTTHUMG00000133681 |
基因型 | 蛋白质编码 |
地图上的位置 | 4 q34 |
帕斯卡假定值 | 0.101 |
夏洛克假定值 | 0.107 |
胎儿β | 2.137 |
eGene | 迈尔斯的顺式和反式 |
基因数据来源
基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
DMG: Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括4641个不同甲基化探针对应2929个独特的基因之间的精神分裂症患者(n = 24)和控制(n = 24)。 | 1 |
PMID: cooccur | 高通量文献检索 | 系统搜索PubMed的基因共病SCZ关键词。总共有3027个基因包括在内。 | |
文学 | 高通量文献检索 | 与精神分裂症Co-occurance关键词:精神分裂症、精神分裂,精神分裂症患者,神经 | 点击显示详细信息 |
GO_Annotation | neuro-related关键字映射到基因本体论注释 | 支安打与neuro-related关键词:1 | |
网络 | 最短路径距离核心基因在人类蛋白质相互作用网络 | 贡献在PPI网络最短路径:0.3923 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
cg14471096 | 4 | 185570637 | CCDC111; CASP3 | 1.58的军医 | -0.389 | 0.032 | DMG: Wockner_2014 |
eQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
rs16955618 | chr15 | 29937543 | CASP3 | 836年 | 0.02 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
![不可用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/CASP3_DE_GTEx.png)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
前10名中的基因 | ||
基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
SEPT2 | 0.75 | 0.70 |
ITGA6 | 0.75 | 0.69 |
CDC14A | 0.74 | 0.71 |
HSDL2 | 0.74 | 0.70 |
SNX5 | 0.73 | 0.72 |
SUCLG2 | 0.72 | 0.73 |
PPAP2B | 0.72 | 0.76 |
MSI2 | 0.72 | 0.66 |
PSAT1 | 0.72 | 0.77 |
PLOD2 | 0.71 | 0.69 |
十大负面中的基因 | ||
基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
RTN4RL1 | -0.37 | -0.32 |
LRFN2 | -0.36 | -0.32 |
MPPED1 | -0.35 | -0.31 |
ARHGAP20 | -0.35 | -0.28 |
SLC26A4 | -0.34 | -0.34 |
RASGEF1C | -0.34 | -0.29 |
AC093307.1 | -0.34 | -0.28 |
MYT1L | -0.34 | -0.27 |
CECR6 | -0.34 | -0.29 |
MEF2C | -0.34 | -0.30 |
第三部分。基因本体论注释
分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0005515 | 蛋白结合 | 新闻学会 | 9736630 | |
去:0004861 | 细胞周期蛋白依赖性蛋白激酶抑制剂的活动 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0004197 | cysteine-type肽链内切酶活性 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0004197 | cysteine-type肽链内切酶活性 | 助教 | 10942389 | |
去:0008233 | 肽酶的活动 | 艾达 | 9353287 | |
生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
去:0051402 | 神经元凋亡 | 国际能源机构 | 神经元,轴突、树突(术语层面:7) | - - - - - - |
去:0001836 | 从线粒体细胞色素c的释放 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0001782 | B细胞内稳态 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0006309 | DNA碎片在细胞凋亡 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0030264 | 核分裂时细胞凋亡 | 小鬼 | 11350920 | |
去:0008625 | 通过死亡域受体诱导细胞凋亡 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0006508 | 蛋白水解作用 | 艾达 | 12888622 | |
去:0006508 | 蛋白水解作用 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0006917 | 诱导细胞凋亡 | 助教 | 7983002 | |
去:0008631 | 氧化应激诱导细胞凋亡 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0009611 | 应对受伤 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0007507 | 心发展 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0007605 | 感官知觉的声音 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0009411 | 应对紫外线 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0006915 | 细胞凋亡 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0043066 | 负调控细胞凋亡 | IGI | 9353287 | |
去:0030216 | 角化细胞分化 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0030889 | 负调节B细胞增殖 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0043029 | T细胞内稳态 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0045165 | 细胞命运的承诺 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0045736 | 负调控细胞周期蛋白依赖性蛋白激酶活性 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0046007 | 负调节激活T细胞增殖 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
去:0005829 | 胞质 | 经验值 | 8976194|9624143|10490026 |10748026|10823823 |11106668|11313965 |11500511|11689006 |16983089 |
|
去:0005829 | 胞质 | 艾达 | 17823127 | |
去:0005634 | 核 | 艾达 | 18029348 | |
去:0005654 | 核浆 | 经验值 | 9108473 | |
去:0005730 | 核仁 | 艾达 | 18029348 | |
去:0005737 | 细胞质 | 艾达 | 18029348 | |
去:0005737 | 细胞质 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0005739 | 线粒体 | 艾达 | 18029348 | |
去:0005886 | 等离子体膜 | 经验值 | 11076937|16286477 |
第四部分,注释蛋白质间交互作用
扶少团团员 | 别名B | 官方全名B | 实验 | 源 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|---|
基于“增大化现实”技术 | AIS | DHTR | HUMARA | KD | NR3C4 | SBMA | SMAX1 |解冻 | 雄性激素受体 | 雄激素受体与半胱天冬酶3。这种交互是仿照人类雄激素受体之间的相互作用和半胱天冬酶3从一个未指明的物种。 | 绑定 | 9535906 |
ATN1 | B37 | D12S755E | DRPLA |点头 | atrophin 1 | Atrophin-1与半胱天冬酶3。这种交互是仿照人类atrophin-1证明之间的交互和半胱天冬酶3从一个未指明的物种。 | 绑定 | 9535906 |
ATXN3 | AT3 | ATX3 |乔斯| MJD | MJD1 | SCA3 | ataxin 3 | Ataxin-3与半胱天冬酶3。这种交互是仿照人类ataxin-3证明之间的交互和半胱天冬酶3从一个未指明的物种。 | 绑定 | 9535906 |
BCL2 | bcl - 2 | b细胞慢性淋巴细胞白血病/淋巴瘤2 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 11948397 |
报价 | FP497 | MGC15319 | MGC42355 | BH3交互领域死亡受体激动剂 | 生化活动 | BioGRID | 11399776 |
BIRC2 | API1 | HIAP2 | Hiap-2 | MIHB | RNF48 | cIAP1 | baculoviral IAP repeat-containing 2 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 9384571 |
BIRC3 | AIP1 | API2 | CIAP2 | HAIP1 | HIAP1 | MALT2 | MIHC | RNF49 | baculoviral IAP repeat-containing 3 | 对Casp3 cIAP2展品E3泛素连接酶的活动。 | 绑定 | 10862606 |
BIRC3 | AIP1 | API2 | CIAP2 | HAIP1 | HIAP1 | MALT2 | MIHC | RNF49 | baculoviral IAP repeat-containing 3 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 9384571 |
BIRC5 | API4 | EPR-1 | baculoviral IAP repeat-containing 5 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 9850056 |
BIRC6 | 布鲁斯APOLLON | | FLJ13726 | FLJ13786 | KIAA1289 | baculoviral IAP repeat-containing 6 | 布鲁斯与Casp-3交互。这种交互是仿照人类Casp-3演示鼠标布鲁斯和之间的相互作用。 | 绑定 | 15200957 |
BIRC7 | KIAP |推荐| ML-IAP | MLIAP | RNF50 | baculoviral IAP repeat-containing 7 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 11024045 |
BLM | BS | MGC126616 | MGC131618 | MGC131620 | RECQ2 | RECQL2 | RECQL3 | 布鲁姆综合症 | 生化活动 | BioGRID | 11470874 |
BMX | ETK | PSCTK2 | PSCTK3 | BMX non-receptor酪氨酸激酶 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 11278797 |
CASP10 | ALPS2 | FLICE2 | MCH4 | 半胱天冬酶10,apoptosis-related半胱氨酸肽酶 | 生化活动 | BioGRID | 8962078 |
CASP2 | CASP-2 | ICH-1L | ICH-1L / 1 s | ICH1 | NEDD2 | 半胱天冬酶2,apoptosis-related半胱氨酸肽酶 | 生化活动 | BioGRID | 11399776 |
CASP3 | CPP32 | CPP32B |本来 | 半胱天冬酶3 apoptosis-related半胱氨酸肽酶 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 11257232 |
CASP6 | MCH2 | 半胱天冬酶6 apoptosis-related半胱氨酸肽酶 | 生化活动 | BioGRID | 8900201 |
CASP8 | ALPS2B | CAP4 | FLICE | FLJ17672 | |马赫MCH5 | MGC78473 | 半胱天冬酶8日apoptosis-related半胱氨酸肽酶 | 生化活动 | BioGRID | 8962078|11832478 |
CASP9 | APAF-3 | APAF3 | CASPASE-9c | ICE-LAP6 | MCH6 | 半胱天冬酶9日apoptosis-related半胱氨酸肽酶 | - - - - - - | HPRD | 11230124 |
CDC2L2 | CDC2L3 | CDK11-p110 | CDK11-p46 | CDK11-p58 | MGC131975 | PITSLRE | p58GTA | 细胞分裂周期2 2 (PITSLRE蛋白质) | - - - - - - | HPRD | 9632733 |
CFLAR | 现金| CASP8AP1 | CLARP |卡斯珀火焰| | FLAME-1 | FLAME1 | |翻转I-FLICE | MRIT | c-FLIP | c-FLIPL | c-FLIPR | c-FLIPS | CASP8 FADD-like凋亡调节器 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 9208847 |
CFLAR | 现金| CASP8AP1 | CLARP |卡斯珀火焰| | FLAME-1 | FLAME1 | |翻转I-FLICE | MRIT | c-FLIP | c-FLIPL | c-FLIPR | c-FLIPS | CASP8 FADD-like凋亡调节器 | MRIT-beta-1与阎罗王。这种交互是模仿了人类MRIT-beta-1和阎罗王之间的交互从一个未指明的物种。 | 绑定 | 9326610 |
CFLAR | 现金| CASP8AP1 | CLARP |卡斯珀火焰| | FLAME-1 | FLAME1 | |翻转I-FLICE | MRIT | c-FLIP | c-FLIPL | c-FLIPR | c-FLIPS | CASP8 FADD-like凋亡调节器 | MRIT-alpha-1与阎罗王。这种交互是模仿了人类MRIT-alpha-1和阎罗王之间的交互从一个未指明的物种。 | 绑定 | 9326610 |
CTNNB1 | CTNNB | DKFZp686D02253 | FLJ25606 | FLJ37923 | β连环蛋白(cadherin-associated蛋白质),88 kda | - - - - - - | HPRD | 9348292 |
CTTN | EMS1 | FLJ34459 | cortactin | 生化活动 | BioGRID | 11689006 |
DBNL | 转化| HIP-55 | SH3P7 | drebrin-like | 生化活动 | BioGRID | 11689006 |
DCC | CRC18 | CRCR1 | 删除在结直肠癌 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 11248093 |
DCTN1 | dap - 150 | dp - 150 | HMN7B | P135 | dynactin 1 (p150、粘同族体果蝇) | - - - - - - | HPRD | 11425872 |
DEDD | CASP8IP1 | DEDD1 |的| FLDED1 | KE05 | 死亡效应域包含 | - - - - - - | HPRD | 12235123 |
DFFA | DFF-45 | DFF1 | ICAD | DNA分裂因素,45 kda,α多肽 | - - - - - - | HPRD | 11752060 |
EIF4B | EIF-4B | PRO1843 | 真核翻译起始因子4 b | - - - - - - | HPRD | 11274152 |
GORASP1 | FLJ23443 | GOLPH5 | GRASP65 | MGC118894 | MGC118897 | P65 | 高尔基重组的蛋白质堆积65 kda | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 11815631 |
HCLS1 | CTTNL | HS1 | 造血特异性林恩基质1 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 11689006|11988074 |
HSPD1 | CPN60 | GROEL | HSP60 | HSP65 | HuCHA60 | SPG13 | 60 kda热休克蛋白1 (chaperonin) | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 10205158|10205159 |
HSPE1 | CPN10 | gro | HSP10 | 10 kda热休克蛋白1 (chaperonin 10) | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 10205158 |
计画 | 高清| IT15 | 杭丁顿蛋白 | 杭丁顿蛋白与半胱天冬酶3。这种交互建模在展示人类杭丁顿蛋白之间的相互作用和半胱天冬酶3从一个未指明的物种。 | 绑定 | 9535906 |
KCNIP3 | CSEN | |梦KCHIP3 | MGC18289 | calsenilin Kv通道相互作用蛋白质3日 | - - - - - - | HPRD | 11278424 |
LMNB1 | ADLD | LMN | LMN2 | LMNB | MGC111419 | 核纤层蛋白B1 | - - - - - - | HPRD | 11901153 |
MAP3K14 | FTDCR1B |商品| HSNIK |尼克 | 增殖蛋白激酶激酶激酶14 | 亲和力Capture-Western | BioGRID | 11002417 |
MCL1 | BCL2L3 | |吃MCL1L | mcl1 | MGC104264 | MGC1839 | TM | 髓细胞白血病序列1 (BCL2-related) | 生化活动 | BioGRID | 15637055 |
NDUFS1 | ci - 75 kd | MGC26839 | PRO1304 | NADH脱氢酶(辅酶Q) Fe-S蛋白质75 kda (NADH-coenzyme Q还原酶) | NDUFS1与caspase-3交互。这种交互是仿照人类NDUSF1之间的交互和caspase-3从一个未指明的来源。 | 绑定 | 15186778 |
NEO1 | DKFZp547A066 | DKFZp547B146 | HsT17534 | | neogenin同族体1(鸡) | Neogenin与半胱天冬酶3。这种交互是仿照人类Neogenin证明之间的交互和半胱天冬酶3从一个未指明的物种。 | 绑定 | 15258591 |
NFE2L2 | NRF2 | 核转录因子(erythroid-derived 2)——2 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 10510468 |
PARG | PARG99 | 保利(ADP-ribose) glycohydrolase | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 11053413 |
PARP1 | ADPRT | ADPRT1 | PARP | PARP-1 | PPOL | pADPRT-1 | 保利(ADP-ribose)聚合酶1 | PARP与Caspase-3交互。这种交互是仿照人类PARP证明之间的交互和caspase-3来源不详。 | 绑定 | 15186778 |
PDE10A | FLJ11894 | FLJ25677 | HSPDE10A | 磷酸二酯酶10 | - - - - - - | HPRD | 11602184 |
PICALM | 冷静| CLTH |腿上 | 磷脂酰肌醇结合网格蛋白组装蛋白质 | - - - - - - | HPRD | 10926122 |
PLEKHO1 | CKIP-1 | OC120 | pleckstrin同源域包含、家庭成员阿1 | CKIP-1 CASP3在裂解细胞凋亡的起始。 | 绑定 | 15706351 |
PPP3CA | CALN | CALNA | CALNA1 | CCN1 | CNA1 | PPP2B | 蛋白磷酸酶3(原2 b),催化亚基、α同种型 | - - - - - - | HPRD | 11478781 |
PSEN1 | AD3粉|时尚| PS1 | S182 | presenilin 1 | PS1与半胱天冬酶3。这种交互是模仿了人类之间的交互PS1和鼠标半胱天冬酶3。 | 绑定 | 10069390 |
RB1 | OSRC | RB | p105-Rb |复审委员会| pp110 | 成视网膜细胞瘤1 | CASP3 (caspase-3)劈开RB-1 (hRB)死亡,DSID共识网站产生p100, 2、p61 p48形式。 | 绑定 | 15735701 |
SARS2 | 非典FLJ20450 | | SARSM | ser | SYS | SerRSmt | mtSerRS | seryl-tRNA合成酶2,线粒体 | - - - - - - | HPRD | 11331419 |
背景下 | KIAA0204 | LOSK | MGC133067 | STK2 | bA16H23.1 | se20-9 | STE20-like激酶(酵母) | - - - - - - | HPRD | 10611247 |
SREBF2 | SREBP2 | bHLHd2 | 固醇调节元件结合转录因子2 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 8605870 |
SRP72 | - - - - - - | 信号识别颗粒72 kda | - - - - - - | HPRD | 9857079 |
TGM2 | G-ALPHA-h | GNAH | TG2 | TGC | 转谷氨酰胺酶2 (C多肽,protein-glutamine-gamma-glutamyltransferase) | - - - - - - | HPRD | 10556977 |
TNS4 | CTEN | FLJ14950 | PP14434 | tensin 4 | Caspase-3互动以及cten劈开。 | 绑定 | 15806167 |
TRAF1 | EBI6 | MGC: 10353 | TNF receptor-associated因子1 | - - - - - - | HPRD | 11098060 |
TRAF3 | CAP-1 | CD40bp | CRAF1 | LAP1 | TNF receptor-associated因子3 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 11261798 |
USO1 | P115 |开发| VDP | USO1同族体,泡对接蛋白(酵母) | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 12438416 |
XIAP | API3 | BIRC4 | ILP1 |米哈| XLP2 | 抑制细胞凋亡的 | - - - - - - | HPRD | 9230442|11447297 |11927604 |
XIAP | API3 | BIRC4 | ILP1 |米哈| XLP2 | 抑制细胞凋亡的 | XIAP与Casp-3交互。 | 绑定 | 15200957 |
XIAP | API3 | BIRC4 | ILP1 |米哈| XLP2 | 抑制细胞凋亡的 | 亲和力Capture-Western Co-crystal结构 在体外 在活的有机体内 重新组成复杂 |
BioGRID | 9230442|9384571 |11257232|11447297 |11927604 |
XIAP | API3 | BIRC4 | ILP1 |米哈| XLP2 | 抑制细胞凋亡的 | XIAP Caspase-3交互。 | 绑定 | 15650747 |
部分诉通路注释
路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
---|---|---|---|
KEGG MAPK信号通路 | 267年 | 205年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
KEGG P53信号通路 | 69年 | 45 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
KEGG细胞凋亡 | 88年 | 62年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
KEGG自然杀手细胞介导的细胞毒性 | 137年 | 92年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
KEGG老年痴呆症病 | 169年 | 110年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
KEGG帕金森氏病的疾病 | 133年 | 78年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
KEGG肌萎缩性脊髓侧索硬化肌萎缩性侧索硬化症 | 53 | 43 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
KEGG亨廷顿疾病 | 185年 | 109年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
KEGG上皮细胞信号在幽门螺杆菌感染 | 68年 | 44 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
KEGG通路在癌症 | 328年 | 259年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
KEGG结肠直肠癌 | 62年 | 47 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
KEGG病毒性心肌炎 | 73年 | 58 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BIOCARTA DNAFRAGMENT通路 | 10 | 6 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BIOCARTA化学途径 | 22 | 15 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BIOCARTA BCELLSURVIVAL通路 | 16 | 10 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BIOCARTA半胱天冬酶通路 | 23 | 15 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BIOCARTA D4GDI通路 | 13 | 8 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BIOCARTA FAS通路 | 30. | 22 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BIOCARTA HIVNEF通路 | 58 | 43 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BIOCARTA死亡途径 | 33 | 24 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BIOCARTA线粒体途径 | 21 | 15 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BIOCARTA HSP27通路 | 15 | 11 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BIOCARTA TNFR1通路 | 29日 | 21 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
圣肿瘤坏死因子通路 | 29日 | 20. | 所有SZGR 2.0基因通路 |
SA半胱天冬酶级联 | 19 | 13 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
圣颗粒细胞的生存途径 | 27 | 23 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
SA FAS信号 | 9 | 5 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
圣FAS信号通路 | 65年 | 54 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
PID LYSOPHOSPHOLIPID通路 | 66年 | 53 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
PID NFAT TFPATHWAY | 47 | 39 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
PID FAS通路 | 38 | 29日 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
PID NFAT 3通路 | 54 | 47 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
PID AJDISS 2通道 | 48 | 38 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
PID我正常途径关系 | 69年 | 51 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
PID HIV NEF通路 | 35 | 26 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
PID半胱天冬酶通路 | 52 | 39 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
PID SYNDECAN 2通道 | 33 | 27 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
REACTOME凋亡细胞蛋白质的乳沟 | 40 | 26 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
REACTOME信号通过神经生长因子 | 217年 | 167年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
REACTOME信号的河马 | 22 | 15 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
REACTOME凋亡诱导DNA碎片 | 13 | 10 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
REACTOME半胱天冬酶介导的细胞骨架蛋白的乳沟 | 13 | 11 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
REACTOME凋亡细胞粘附蛋白的乳沟 | 12 | 6 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
REACTOME调控细胞凋亡 | 58 | 34 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
REACTOME细胞死亡信号通过NRAGE NRIF和纳德 | 60 | 43 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
REACTOME我正常受体介导信号关系 | 81年 | 61年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
REACTOME DCC在调节细胞凋亡的作用 | 10 | 5 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
REACTOME细胞凋亡 | 148年 | 94年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
REACTOME固有细胞凋亡途径 | 30. | 21 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
REACTOME凋亡执行阶段 | 54 | 37 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
迪亚兹慢性MEYLOGENOUS白血病 | 1382年 | 904年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
GARGALOVIC应对氧化磷脂蓝色 | 136年 | 80年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
ODONNELL TFRC目标了 | 456年 | 228年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
周炎症反应费马 | 544年 | 308年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
格雷厄姆CML静止和正常的静止 | 87年 | 45 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
KOKKINAKIS蛋氨酸剥夺48小时 | 128年 | 95年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
KOKKINAKIS蛋氨酸不足96小时 | 117年 | 84年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
CHIARADONNA肿瘤转化喀斯特CDC25 | 58 | 39 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BERENJENO通过RHOA转换 | 536年 | 340年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
标志着HDAC目标了 | 23 | 15 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
滑落紫外线反应通过ERCC3 XPCS | 28 | 16 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
贝克HEMATOPOESIS STAT1的目标 | 10 | 9 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
GALLUZZI PERMEABILIZE线粒体 | 43 | 31日 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
通过ERCC3滑落紫外线反应 | 309年 | 199年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
JAZAG TGFB1信号了 | 108年 | 69年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
PUJANA BRCA1 PCC网络 | 1652年 | 1023年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
PUJANA ATM PCC网络 | 1442年 | 892年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
通过ELK3严重缺氧 | 209年 | 139年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
通过ELK3严重缺氧,HIF1A DN | 103年 | 71年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
DN NUYTTEN NIPP1目标 | 848年 | 527年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
GOTZMANN上皮间充质转变DN | 206年 | 136年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BENPORATH ES 1 | 379年 | 235年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BENPORATH自行车基因 | 648年 | 385年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
科利斯PRKDC监管机构 | 15 | 10 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
RADAEVA IFNA1反应 | 52 | 40 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
TENEDINI巨核细胞标记 | 66年 | 48 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
桑塞姆APC DN的目标 | 366年 | 238年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
亚伯拉罕ALPC VS多发性骨髓瘤DN | 19 | 14 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
DEBIASI由呼肠孤病毒感染细胞凋亡 | 314年 | 201年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
王顺铂的反应和XPC DN | 228年 | 146年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
阿尔茨海默病了布莱洛克的 | 1691年 | 1088年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
张增殖与静 | 51 | 41 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
外邦人紫外线高剂量DN | 312年 | 203年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
歌IE86巨细胞病毒蛋白质的目标 | 60 | 42 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
犹太人的紫外响应集群D1 | 18 | 13 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
萨莫拉NOS2 DN的目标 | 96年 | 71年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
CREIGHTON内分泌治疗抵抗5 | 482年 | 296年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
GAVIN FOXP3目标集群P3 | 160年 | 103年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
马森受E2F4如果 | 728年 | 415年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
拉贝风TGFB1 DN的目标 | 108年 | 64年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
陈HOXA5目标9小时 | 223年 | 132年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
气浆细胞瘤了 | 259年 | 185年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
GOLDRATH抗原反应 | 346年 | 192年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
LINDSTEDT树突状细胞成熟C | 69年 | 49 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
RUTELLA CSF2RB和IL4 | 338年 | 225年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
RUTELLA应对HGF | 418年 | 282年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
RUTELLA HGF VS CSF2RB和IL4 DN | 245年 | 150年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
常骑自行车的基因 | 148年 | 83年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
霍夫曼大变小前BII淋巴细胞 | 163年 | 102年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
谢弗IRF4多发性骨髓瘤的程序 | 36 | 25 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
SHAFFER IRF4目标骨髓瘤和成熟的B淋巴细胞 | 101年 | 76年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
谢弗IRF4目标B淋巴细胞浆细胞和成熟 | 67年 | 51 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
谢弗IRF4目标激活B淋巴细胞 | 81年 | 66年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
谢弗IRF4目标激活树突状细胞 | 65年 | 49 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
党由MYC DN | 253年 | 192年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
WHITFIELD细胞周期G2 | 182年 | 102年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
DN PILON KLF1目标 | 1972年 | 1213年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
约翰斯通PARVB目标2 DN | 336年 | 211年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
MIYAGAWA EWSR1 ETS的目标融合起来 | 259年 | 159年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
FEVR CTNNB1目标了 | 682年 | 433年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
GOBERT少突细胞分化了 | 570年 | 339年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
ABDELMOHSEN ELAVL4目标 | 16 | 13 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
RAO受SALL4同种型B | 517年 | 302年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
黄宗泽过敏原诱导TH2相关模块 | 151年 | 86年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
部分VI. microRNA注释
microrna的家庭 | 目标位置 | microrna的ID | microrna的seq | ||
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UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
let-7/98 | 153年 | 160年 | 1、m8 | hsa-let-7a大脑 | UGAGGUAGUAGGUUGUAUAGUU |
hsa-let-7b大脑 | UGAGGUAGUAGGUUGUGUGGUU | ||||
hsa-let-7c大脑 | UGAGGUAGUAGGUUGUAUGGUU | ||||
hsa-let-7d大脑 | AGAGGUAGUAGGUUGCAUAGU | ||||
hsa-let-7e大脑 | UGAGGUAGGAGGUUGUAUAGU | ||||
hsa-let-7f大脑 | UGAGGUAGUAGAUUGUAUAGUU | ||||
hsa - mir - 98大脑 | UGAGGUAGUAAGUUGUAUUGUU | ||||
hsa-let-7g深圳 | UGAGGUAGUAGUUUGUACAGU | ||||
hsa-let-7i大脑 | UGAGGUAGUAGUUUGUGCUGU | ||||
mir - 138 | 759年 | 765年 | 1 | hsa - mir - 138大脑 | AGCUGGUGUUGUGAAUC |
miR-30-5p | 1188年 | 1194年 | 1 | hsa-miR-30a-5p | UGUAAACAUCCUCGACUGGAAG |
hsa-miR-30c大脑 | UGUAAACAUCCUACACUCUCAGC | ||||
hsa-miR-30d深圳 | UGUAAACAUCCCCGACUGGAAG | ||||
hsa-miR-30b深圳 | UGUAAACAUCCUACACUCAGCU | ||||
hsa-miR-30e-5p | UGUAAACAUCCUUGACUGGA |