基因页:Zmiz2
概括?
基因 | 83637 |
象征 | Zmiz2 |
同义词 | net27 | trafip20 | zimp7 | hzimp7 |
描述 | 锌指含2个 |
参考 | MIM:611196|HGNC:HGNC:22229|ENSEMBL:ENSG00000122515|HPRD:13225|Vega:Otthumg00000155817 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 7p13 |
Pascal P值 | 9.019e-4 |
Sherlock P值 | 0.511 |
主持人 | 尾状基底神经节 梭子基底神经节 元 |
支持 | COMPOSITESET Darnell FMRP目标 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS4720478 | 7 | 44784259 | Zmiz2 | ENSG00000122515.10 | 5.067E-7 | 0 | -3921 | gtex_brain_putamen_basal |
RS799449 | 7 | 44784697 | Zmiz2 | ENSG00000122515.10 | 2.646E-7 | 0 | -3483 | gtex_brain_putamen_basal |
RS10243354 | 7 | 44784864 | Zmiz2 | ENSG00000122515.10 | 9.104e-7 | 0 | -3316 | gtex_brain_putamen_basal |
RS10227940 | 7 | 44784866 | Zmiz2 | ENSG00000122515.10 | 4.846E-7 | 0 | -3314 | gtex_brain_putamen_basal |
RS6962280 | 7 | 44788657 | Zmiz2 | ENSG00000122515.10 | 1.416E-8 | 0 | 477 | gtex_brain_putamen_basal |
RS799451 | 7 | 44790988 | Zmiz2 | ENSG00000122515.10 | 3.301E-7 | 0 | 2808 | gtex_brain_putamen_basal |
RS799452 | 7 | 44792541 | Zmiz2 | ENSG00000122515.10 | 2.646E-7 | 0 | 4361 | gtex_brain_putamen_basal |
RS4724319 | 7 | 44803286 | Zmiz2 | ENSG00000122515.10 | 1.108E-6 | 0 | 15106 | gtex_brain_putamen_basal |
RS1050327 | 7 | 44808017 | Zmiz2 | ENSG00000122515.10 | 2.286E-8 | 0 | 19837 | gtex_brain_putamen_basal |
RS1050331 | 7 | 44808091 | Zmiz2 | ENSG00000122515.10 | 2.097E-8 | 0 | 19911 | gtex_brain_putamen_basal |
RS1050338 | 7 | 44808223 | Zmiz2 | ENSG00000122515.10 | 5.194E-7 | 0 | 20043 | gtex_brain_putamen_basal |
RS1065646 | 7 | 44809273 | Zmiz2 | ENSG00000122515.10 | 4.208E-8 | 0 | 21093 | gtex_brain_putamen_basal |
RS1065647 | 7 | 44809276 | Zmiz2 | ENSG00000122515.10 | 2.59E-8 | 0 | 21096 | gtex_brain_putamen_basal |
RS12534879 | 7 | 44810166 | Zmiz2 | ENSG00000122515.10 | 3.855e-7 | 0 | 21986 | gtex_brain_putamen_basal |
RS9655458 | 7 | 44810985 | Zmiz2 | ENSG00000122515.10 | 3.008e-8 | 0 | 22805 | gtex_brain_putamen_basal |
RS10252662 | 7 | 44811223 | Zmiz2 | ENSG00000122515.10 | 3.448e-7 | 0 | 23043 | gtex_brain_putamen_basal |
RS13224222 | 7 | 44812338 | Zmiz2 | ENSG00000122515.10 | 3.426E-7 | 0 | 24158 | gtex_brain_putamen_basal |
RS12702087 | 7 | 44812607 | Zmiz2 | ENSG00000122515.10 | 3.287E-7 | 0 | 24427 | gtex_brain_putamen_basal |
RS35307410 | 7 | 44814228 | Zmiz2 | ENSG00000122515.10 | 3.644e-7 | 0 | 26048 | gtex_brain_putamen_basal |
RS4724320 | 7 | 44815334 | Zmiz2 | ENSG00000122515.10 | 3.695E-8 | 0 | 27154 | gtex_brain_putamen_basal |
RS7806283 | 7 | 44818703 | Zmiz2 | ENSG00000122515.10 | 1.174E-6 | 0 | 30523 | gtex_brain_putamen_basal |
RS10264096 | 7 | 44819444 | Zmiz2 | ENSG00000122515.10 | 1.751E-6 | 0 | 31264 | gtex_brain_putamen_basal |
RS10264405 | 7 | 44819494 | Zmiz2 | ENSG00000122515.10 | 1.769E-6 | 0 | 31314 | gtex_brain_putamen_basal |
RS200205267 | 7 | 44822730 | Zmiz2 | ENSG00000122515.10 | 1.857E-6 | 0 | 34550 | gtex_brain_putamen_basal |
RS7809515 | 7 | 44822731 | Zmiz2 | ENSG00000122515.10 | 6.285E-7 | 0 | 34551 | gtex_brain_putamen_basal |
RS13236827 | 7 | 44833065 | Zmiz2 | ENSG00000122515.10 | 1.651E-6 | 0 | 44885 | gtex_brain_putamen_basal |
RS10275962 | 7 | 44848740 | Zmiz2 | ENSG00000122515.10 | 9.45e-7 | 0 | 60560 | gtex_brain_putamen_basal |
RS13238404 | 7 | 44851411 | Zmiz2 | ENSG00000122515.10 | 4.399E-8 | 0 | 63231 | gtex_brain_putamen_basal |
RS12702091 | 7 | 44860763 | Zmiz2 | ENSG00000122515.10 | 5.558e-7 | 0 | 72583 | gtex_brain_putamen_basal |
RS10278679 | 7 | 44865064 | Zmiz2 | ENSG00000122515.10 | 1.069E-6 | 0 | 76884 | gtex_brain_putamen_basal |
RS13245012 | 7 | 44865719 | Zmiz2 | ENSG00000122515.10 | 1.067E-6 | 0 | 77539 | gtex_brain_putamen_basal |
RS2898 | 7 | 44866633 | Zmiz2 | ENSG00000122515.10 | 1.067E-6 | 0 | 78453 | gtex_brain_putamen_basal |
RS10267576 | 7 | 44870933 | Zmiz2 | ENSG00000122515.10 | 1.067E-6 | 0 | 82753 | gtex_brain_putamen_basal |
RS7789162 | 7 | 44872900 | Zmiz2 | ENSG00000122515.10 | 2.519E-8 | 0 | 84720 | gtex_brain_putamen_basal |
RS7805890 | 7 | 44872911 | Zmiz2 | ENSG00000122515.10 | 3.152E-8 | 0 | 84731 | gtex_brain_putamen_basal |
RS12155038 | 7 | 44872977 | Zmiz2 | ENSG00000122515.10 | 7.897E-7 | 0 | 84797 | gtex_brain_putamen_basal |
RS12536807 | 7 | 44878274 | Zmiz2 | ENSG00000122515.10 | 2.517E-6 | 0 | 90094 | gtex_brain_putamen_basal |
RS714543 | 7 | 44887076 | Zmiz2 | ENSG00000122515.10 | 1.067E-6 | 0 | 98896 | gtex_brain_putamen_basal |
RS757693 | 7 | 44888029 | Zmiz2 | ENSG00000122515.10 | 1.067E-6 | 0 | 99849 | gtex_brain_putamen_basal |
RS3757569 | 7 | 44889508 | Zmiz2 | ENSG00000122515.10 | 1.08E-6 | 0 | 101328 | gtex_brain_putamen_basal |
RS7783386 | 7 | 44893673 | Zmiz2 | ENSG00000122515.10 | 1.07E-6 | 0 | 105493 | gtex_brain_putamen_basal |
RS10951776 | 7 | 44897751 | Zmiz2 | ENSG00000122515.10 | 1.067E-6 | 0 | 109571 | gtex_brain_putamen_basal |
RS11762008 | 7 | 44903664 | Zmiz2 | ENSG00000122515.10 | 1.067E-6 | 0 | 115484 | gtex_brain_putamen_basal |
RS8840 | 7 | 44917040 | Zmiz2 | ENSG00000122515.10 | 1.067E-6 | 0 | 128860 | gtex_brain_putamen_basal |
RS1990053 | 7 | 44925896 | Zmiz2 | ENSG00000122515.10 | 1.067E-6 | 0 | 137716 | gtex_brain_putamen_basal |
RS2331174 | 7 | 44926827 | Zmiz2 | ENSG00000122515.10 | 1.306E-6 | 0 | 138647 | gtex_brain_putamen_basal |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/ZMIZ2_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
Zwint | 0.79 | 0.61 |
PTTG1 | 0.77 | 0.58 |
CCNB1 | 0.77 | 0.59 |
CDCA3 | 0.75 | 0.41 |
CDT1 | 0.75 | 0.49 |
TACC3 | 0.74 | 0.43 |
SPC24 | 0.74 | 0.49 |
CENPM | 0.74 | 0.45 |
Cenpa | 0.74 | 0.43 |
ube2c | 0.74 | 0.39 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AF347015.27 | -0.31 | -0.31 |
AF347015.2 | -0.31 | -0.29 |
AF347015.15 | -0.31 | -0.29 |
AF347015.8 | -0.30 | -0.29 |
MT-CO2 | -0.30 | -0.27 |
mt-cyb | -0.30 | -0.28 |
ABCG2 | -0.30 | -0.25 |
AF347015.26 | -0.30 | -0.30 |
AF347015.33 | -0.29 | -0.29 |
SLC6A12 | -0.29 | -0.29 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
PID AR TF途径 | 53 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bertucci髓质与导管乳腺癌 | 206 | 111 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
钟对偶氮替丁的反应和tsa | 183 | 119 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Ginestier乳腺癌Znf217扩增DN | 335 | 193 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Ginestier乳腺癌20Q13扩增DN | 180 | 101 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿霉素的Graessmann凋亡 | 1142 | 669 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Graessmann对MC和阿霉素的反应 | 612 | 367 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nuytten Nipp1靶向 | 769 | 437 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nuytten EZH2靶向 | 1037 | 673 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Creighton内分泌疗法抗性1 | 528 | 324 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Krieg缺氧不是通过KDM3A | 770 | 480 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Fortschegger PHF8靶向DN | 784 | 464 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
通过p38完成的phong TNF响应 | 227 | 151 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
phong tnf响应不是通过p38 | 337 | 236 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |