概括
基因 83637
象征 Zmiz2
同义词 net27 | trafip20 | zimp7 | hzimp7
描述 锌指含2个
参考 MIM:611196|HGNC:HGNC:22229|ENSEMBL:ENSG00000122515|HPRD:13225|Vega:Otthumg00000155817
基因类型 蛋白质编码
地图位置 7p13
Pascal P值 9.019e-4
Sherlock P值 0.511
主持人 尾状基底神经节
梭子基底神经节
支持 COMPOSITESET
Darnell FMRP目标

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS4720478 7 44784259 Zmiz2 ENSG00000122515.10 5.067E-7 0 -3921 gtex_brain_putamen_basal
RS799449 7 44784697 Zmiz2 ENSG00000122515.10 2.646E-7 0 -3483 gtex_brain_putamen_basal
RS10243354 7 44784864 Zmiz2 ENSG00000122515.10 9.104e-7 0 -3316 gtex_brain_putamen_basal
RS10227940 7 44784866 Zmiz2 ENSG00000122515.10 4.846E-7 0 -3314 gtex_brain_putamen_basal
RS6962280 7 44788657 Zmiz2 ENSG00000122515.10 1.416E-8 0 477 gtex_brain_putamen_basal
RS799451 7 44790988 Zmiz2 ENSG00000122515.10 3.301E-7 0 2808 gtex_brain_putamen_basal
RS799452 7 44792541 Zmiz2 ENSG00000122515.10 2.646E-7 0 4361 gtex_brain_putamen_basal
RS4724319 7 44803286 Zmiz2 ENSG00000122515.10 1.108E-6 0 15106 gtex_brain_putamen_basal
RS1050327 7 44808017 Zmiz2 ENSG00000122515.10 2.286E-8 0 19837 gtex_brain_putamen_basal
RS1050331 7 44808091 Zmiz2 ENSG00000122515.10 2.097E-8 0 19911 gtex_brain_putamen_basal
RS1050338 7 44808223 Zmiz2 ENSG00000122515.10 5.194E-7 0 20043 gtex_brain_putamen_basal
RS1065646 7 44809273 Zmiz2 ENSG00000122515.10 4.208E-8 0 21093 gtex_brain_putamen_basal
RS1065647 7 44809276 Zmiz2 ENSG00000122515.10 2.59E-8 0 21096 gtex_brain_putamen_basal
RS12534879 7 44810166 Zmiz2 ENSG00000122515.10 3.855e-7 0 21986 gtex_brain_putamen_basal
RS9655458 7 44810985 Zmiz2 ENSG00000122515.10 3.008e-8 0 22805 gtex_brain_putamen_basal
RS10252662 7 44811223 Zmiz2 ENSG00000122515.10 3.448e-7 0 23043 gtex_brain_putamen_basal
RS13224222 7 44812338 Zmiz2 ENSG00000122515.10 3.426E-7 0 24158 gtex_brain_putamen_basal
RS12702087 7 44812607 Zmiz2 ENSG00000122515.10 3.287E-7 0 24427 gtex_brain_putamen_basal
RS35307410 7 44814228 Zmiz2 ENSG00000122515.10 3.644e-7 0 26048 gtex_brain_putamen_basal
RS4724320 7 44815334 Zmiz2 ENSG00000122515.10 3.695E-8 0 27154 gtex_brain_putamen_basal
RS7806283 7 44818703 Zmiz2 ENSG00000122515.10 1.174E-6 0 30523 gtex_brain_putamen_basal
RS10264096 7 44819444 Zmiz2 ENSG00000122515.10 1.751E-6 0 31264 gtex_brain_putamen_basal
RS10264405 7 44819494 Zmiz2 ENSG00000122515.10 1.769E-6 0 31314 gtex_brain_putamen_basal
RS200205267 7 44822730 Zmiz2 ENSG00000122515.10 1.857E-6 0 34550 gtex_brain_putamen_basal
RS7809515 7 44822731 Zmiz2 ENSG00000122515.10 6.285E-7 0 34551 gtex_brain_putamen_basal
RS13236827 7 44833065 Zmiz2 ENSG00000122515.10 1.651E-6 0 44885 gtex_brain_putamen_basal
RS10275962 7 44848740 Zmiz2 ENSG00000122515.10 9.45e-7 0 60560 gtex_brain_putamen_basal
RS13238404 7 44851411 Zmiz2 ENSG00000122515.10 4.399E-8 0 63231 gtex_brain_putamen_basal
RS12702091 7 44860763 Zmiz2 ENSG00000122515.10 5.558e-7 0 72583 gtex_brain_putamen_basal
RS10278679 7 44865064 Zmiz2 ENSG00000122515.10 1.069E-6 0 76884 gtex_brain_putamen_basal
RS13245012 7 44865719 Zmiz2 ENSG00000122515.10 1.067E-6 0 77539 gtex_brain_putamen_basal
RS2898 7 44866633 Zmiz2 ENSG00000122515.10 1.067E-6 0 78453 gtex_brain_putamen_basal
RS10267576 7 44870933 Zmiz2 ENSG00000122515.10 1.067E-6 0 82753 gtex_brain_putamen_basal
RS7789162 7 44872900 Zmiz2 ENSG00000122515.10 2.519E-8 0 84720 gtex_brain_putamen_basal
RS7805890 7 44872911 Zmiz2 ENSG00000122515.10 3.152E-8 0 84731 gtex_brain_putamen_basal
RS12155038 7 44872977 Zmiz2 ENSG00000122515.10 7.897E-7 0 84797 gtex_brain_putamen_basal
RS12536807 7 44878274 Zmiz2 ENSG00000122515.10 2.517E-6 0 90094 gtex_brain_putamen_basal
RS714543 7 44887076 Zmiz2 ENSG00000122515.10 1.067E-6 0 98896 gtex_brain_putamen_basal
RS757693 7 44888029 Zmiz2 ENSG00000122515.10 1.067E-6 0 99849 gtex_brain_putamen_basal
RS3757569 7 44889508 Zmiz2 ENSG00000122515.10 1.08E-6 0 101328 gtex_brain_putamen_basal
RS7783386 7 44893673 Zmiz2 ENSG00000122515.10 1.07E-6 0 105493 gtex_brain_putamen_basal
RS10951776 7 44897751 Zmiz2 ENSG00000122515.10 1.067E-6 0 109571 gtex_brain_putamen_basal
RS11762008 7 44903664 Zmiz2 ENSG00000122515.10 1.067E-6 0 115484 gtex_brain_putamen_basal
RS8840 7 44917040 Zmiz2 ENSG00000122515.10 1.067E-6 0 128860 gtex_brain_putamen_basal
RS1990053 7 44925896 Zmiz2 ENSG00000122515.10 1.067E-6 0 137716 gtex_brain_putamen_basal
RS2331174 7 44926827 Zmiz2 ENSG00000122515.10 1.306E-6 0 138647 gtex_brain_putamen_basal

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
Zwint 0.79 0.61
PTTG1 0.77 0.58
CCNB1 0.77 0.59
CDCA3 0.75 0.41
CDT1 0.75 0.49
TACC3 0.74 0.43
SPC24 0.74 0.49
CENPM 0.74 0.45
Cenpa 0.74 0.43
ube2c 0.74 0.39
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.27 -0.31 -0.31
AF347015.2 -0.31 -0.29
AF347015.15 -0.31 -0.29
AF347015.8 -0.30 -0.29
MT-CO2 -0.30 -0.27
mt-cyb -0.30 -0.28
ABCG2 -0.30 -0.25
AF347015.26 -0.30 -0.30
AF347015.33 -0.29 -0.29
SLC6A12 -0.29 -0.29

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
PID AR TF途径 53 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bertucci髓质与导管乳腺癌 206 111 该途径中的所有SZGR 2.0基因
钟对偶氮替丁的反应和tsa 183 119 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ginestier乳腺癌Znf217扩增DN 335 193 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ginestier乳腺癌20Q13扩增DN 180 101 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿霉素的Graessmann凋亡 1142 669 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Graessmann对MC和阿霉素的反应 612 367 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten Nipp1靶向 769 437 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten EZH2靶向 1037 673 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性1 528 324 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krieg缺氧不是通过KDM3A 770 480 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Fortschegger PHF8靶向DN 784 464 该途径中的所有SZGR 2.0基因
通过p38完成的phong TNF响应 227 151 该途径中的所有SZGR 2.0基因
phong tnf响应不是通过p38 337 236 该途径中的所有SZGR 2.0基因