基因页面:SELO
总结吗?
GeneID | 83642年 |
象征 | SELO |
同义词 | - - - - - - |
描述 | 硒蛋白啊 |
参考 | MIM: 607917|运用:ENSG00000073169|HPRD: 07449|织女:OTTHUMG00000044645 |
基因型 | 蛋白质编码 |
地图上的位置 | 22 q13.33 |
帕斯卡假定值 | 0.076 |
夏洛克假定值 | 0.255 |
胎儿β | -0.198 |
DMG | 1(#研究) |
eGene | 小脑半球 小脑 迈尔斯的顺式和反式 |
基因数据来源
基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
DMG: Jaffe_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括2104探针/论文认定与深圳病人(n = 108)比136年控制在Bonferroni-adjusted P < 0.05。 | 1 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
cg27194081 | 22 | 50640274 | SELO | 1.13 e-8 | -0.008 | 4.75 e-6 | DMG: Jaffe_2016 |
eQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
rs16829545 | chr2 | 151977407 | SELO | 83642年 | 2.154 e-6 | 反式 | ||
rs3845734 | chr2 | 171125572 | SELO | 83642年 | 0.02 | 反式 | ||
rs7584986 | chr2 | 184111432 | SELO | 83642年 | 0.04 | 反式 | ||
rs17762315 | chr5 | 76807576 | SELO | 83642年 | 0.09 | 反式 | ||
rs1929780 | chr6 | 40757438 | SELO | 83642年 | 0.17 | 反式 | ||
rs7787830 | chr7 | 98797019 | SELO | 83642年 | 0.17 | 反式 | ||
rs7141486 | 0 | SELO | 83642年 | 0.14 | 反式 | |||
rs16955618 | chr15 | 29937543 | SELO | 83642年 | 9.334 e-11 | 反式 | ||
rs1041786 | chr21 | 22617710 | SELO | 83642年 | 0.03 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
![不可用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/SELO_DE_GTEx.png)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
部分诉通路注释
路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
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加里CD5目标了 | 473年 | 314年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
NIKOLSKY乳腺癌22个问题扩增子 | 17 | 15 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
ACEVEDO肝癌DN | 540年 | 340年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BOCHKIS FOXA2目标 | 425年 | 261年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
蒋介石肝癌子类扩散DN | 179年 | 97年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |