基因页：trappc9

概括？
基因 83696
象征 trappc9
同义词 IBP | ikbkbbp | mrt13 | nibp | t1 | trs120
描述 运输蛋白颗粒复合物9
参考 MIM：611966|HGNC：HGNC：30832|Ensembl：ENSG00000167632|HPRD：18136|Vega：Otthumg00000164187
基因类型 蛋白质编码
地图位置 8Q24.3
Pascal P值 0.022
Sherlock P值 0.991
胎儿beta -0.824
DMG 2（＃研究）
支持 G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-CONSESUS

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历：PGCNP 全基因组关联研究 GWAS
DMG：Montano_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括CPG与精神分裂症之间的172个复制关联。 3
DMG：Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 3
DNM：McCarthy_2014 整个外显子组测序分析 57个三重奏的整个外显子组测序，具有零星或家族性精神分裂症。
PMID：COOCCUR 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释

@DNM表

基因 染色体 位置 参考 alt 成绩单 AA更改 突变类型 筛 CG46 特征 学习
trappc9 CHR8 140922446 G A NM_001160372 P.R970Q 错过SNV C d 精神分裂症 DNM：McCarthy_2014

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p（dis） beta（dis） fdr（dis） 学习
CG16815625 8 141229477 trappc9 9.19e-5 0.011 0.119 DMG：Montano_2016
CG20071744 8 141057329 trappc9 4.726E-4 0.666 0.046 DMG：Wockner_2014
CG07144715 8 140991037 trappc9 5.411E-4 0.463 0.048 DMG：Wockner_2014


第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26后概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域没有共表达基因


V.途径注释

路径名 路径大小 ＃SZGR 2.0途径中的基因 信息
Davicioni分子臂与ERMS DN 182 111 该途径中的所有SZGR 2.0基因
乳腺癌腔与基础 380 215 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Scheidereit IKK相互作用蛋白 58 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
洛佩兹MBD目标 957 597 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nikolsky乳腺癌8Q23 Q24 Amplicon 157 87 该途径中的所有SZGR 2.0基因
H3K9ME3 DN的Acevedo肝癌 120 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boylan多发性骨髓瘤D簇DN 40 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shedden肺癌良好生存A12 317 177 该途径中的所有SZGR 2.0基因