基因页面:TRPT1
总结吗?
| GeneID | 83707年 |
| 象征 | TRPT1 |
| 同义词 | - - - - - - |
| 描述 | tRNA磷酸转移酶1 |
| 参考 | MIM: 610470|HGNC: HGNC: 20316|运用:ENSG00000149743|HPRD: 17479|织女:OTTHUMG00000167844 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 11 q13.1 |
| 帕斯卡假定值 | 0.013 |
| eGene | 前扣带皮层BA24 尾状基底神经节 额叶皮质BA9 下丘脑 伏隔核基底神经节 元 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS |
部分即遗传学和表观遗传学注释
eQTL注释
eQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs61761262 | 11 | 64000802 | TRPT1 | ENSG00000149743.9 | 1.4828 e-6 | 0.01 | -7460年 | gtex_brain_ba24 |
| rs372192580 | 11 | 64016078 | TRPT1 | ENSG00000149743.9 | 7.56931 e - | 0.01 | -22736年 | gtex_brain_ba24 |
| rs1806967 | 11 | 64078943 | TRPT1 | ENSG00000149743.9 | 1.87157 e-6 | 0.01 | -85601年 | gtex_brain_ba24 |
| rs4930698 | 11 | 64085063 | TRPT1 | ENSG00000149743.9 | 1.77259 e-6 | 0.01 | -91721年 | gtex_brain_ba24 |
| rs79423518 | 11 | 64105454 | TRPT1 | ENSG00000149743.9 | 1.70066 e-6 | 0.01 | -112112年 | gtex_brain_ba24 |
| rs4930323 | 11 | 64153749 | TRPT1 | ENSG00000149743.9 | 1.90641 e-6 | 0.01 | -160407年 | gtex_brain_ba24 |
| rs2083710 | 11 | 64168813 | TRPT1 | ENSG00000149743.9 | 5.41152 e - | 0.01 | -175471年 | gtex_brain_ba24 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
| 前10名中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| RFNG | 0.85 | 0.82 |
| CENPT | 0.84 | 0.87 |
| CDK10 | 0.84 | 0.84 |
| NCAPH2 | 0.84 | 0.85 |
| HDAC10 | 0.84 | 0.85 |
| RPS6KB2 | 0.84 | 0.83 |
| TRMT1 | 0.83 | 0.82 |
| FAM113A | 0.83 | 0.83 |
| rp3 - 402 g11.1 | 0.82 | 0.77 |
| ARRDC1 | 0.82 | 0.80 |
| 十大负面中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| MT-CYB | -0.60 | -0.60 |
| AF347015.27 | -0.60 | -0.60 |
| AF347015.8 | -0.59 | -0.60 |
| AF347015.15 | -0.59 | -0.59 |
| AF347015.33 | -0.58 | -0.57 |
| MT-CO2 | -0.58 | -0.57 |
| AF347015.31 | -0.58 | -0.57 |
| AF347015.26 | -0.57 | -0.60 |
| AF347015.2 | -0.57 | -0.57 |
| MT-ATP8 | -0.55 | -0.64 |
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 中村肿瘤区周边与中央DN | 634年 | 384年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 由阿霉素GRAESSMANN细胞凋亡 | 1142年 | 669年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DN NUYTTEN EZH2目标 | 1024年 | 594年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| GC PASQUALUCCI淋巴瘤的阶段 | 283年 | 177年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| ZWANG EGF持续DN | 61年 | 36 | 所有SZGR 2.0基因通路 |