基因页：ypel3
概括？
| 基因 | 83719 |
| 象征 | ypel3 |
| 同义词 | - |
| 描述 | yippee像3 |
| 参考 | MIM：609724|HGNC：HGNC：18327|Ensembl：ENSG0000000090238|HPRD：15683|Vega：Otthumg00000176853 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 16p11.2 |
| Pascal P值 | 1.761E-6 |
| Sherlock P值 | 0.102 |
| 胎儿β | -0.887 |
| 主持人 | 小脑半球 小脑 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| CNV：是的 | 拷贝数变异研究 | 手动策划 | |
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 | 1 |
| gsma_iie | 基因组扫描荟萃分析（欧洲官方样品） | PSR：0.01775 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG05417332 | 16 | 30104025 | ypel3; tbx6 | 7.11E-5 | -0.462 | 0.025 | DMG：Wockner_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| CCDC88C | 0.76 | 0.54 |
| CCDC96 | 0.75 | 0.63 |
| mppe1 | 0.74 | 0.65 |
| REM2 | 0.73 | 0.59 |
| AC021087.1 | 0.73 | 0.52 |
| FAM40B | 0.73 | 0.28 |
| RGS2 | 0.72 | 0.50 |
| rxrg | 0.71 | 0.11 |
| drd2 | 0.71 | 0.50 |
| PLCB2 | 0.71 | 0.52 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| AF347015.31 | -0.39 | -0.49 |
| AF347015.2 | -0.39 | -0.46 |
| AF347015.8 | -0.38 | -0.48 |
| MT-CO2 | -0.38 | -0.48 |
| AF347015.15 | -0.38 | -0.47 |
| AF347015.21 | -0.37 | -0.48 |
| AF347015.33 | -0.35 | -0.46 |
| AF347015.27 | -0.35 | -0.46 |
| mt-cyb | -0.35 | -0.45 |
| MT-ATP8 | -0.35 | -0.45 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 王攀登目标 | 269 | 146 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| EWSR1 FLII融合DN的Kinsey目标 | 329 | 219 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 多德鼻咽癌 | 1821年 | 933 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lindgren膀胱癌簇1 DN | 378 | 231 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Berenjeno由Rhoa DN转变 | 394 | 258 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Perez TP53目标 | 1174 | 695 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Hatada甲基化在肺癌中 | 390 | 236 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Ferreira Ewings肉瘤不稳定与稳定DN | 98 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 对顺铂的反应 | 22 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| HU基因毒素作用直接与间接24小时 | 55 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Bild MYC致癌签名 | 206 | 117 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Creighton内分泌疗法抗性5 | 482 | 296 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Iwanaga癌变由Kras Pten DN | 353 | 226 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Chang Core血清反应DN | 209 | 137 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 张TLX目标36hr | 221 | 150 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 张TLX目标60小时 | 293 | 203 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| YAO对孕酮簇0的时间反应0 | 76 | 54 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Hoelzel NF1靶向DN | 115 | 73 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Dutertre雌二醇反应6小时DN | 91 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BHAT ESR1通过AKT1 DN目标 | 82 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lee BMP2目标 | 745 | 475 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gobert少突胶质细胞分化DN | 1080 | 713 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zwang EGF间隔DN | 214 | 124 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-128 | 146 | 153 | 1A，M8 | HSA-MIR-128A | ucacagugaaccggucuuuu |
| HSA-MIR-128B | ucacagugaaccggucuuc | ||||
| mir-148/152 | 144 | 150 | M8 | HSA-MIR-148A | ucagugcacuacaacuuugu |
| HSA-MIR-152脑 | UCAGUGCAUGACACUUGGG | ||||
| HSA-MIR-148B | ucagugcaucacacaacuuugu | ||||
| mir-27 | 301 | 307 | 1a | HSA-MIR-27A脑 | uucacaguggcuaaguuccgc |
| HSA-MIR-27B脑 | uucacaguggcuaaguucugc | ||||
| HSA-MIR-27A脑 | uucacaguggcuaaguuccgc | ||||
| HSA-MIR-27B脑 | uucacaguggcuaaguucugc | ||||
| mir-28 | 118 | 124 | M8 | HSA-MIR-28脑 | Aaggagcucacagucuauugag |