基因页面:ATG10
总结吗?
| GeneID | 83734年 |
| 象征 | ATG10 |
| 同义词 | APG10 | APG10L | pp12616 |
| 描述 | 自噬相关10 |
| 参考 | MIM: 610800|HGNC: HGNC: 20315|HPRD: 16497| |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 5 q14.1 |
| 帕斯卡假定值 | 0.009 |
| 夏洛克假定值 | 0.291 |
| eGene | 前扣带皮层BA24 小脑半球 小脑 皮质 额叶皮质BA9 海马体 伏隔核基底神经节 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS |
部分即遗传学和表观遗传学注释
eQTL注释
eQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs74906189 | 5 | 81261923 | ATG10 | ENSG00000152348.11 | 1.07 e-6 | 0.02 | -5921年 | gtex_brain_ba24 |
| rs4391141 | 5 | 81263522 | ATG10 | ENSG00000152348.11 | 1.212 e-6 | 0.02 | -4322年 | gtex_brain_ba24 |
| rs111549985 | 5 | 81268070 | ATG10 | ENSG00000152348.11 | 1.387 e-6 | 0.02 | 226年 | gtex_brain_ba24 |
| rs73134709 | 5 | 81268499 | ATG10 | ENSG00000152348.11 | 1.401 e-6 | 0.02 | 655年 | gtex_brain_ba24 |
| rs34981833 | 5 | 81272732 | ATG10 | ENSG00000152348.11 | 1.568 e-6 | 0.02 | 4888年 | gtex_brain_ba24 |
| rs2406909 | 5 | 81276087 | ATG10 | ENSG00000152348.11 | 8.336 e - | 0.02 | 8243年 | gtex_brain_ba24 |
| rs2897554 | 5 | 81276241 | ATG10 | ENSG00000152348.11 | 8.353 e - | 0.02 | 8397年 | gtex_brain_ba24 |
| rs12108681 | 5 | 81278375 | ATG10 | ENSG00000152348.11 | 1.42 e-6 | 0.02 | 10531年 | gtex_brain_ba24 |
| rs145230108 | 5 | 81281364 | ATG10 | ENSG00000152348.11 | 1.914 e-6 | 0.02 | 13520年 | gtex_brain_ba24 |
| rs113046446 | 5 | 81296479 | ATG10 | ENSG00000152348.11 | 1.632 e-6 | 0.02 | 28635年 | gtex_brain_ba24 |
| rs6875409 | 5 | 81297077 | ATG10 | ENSG00000152348.11 | 1.636 e-6 | 0.02 | 29233年 | gtex_brain_ba24 |
| rs61024879 | 5 | 81301825 | ATG10 | ENSG00000152348.11 | 1.636 e-6 | 0.02 | 33981年 | gtex_brain_ba24 |
| rs2406910 | 5 | 81308719 | ATG10 | ENSG00000152348.11 | 8.353 e - | 0.02 | 40875年 | gtex_brain_ba24 |
| rs111733984 | 5 | 81310879 | ATG10 | ENSG00000152348.11 | 2.846 e-6 | 0.02 | 43035年 | gtex_brain_ba24 |
| rs2406911 | 5 | 81312256 | ATG10 | ENSG00000152348.11 | 2.243 e-6 | 0.02 | 44412年 | gtex_brain_ba24 |
| rs111907176 | 5 | 81312399 | ATG10 | ENSG00000152348.11 | 1.636 e-6 | 0.02 | 44555年 | gtex_brain_ba24 |
| rs17243791 | 5 | 81322547 | ATG10 | ENSG00000152348.11 | 1.232 e-6 | 0.02 | 54703年 | gtex_brain_ba24 |
| rs73134722 | 5 | 81326622 | ATG10 | ENSG00000152348.11 | 1.636 e-6 | 0.02 | 58778年 | gtex_brain_ba24 |
| rs7733122 | 5 | 81351443 | ATG10 | ENSG00000152348.11 | 1.636 e-6 | 0.02 | 83599年 | gtex_brain_ba24 |
| rs112413913 | 5 | 81359709 | ATG10 | ENSG00000152348.11 | 1.636 e-6 | 0.02 | 91865年 | gtex_brain_ba24 |
| rs5869104 | 5 | 81359771 | ATG10 | ENSG00000152348.11 | 1.636 e-6 | 0.02 | 91927年 | gtex_brain_ba24 |
| rs73134739 | 5 | 81370760 | ATG10 | ENSG00000152348.11 | 1.636 e-6 | 0.02 | 102916年 | gtex_brain_ba24 |
| rs12108833 | 5 | 81371755 | ATG10 | ENSG00000152348.11 | 1.636 e-6 | 0.02 | 103911年 | gtex_brain_ba24 |
| rs144580806 | 5 | 81375335 | ATG10 | ENSG00000152348.11 | 1.636 e-6 | 0.02 | 107491年 | gtex_brain_ba24 |
| rs111842222 | 5 | 81377257 | ATG10 | ENSG00000152348.11 | 1.636 e-6 | 0.02 | 109413年 | gtex_brain_ba24 |
| rs73134747 | 5 | 81378294 | ATG10 | ENSG00000152348.11 | 1.636 e-6 | 0.02 | 110450年 | gtex_brain_ba24 |
| rs2629744 | 5 | 81381997 | ATG10 | ENSG00000152348.11 | 1.507 e-6 | 0.02 | 114153年 | gtex_brain_ba24 |
| rs112355050 | 5 | 81386035 | ATG10 | ENSG00000152348.11 | 1.636 e-6 | 0.02 | 118191年 | gtex_brain_ba24 |
| rs324914 | 5 | 81389950 | ATG10 | ENSG00000152348.11 | 1.636 e-6 | 0.02 | 122106年 | gtex_brain_ba24 |
| rs324910 | 5 | 81400264 | ATG10 | ENSG00000152348.11 | 1.636 e-6 | 0.02 | 132420年 | gtex_brain_ba24 |
| rs57621982 | 5 | 81406770 | ATG10 | ENSG00000152348.11 | 1.636 e-6 | 0.02 | 138926年 | gtex_brain_ba24 |
| rs199607724 | 5 | 81422172 | ATG10 | ENSG00000152348.11 | 8.566 e - | 0.02 | 154328年 | gtex_brain_ba24 |
| rs139245895 | 5 | 81422885 | ATG10 | ENSG00000152348.11 | 1.227 e-6 | 0.02 | 155041年 | gtex_brain_ba24 |
| rs4293895 | 5 | 81425592 | ATG10 | ENSG00000152348.11 | 1.554 e-6 | 0.02 | 157748年 | gtex_brain_ba24 |
| rs73136777 | 5 | 81434479 | ATG10 | ENSG00000152348.11 | 1.636 e-6 | 0.02 | 166635年 | gtex_brain_ba24 |
| rs73136782 | 5 | 81443520 | ATG10 | ENSG00000152348.11 | 1.636 e-6 | 0.02 | 175676年 | gtex_brain_ba24 |
| rs1428940 | 5 | 81447995 | ATG10 | ENSG00000152348.11 | 1.648 e-6 | 0.02 | 180151年 | gtex_brain_ba24 |
| rs60733727 | 5 | 81448283 | ATG10 | ENSG00000152348.11 | 1.636 e-6 | 0.02 | 180439年 | gtex_brain_ba24 |
| rs2407064 | 5 | 81457358 | ATG10 | ENSG00000152348.11 | 3.777 e - | 0.02 | 189514年 | gtex_brain_ba24 |
| rs10068160 | 5 | 81466075 | ATG10 | ENSG00000152348.11 | 1.319 e-6 | 0.02 | 198231年 | gtex_brain_ba24 |
| rs4081859 | 5 | 81466669 | ATG10 | ENSG00000152348.11 | 1.319 e-6 | 0.02 | 198825年 | gtex_brain_ba24 |
| rs17245188 | 5 | 81469082 | ATG10 | ENSG00000152348.11 | 1.636 e-6 | 0.02 | 201238年 | gtex_brain_ba24 |
| rs6452447 | 5 | 81482522 | ATG10 | ENSG00000152348.11 | 1.636 e-6 | 0.02 | 214678年 | gtex_brain_ba24 |
| rs891159 | 5 | 81491087 | ATG10 | ENSG00000152348.11 | 1.321 e-6 | 0.02 | 223243年 | gtex_brain_ba24 |
| rs4703870 | 5 | 81492643 | ATG10 | ENSG00000152348.11 | 1.321 e-6 | 0.02 | 224799年 | gtex_brain_ba24 |
| rs79616997 | 5 | 81504600 | ATG10 | ENSG00000152348.11 | 1.319 e-6 | 0.02 | 236756年 | gtex_brain_ba24 |
| rs1543911 | 5 | 81504841 | ATG10 | ENSG00000152348.11 | 1.636 e-6 | 0.02 | 236997年 | gtex_brain_ba24 |
| rs2059891 | 5 | 81508792 | ATG10 | ENSG00000152348.11 | 1.326 e-6 | 0.02 | 240948年 | gtex_brain_ba24 |
| rs146817970 | 5 | 81512947 | ATG10 | ENSG00000152348.11 | 1.326 e-6 | 0.02 | 245103年 | gtex_brain_ba24 |
| rs6888977 | 5 | 81533735 | ATG10 | ENSG00000152348.11 | 1.319 e-6 | 0.02 | 265891年 | gtex_brain_ba24 |
| rs7707921 | 5 | 81538046 | ATG10 | ENSG00000152348.11 | 1.319 e-6 | 0.02 | 270202年 | gtex_brain_ba24 |
| rs6884232 | 5 | 81550043 | ATG10 | ENSG00000152348.11 | 1.319 e-6 | 0.02 | 282199年 | gtex_brain_ba24 |
| rs1019806 | 5 | 81551659 | ATG10 | ENSG00000152348.11 | 1.319 e-6 | 0.02 | 283815年 | gtex_brain_ba24 |
| rs4703879 | 5 | 81553815 | ATG10 | ENSG00000152348.11 | 1.319 e-6 | 0.02 | 285971年 | gtex_brain_ba24 |
| rs2407153 | 5 | 81555328 | ATG10 | ENSG00000152348.11 | 1.319 e-6 | 0.02 | 287484年 | gtex_brain_ba24 |
| rs749402 | 5 | 81561325 | ATG10 | ENSG00000152348.11 | 1.225 e-6 | 0.02 | 293481年 | gtex_brain_ba24 |
| rs749401 | 5 | 81561369 | ATG10 | ENSG00000152348.11 | 1.225 e-6 | 0.02 | 293525年 | gtex_brain_ba24 |
| rs73138787 | 5 | 81568934 | ATG10 | ENSG00000152348.11 | 7.302 e - | 0.02 | 301090年 | gtex_brain_ba24 |
| rs3738 | 5 | 81569293 | ATG10 | ENSG00000152348.11 | 6.294 e - | 0.02 | 301449年 | gtex_brain_ba24 |
| rs3739 | 5 | 81569311 | ATG10 | ENSG00000152348.11 | 6.303 e - | 0.02 | 301467年 | gtex_brain_ba24 |
| rs226203 | 5 | 81570394 | ATG10 | ENSG00000152348.11 | 3.639 e - | 0.02 | 302550年 | gtex_brain_ba24 |
| rs11346477 | 5 | 81571266 | ATG10 | ENSG00000152348.11 | 6.426 e - | 0.02 | 303422年 | gtex_brain_ba24 |
| rs226202 | 5 | 81571669 | ATG10 | ENSG00000152348.11 | 6.426 e - | 0.02 | 303825年 | gtex_brain_ba24 |
| rs226199 | 5 | 81572464 | ATG10 | ENSG00000152348.11 | 6.426 e - | 0.02 | 304620年 | gtex_brain_ba24 |
| rs226198 | 5 | 81573992 | ATG10 | ENSG00000152348.11 | 1.319 e-6 | 0.02 | 306148年 | gtex_brain_ba24 |
| rs6880209 | 5 | 81574182 | ATG10 | ENSG00000152348.11 | 6.426 e - | 0.02 | 306338年 | gtex_brain_ba24 |
| rs226197 | 5 | 81574925 | ATG10 | ENSG00000152348.11 | 6.426 e - | 0.02 | 307081年 | gtex_brain_ba24 |
| rs178931 | 5 | 81575601 | ATG10 | ENSG00000152348.11 | 6.426 e - | 0.02 | 307757年 | gtex_brain_ba24 |
| rs226196 | 5 | 81576965 | ATG10 | ENSG00000152348.11 | 6.426 e - | 0.02 | 309121年 | gtex_brain_ba24 |
| rs10607783 | 5 | 81579072 | ATG10 | ENSG00000152348.11 | 6.107 e - | 0.02 | 311228年 | gtex_brain_ba24 |
| rs226194 | 5 | 81585026 | ATG10 | ENSG00000152348.11 | 6.426 e - | 0.02 | 317182年 | gtex_brain_ba24 |
| rs862245 | 5 | 81585737 | ATG10 | ENSG00000152348.11 | 6.426 e - | 0.02 | 317893年 | gtex_brain_ba24 |
| rs862244 | 5 | 81586801 | ATG10 | ENSG00000152348.11 | 6.426 e - | 0.02 | 318957年 | gtex_brain_ba24 |
| rs862243 | 5 | 81586829 | ATG10 | ENSG00000152348.11 | 6.426 e - | 0.02 | 318985年 | gtex_brain_ba24 |
| rs862242 | 5 | 81587566 | ATG10 | ENSG00000152348.11 | 6.426 e - | 0.02 | 319722年 | gtex_brain_ba24 |
| rs862241 | 5 | 81588011 | ATG10 | ENSG00000152348.11 | 6.426 e - | 0.02 | 320167年 | gtex_brain_ba24 |
| rs6870335 | 5 | 81590070 | ATG10 | ENSG00000152348.11 | 6.342 e - | 0.02 | 322226年 | gtex_brain_ba24 |
| rs226206 | 5 | 81593019 | ATG10 | ENSG00000152348.11 | 6.228 e - | 0.02 | 325175年 | gtex_brain_ba24 |
| rs226205 | 5 | 81593654 | ATG10 | ENSG00000152348.11 | 1.313 e-6 | 0.02 | 325810年 | gtex_brain_ba24 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 王LMO4目标了 | 372年 | 227年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| GRAESSMANN血清剥夺了细胞凋亡 | 552年 | 347年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| GRAESSMANN MC和血清剥夺 | 211年 | 136年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 由阿霉素DN GRAESSMANN细胞凋亡 | 1781年 | 1082年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 乔治MIR192和MIR215的目标 | 893年 | 528年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 伊万诺娃早期造血祖 | 532年 | 309年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 崔TCF21目标2 DN | 830年 | 547年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 福斯特KDM1A目标了 | 266年 | 142年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| RAO受SALL4同种型B | 517年 | 302年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 水岛自噬体的形成 | 19 | 15 | 所有SZGR 2.0基因通路 |