基因页面:KLF16
总结吗?
| GeneID | 83855年 |
| 象征 | KLF16 |
| 同义词 | BTEB4 | DRRF | NSLP2 |
| 描述 | Kruppel-like因素16 |
| 参考 | MIM: 606139|HGNC: HGNC: 16857|运用:ENSG00000129911|HPRD: 12090|织女:OTTHUMG00000179994 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 19 p13.3 |
| 帕斯卡假定值 | 0.002 |
| 夏洛克假定值 | 0.502 |
| eGene | 迈尔斯的顺式和反式 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| GO_Annotation | neuro-related关键字映射到基因本体论注释 | 支安打与neuro-related关键词:1 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
eQTL注释
eQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs7526654 | chr1 | 238630958 | KLF16 | 83855年 | 0.17 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
第三部分。基因本体论注释
| 分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去:0003700 | 转录因子的活动 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0008270 | 锌离子结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0046872 | 金属离子结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0007212 | 多巴胺受体信号通路 | 国际能源机构 | 多巴胺(术语层面:8) | - - - - - - |
| 去:0006357 | 监管RNA聚合酶II启动子的转录 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0006350 | 转录 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0005622 | 细胞内的 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0005634 | 核 | 国际能源机构 | - - - - - - |
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| GINESTIER乳腺癌ZNF217放大DN | 335年 | 193年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 通过TP53棕熊短波紫外线反应B组 | 549年 | 316年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| ZWANG 3班是暂时性的EGF引起的 | 222年 | 159年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
部分VI. microRNA注释
| microrna的家庭 | 目标位置 | microrna的ID | microrna的seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| miR-125/351 | 501年 | 507年 | 1 | hsa - mir - 125 b大脑 | UCCCUGAGACCCUAACUUGUGA |
| hsa - mir - 125 a大脑 | UCCCUGAGACCCUUUAACCUGUG | ||||
| mir - 135 | 420年 | 426年 | 1 | hsa - mir - 135 a | UAUGGCUUUUUAUUCCUAUGUGA |
| hsa - mir - 135 b | UAUGGCUUUUCAUUCCUAUGUG | ||||
| hsa - mir - 135 a | UAUGGCUUUUUAUUCCUAUGUGA | ||||
| hsa - mir - 135 b | UAUGGCUUUUCAUUCCUAUGUG | ||||
| mir - 219 | 894年 | 901年 | 1、m8 | hsa - mir - 219大脑 | UGAUUGUCCAAACGCAAUUCU |