基因页：BCO2

概括？
基因 83875
象征 BCO2
同义词 B-Diox-II | BCDO2
描述 β-胡萝卜素氧合酶2
参考 MIM：611740|HGNC：HGNC：18503|ENSEMBL：ENSG00000197580|HPRD：12522|Vega：Otthumg00000167155
基因类型 蛋白质编码
地图位置 11q23.1
Pascal P值 0.588
胎儿β -0.669
DMG 1（＃研究）
主持人 前扣带回皮层BA24
尾状基底神经节
小脑半球
小脑
皮质
额叶皮质BA9
下丘脑
伏隔核基底神经节
梭子基底神经节
迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG：Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p（dis） beta（dis） fdr（dis） 学习
CG01015175 11 112045641 BCO2 5.938E-4 -0.54 0.05 DMG：Wockner_2014

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS2140736 CHR15 31159211 BCO2 83875 0.12 反式
RS2948491 Chrx 40180688 BCO2 83875 0.06 反式
RS200332020 11 112065737 BCO2 ENSG00000197580.7 1.494E-6 0.04 19547年 gtex_brain_ba24
RS199726061 11 112065742 BCO2 ENSG00000197580.7 1.494E-6 0.04 19552 gtex_brain_ba24
RS562156146 11 112065743 BCO2 ENSG00000197580.7 1.429E-6 0.04 19553 gtex_brain_ba24
RS11214138 11 112084061 BCO2 ENSG00000197580.7 1.714E-6 0.04 37871 gtex_brain_ba24
RS12283162 11 112057306 BCO2 ENSG00000197580.7 1.642E-6 0.02 11116 gtex_brain_putamen_basal
RS56475786 11 112058408 BCO2 ENSG00000197580.7 1.457E-6 0.02 12218 gtex_brain_putamen_basal
RS10891335 11 112059277 BCO2 ENSG00000197580.7 1.453E-6 0.02 13087 gtex_brain_putamen_basal
RS11214120 11 112059715 BCO2 ENSG00000197580.7 1.453E-6 0.02 13525 gtex_brain_putamen_basal
RS10891336 11 112061441 BCO2 ENSG00000197580.7 1.226E-6 0.02 15251 gtex_brain_putamen_basal
RS10891337 11 112063254 BCO2 ENSG00000197580.7 1.451E-6 0.02 17064 gtex_brain_putamen_basal
RS200332020 11 112065737 BCO2 ENSG00000197580.7 1.228E-6 0.02 19547年 gtex_brain_putamen_basal
RS199726061 11 112065742 BCO2 ENSG00000197580.7 2.77E-6 0.02 19552 gtex_brain_putamen_basal
RS562156146 11 112065743 BCO2 ENSG00000197580.7 2.002E-6 0.02 19553 gtex_brain_putamen_basal
RS11214127 11 112068593 BCO2 ENSG00000197580.7 1.374E-6 0.02 22403 gtex_brain_putamen_basal
RS11214128 11 112068758 BCO2 ENSG00000197580.7 1.45e-6 0.02 22568 gtex_brain_putamen_basal
RS10891339 11 112070174 BCO2 ENSG00000197580.7 1.425E-6 0.02 23984 gtex_brain_putamen_basal
RS11214134 11 112080424 BCO2 ENSG00000197580.7 1.281E-6 0.02 34234 gtex_brain_putamen_basal
RS11214135 11 112081208 BCO2 ENSG00000197580.7 1.272E-6 0.02 35018 gtex_brain_putamen_basal
RS11214138 11 112084061 BCO2 ENSG00000197580.7 1.546E-6 0.02 37871 gtex_brain_putamen_basal

第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0005506 铁离子结合 IEA -
GO：0016702 氧化还原酶活性，作用于单个供体，并掺入分子氧，掺入两个原子的氧气 艾达 11278918
GO：0016702 氧化还原酶活性，作用于单个供体，并掺入分子氧，掺入两个原子的氧气 IEA -
GO：0016491 氧化还原酶活性 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0016119 胡萝卜素代谢过程 艾达 11278918
去：0016119 胡萝卜素代谢过程 IEA -
GO：0042573 视黄酸代谢过程 nas 11278918
GO：0042574 视网膜代谢过程 nas 11278918
GO：0055114 还原氧化 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0005622 细胞内 我知道了 11278918

V.途径注释

路径名 路径大小 ＃szgr 2.0基因 信息
Sengupta鼻咽癌DN 349 157 该途径中的所有SZGR 2.0基因
多德鼻咽癌 1821年 933 该途径中的所有SZGR 2.0基因
lastowska神经母细胞瘤副本编号dn 800 473 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shepard BMYB Morpholino Up 205 126 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Col13a1 DN抑制Tuomisto肿瘤 17 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gavin Foxp3目标集群P3 160 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因
麦凯布（McCabe）由HOXC6绑定 469 239 该途径中的所有SZGR 2.0基因
McCabe Hoxc6靶向 10 8 该途径中的所有SZGR 2.0基因
McCabe Hoxc6靶向癌症 31 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多的正常组织与肝肿瘤DN相邻 354 216 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝癌DN 540 340 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mir34b和Mir34C的丰田目标 463 262 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FEVR CTNNB1靶向 682 433 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-182 565 571 1a HSA-MIR-182 uuuggcaaugguagaacucaca
mir-338 472 478 1a HSA-MIR-338脑 uccagauuuuuguuga
mir-96 565 571 1a HSA-MIR-96脑 uuuggcacuagcacauuuuugc