总结吗?
GeneID 83878年
象征 USHBP1
同义词 AIEBP | MCC2
描述 USH1蛋白质网络组件harmonin结合蛋白1
参考 MIM: 611810|HGNC: HGNC: 24058|运用:ENSG00000130307|HPRD: 18276|织女:OTTHUMG00000182730
基因型 蛋白质编码
地图上的位置 19 p13
帕斯卡假定值 0.434
胎儿β -0.431
eGene 迈尔斯的顺式和反式

基因数据来源
基因集名称 基因的方法设置 描述 信息
简历:GWASdb 全基因组关联研究 精神分裂症GWASdb记录
简历:PGCnp 全基因组关联研究 GWAS
PMID: cooccur 高通量文献检索 系统搜索PubMed的基因共病SCZ关键词。总共有3027个基因包括在内。
文学 高通量文献检索 与精神分裂症Co-occurance关键词:精神分裂症、神经 点击显示详细信息

部分即遗传学和表观遗传学注释

@eQTL注释

SNP ID 染色体 位置 eGene 基因Entrez ID pvalue qvalue TSS距离 eQTL类型
rs10994209 chr10 61877705 USHBP1 83878年 0.02 反式

第二部分。转录组注释

通用基因表达(GTEx)

不可用

基因表达在发展脉络(BrainCloud)

补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。

基因表达的时空变化(BrainSpan)

补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。

没有大脑中的基因区域


第四部分,注释蛋白质间交互作用

扶少团团员 别名B 官方全名B 实验 PubMed ID
ABLIM1 ABLIM | DKFZp781D0148 | FLJ14564 | KIAA0059 | LIMAB1 | LIMATIN | MGC1224 肌动蛋白绑定LIM蛋白1 2台混合动力 BioGRID 16189514
BET1 DKFZp781C0425 | HBET1 阻塞在运输1同族体(酵母) 亲和力Capture-Western
2台混合动力
BioGRID 16189514
C10orf10 德普|无花果 染色体10开放阅读框 2台混合动力 BioGRID 16189514
C1orf216 FLJ38984 染色体1 216年开放阅读框 2台混合动力 BioGRID 16189514
CCDC120 JM11 卷曲螺旋域包含120 2台混合动力 BioGRID 16189514
CCDC33 FLJ23168 | FLJ32855 | MGC34145 卷曲螺旋域包含33 2台混合动力 BioGRID 16189514
CCNK CPR4 | MGC9113 细胞周期蛋白K 2台混合动力 BioGRID 16189514
CEP63 FLJ13386 | MGC78416 centrosomal蛋白质63 kda 2台混合动力 BioGRID 16189514
COPS4 MGC10899 | MGC15160 COP9本构photomorphogenic同族体亚基4(拟南芥) 2台混合动力 BioGRID 16189514
DYDC1 DPY30D1 | FLJ43920 | bA36D19.5 DPY30域包含1 2台混合动力 BioGRID 16189514
EXOC7 2-5-3p | DKFZp686J04253 | EX070 | EXO70 | EXOC1 | Exo70p | FLJ40965 | FLJ46415 | YJL085W exocyst复杂组件7 2台混合动力 BioGRID 16189514
EXOC8 EXO84 | Exo84p | SEC84 exocyst复杂组件8 亲和力Capture-Western
2台混合动力
BioGRID 16189514
FAM107A DRR1 | FLJ30158 | FLJ45473 | TU3A 107年家庭序列相似性,成员 2台混合动力 BioGRID 16189514
FANCG 同性恋| XRCC9 Fanconi贫血,互补群G 2台混合动力 BioGRID 16189514
FATE1 命运 胎儿和成人睾丸表示1 2台混合动力 BioGRID 16189514
FBF1 铝青铜| FBF-1 | FLJ00103 Fas (TNFRSF6)结合因子1 2台混合动力 BioGRID 16189514
GCC1 FLJ22035 | GCC1P | GCC88 | MGC20706 控制和卷曲螺旋域包含1 2台混合动力 BioGRID 16189514
GPSM1 AGS3 | DKFZp727I051 蛋白信号调制器1 (AGS3-like,秀丽隐杆线虫) 2台混合动力 BioGRID 16189514
硫化汞 小时| ZFYVE8 肝细胞生长factor-regulated酪氨酸激酶衬底 2台混合动力 BioGRID 16189514
IL16 FLJ16806 | FLJ42735 | FLJ44234 | HsT19289 | IL-16 | LCF | prIL-16 白介素16(淋巴细胞化学引诱物的因素) 2台混合动力 BioGRID 16189514
KIAA1267 DKFZp686P06109 | DKFZp727C091 | MGC102843 KIAA1267 2台混合动力 BioGRID 16189514
KLHDC5 KIAA1340 | MGC131714 kelch域包含5 2台混合动力 BioGRID 16189514
KRT15 CK15 | K15 | K1CO 角蛋白15 2台混合动力 BioGRID 16189514
KRT19 CK19 | K19 | K1CS | MGC15366 角蛋白19 2台混合动力 BioGRID 16189514
MED28 1500003 d12rik | DKFZp434N185 | | EG1 magicin 中介复杂28亚基 2台混合动力 BioGRID 16189514
NDC80 HEC | HEC1 | KNTC2 | TID3 | hsNDC80 NDC80同族体,着丝粒复杂组件(酵母) 2台混合动力 BioGRID 16189514
NOC4L MGC3162 | NOC4 核仁的复杂关联4同族体(酵母) 亲和力Capture-Western
2台混合动力
BioGRID 16189514
PRC1 ASE1 | MGC1671 | MGC3669 蛋白质的胞质分裂1的监管机构 2台混合动力 BioGRID 16189514
RIBC2 C22orf11 RIB43A域coiled-coils 2 2台混合动力 BioGRID 16189514
SERTAD3 RBT1 舒达域包含3 亲和力Capture-Western
2台混合动力
BioGRID 16189514
SMARCD1 BAF60A | CRACD1 | Rsc6p 瑞士/ SNF相关,关联矩阵,肌动蛋白依赖的染色质的调节器,亚d,成员1 2台混合动力 BioGRID 16189514
TUBGCP4 76 p | FLJ14797 | GCP4 微管蛋白γ复杂相关蛋白4 2台混合动力 BioGRID 16189514
USH1C aie - 75 | DFNB18 | NY-CO-37 | NY-CO-38 | PDZ-45 | pdz - 73 | pdz - 73 / NY-CO-38 | PDZ73 | ush1cpst 亚瑟综合征1 c(常染色体隐性、严重) - - - - - - HPRD, BioGRID 11311560
USHBP1 AIEBP | FLJ38709 | FLJ90681 | MCC2 亚瑟综合征1 c结合蛋白1 2台混合动力 BioGRID 16189514


部分诉通路注释

路径名称 通道尺寸 # SZGR 2.0基因通路 信息
伊万诺娃造血干细胞和祖 681年 420年 所有SZGR 2.0基因通路
马丁内斯RB1 DN的目标 543年 317年 所有SZGR 2.0基因通路
马丁内斯TP53的目标了 602年 364年 所有SZGR 2.0基因通路
马丁内斯RB1和TP53的目标 601年 369年 所有SZGR 2.0基因通路