基因页面:USHBP1
总结吗?
GeneID | 83878年 |
象征 | USHBP1 |
同义词 | AIEBP | MCC2 |
描述 | USH1蛋白质网络组件harmonin结合蛋白1 |
参考 | MIM: 611810|HGNC: HGNC: 24058|运用:ENSG00000130307|HPRD: 18276|织女:OTTHUMG00000182730 |
基因型 | 蛋白质编码 |
地图上的位置 | 19 p13 |
帕斯卡假定值 | 0.434 |
胎儿β | -0.431 |
eGene | 迈尔斯的顺式和反式 |
基因数据来源
基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:GWASdb | 全基因组关联研究 | 精神分裂症GWASdb记录 | |
简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
PMID: cooccur | 高通量文献检索 | 系统搜索PubMed的基因共病SCZ关键词。总共有3027个基因包括在内。 | |
文学 | 高通量文献检索 | 与精神分裂症Co-occurance关键词:精神分裂症、神经 | 点击显示详细信息 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
eQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
rs10994209 | chr10 | 61877705 | USHBP1 | 83878年 | 0.02 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
![不可用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/USHBP1_DE_GTEx.png)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
第四部分,注释蛋白质间交互作用
扶少团团员 | 别名B | 官方全名B | 实验 | 源 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|---|
ABLIM1 | ABLIM | DKFZp781D0148 | FLJ14564 | KIAA0059 | LIMAB1 | LIMATIN | MGC1224 | 肌动蛋白绑定LIM蛋白1 | 2台混合动力 | BioGRID | 16189514 |
BET1 | DKFZp781C0425 | HBET1 | 阻塞在运输1同族体(酵母) | 亲和力Capture-Western 2台混合动力 |
BioGRID | 16189514 |
C10orf10 | 德普|无花果 | 染色体10开放阅读框 | 2台混合动力 | BioGRID | 16189514 |
C1orf216 | FLJ38984 | 染色体1 216年开放阅读框 | 2台混合动力 | BioGRID | 16189514 |
CCDC120 | JM11 | 卷曲螺旋域包含120 | 2台混合动力 | BioGRID | 16189514 |
CCDC33 | FLJ23168 | FLJ32855 | MGC34145 | 卷曲螺旋域包含33 | 2台混合动力 | BioGRID | 16189514 |
CCNK | CPR4 | MGC9113 | 细胞周期蛋白K | 2台混合动力 | BioGRID | 16189514 |
CEP63 | FLJ13386 | MGC78416 | centrosomal蛋白质63 kda | 2台混合动力 | BioGRID | 16189514 |
COPS4 | MGC10899 | MGC15160 | COP9本构photomorphogenic同族体亚基4(拟南芥) | 2台混合动力 | BioGRID | 16189514 |
DYDC1 | DPY30D1 | FLJ43920 | bA36D19.5 | DPY30域包含1 | 2台混合动力 | BioGRID | 16189514 |
EXOC7 | 2-5-3p | DKFZp686J04253 | EX070 | EXO70 | EXOC1 | Exo70p | FLJ40965 | FLJ46415 | YJL085W | exocyst复杂组件7 | 2台混合动力 | BioGRID | 16189514 |
EXOC8 | EXO84 | Exo84p | SEC84 | exocyst复杂组件8 | 亲和力Capture-Western 2台混合动力 |
BioGRID | 16189514 |
FAM107A | DRR1 | FLJ30158 | FLJ45473 | TU3A | 107年家庭序列相似性,成员 | 2台混合动力 | BioGRID | 16189514 |
FANCG | 同性恋| XRCC9 | Fanconi贫血,互补群G | 2台混合动力 | BioGRID | 16189514 |
FATE1 | 命运 | 胎儿和成人睾丸表示1 | 2台混合动力 | BioGRID | 16189514 |
FBF1 | 铝青铜| FBF-1 | FLJ00103 | Fas (TNFRSF6)结合因子1 | 2台混合动力 | BioGRID | 16189514 |
GCC1 | FLJ22035 | GCC1P | GCC88 | MGC20706 | 控制和卷曲螺旋域包含1 | 2台混合动力 | BioGRID | 16189514 |
GPSM1 | AGS3 | DKFZp727I051 | 蛋白信号调制器1 (AGS3-like,秀丽隐杆线虫) | 2台混合动力 | BioGRID | 16189514 |
硫化汞 | 小时| ZFYVE8 | 肝细胞生长factor-regulated酪氨酸激酶衬底 | 2台混合动力 | BioGRID | 16189514 |
IL16 | FLJ16806 | FLJ42735 | FLJ44234 | HsT19289 | IL-16 | LCF | prIL-16 | 白介素16(淋巴细胞化学引诱物的因素) | 2台混合动力 | BioGRID | 16189514 |
KIAA1267 | DKFZp686P06109 | DKFZp727C091 | MGC102843 | KIAA1267 | 2台混合动力 | BioGRID | 16189514 |
KLHDC5 | KIAA1340 | MGC131714 | kelch域包含5 | 2台混合动力 | BioGRID | 16189514 |
KRT15 | CK15 | K15 | K1CO | 角蛋白15 | 2台混合动力 | BioGRID | 16189514 |
KRT19 | CK19 | K19 | K1CS | MGC15366 | 角蛋白19 | 2台混合动力 | BioGRID | 16189514 |
MED28 | 1500003 d12rik | DKFZp434N185 | | EG1 magicin | 中介复杂28亚基 | 2台混合动力 | BioGRID | 16189514 |
NDC80 | HEC | HEC1 | KNTC2 | TID3 | hsNDC80 | NDC80同族体,着丝粒复杂组件(酵母) | 2台混合动力 | BioGRID | 16189514 |
NOC4L | MGC3162 | NOC4 | 核仁的复杂关联4同族体(酵母) | 亲和力Capture-Western 2台混合动力 |
BioGRID | 16189514 |
PRC1 | ASE1 | MGC1671 | MGC3669 | 蛋白质的胞质分裂1的监管机构 | 2台混合动力 | BioGRID | 16189514 |
RIBC2 | C22orf11 | RIB43A域coiled-coils 2 | 2台混合动力 | BioGRID | 16189514 |
SERTAD3 | RBT1 | 舒达域包含3 | 亲和力Capture-Western 2台混合动力 |
BioGRID | 16189514 |
SMARCD1 | BAF60A | CRACD1 | Rsc6p | 瑞士/ SNF相关,关联矩阵,肌动蛋白依赖的染色质的调节器,亚d,成员1 | 2台混合动力 | BioGRID | 16189514 |
TUBGCP4 | 76 p | FLJ14797 | GCP4 | 微管蛋白γ复杂相关蛋白4 | 2台混合动力 | BioGRID | 16189514 |
USH1C | aie - 75 | DFNB18 | NY-CO-37 | NY-CO-38 | PDZ-45 | pdz - 73 | pdz - 73 / NY-CO-38 | PDZ73 | ush1cpst | 亚瑟综合征1 c(常染色体隐性、严重) | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 11311560 |
USHBP1 | AIEBP | FLJ38709 | FLJ90681 | MCC2 | 亚瑟综合征1 c结合蛋白1 | 2台混合动力 | BioGRID | 16189514 |
部分诉通路注释
路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
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伊万诺娃造血干细胞和祖 | 681年 | 420年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
马丁内斯RB1 DN的目标 | 543年 | 317年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
马丁内斯TP53的目标了 | 602年 | 364年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
马丁内斯RB1和TP53的目标 | 601年 | 369年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |