基因页：STK40

概括？
基因 83931
象征 STK40
同义词 Shik | SGK495
描述 丝氨酸/苏氨酸激酶40
参考 MIM：609437|HGNC：HGNC：21373|ENSEMBL：ENSG00000196182|HPRD：11359|Vega：Otthumg00000008238
基因类型 蛋白质编码
地图位置 1p34.3
Pascal P值 0.589
Sherlock P值 0.378
胎儿β 0.501
DMG 1（＃研究）
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG：Montano_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括CPG与精神分裂症之间的172个复制关联。 1
表达 基因表达的荟萃分析 p价值：1.836

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p（dis） beta（dis） fdr（dis） 学习
CG25722983 1 36840028 STK40 5.27E-5 -0.007 0.098 DMG：Montano_2016

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS16858695 CHR1 162193737 STK40 83931 0.2 反式
RS2014805 CHR2 175165192 STK40 83931 0.06 反式
RS7593761 CHR2 197275602 STK40 83931 0.17 反式
RS16827037 CHR3 117203284 STK40 83931 0.13 反式
RS7664027 CHR4 169121200 STK40 83931 0.01 反式
RS17053782 CHR4 169127022 STK40 83931 0.01 反式
RS11722969 CHR4 169133757 STK40 83931 0.01 反式
RS6846811 CHR4 169234535 STK40 83931 0.14 反式
RS904451 CHR4 186630945 STK40 83931 0.08 反式
RS887719 CHR7 21184272 STK40 83931 0.07 反式
RS320082 CHR7 29105404 STK40 83931 0 反式
RS317720 CHR7 29110633 STK40 83931 0.08 反式
RS317714 CHR7 29115553 STK40 83931 1.473E-5 反式
RS317724 CHR7 29120565 STK40 83931 0.08 反式
RS7850851 Chr9 37928770 STK40 83931 0.15 反式
RS10834670 Chr11 25404015 STK40 83931 0.14 反式
RS10834671 Chr11 25404269 STK40 83931 0.11 反式
RS4497566 CHR13 51694324 STK40 83931 8.11e-4 反式
RS1307687 0 STK40 83931 0.08 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23岁）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0000166 核苷酸结合 IEA -
去：0005524 ATP结合 IEA -
去：0004674 蛋白质丝氨酸/苏氨酸激酶活性 IEA -
GO：0016740 转移酶活性 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0006468 蛋白氨基酸磷酸化 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0005634 核 IEA -
去：0005730 核仁 艾达 18029348
去：0005737 细胞质 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 ＃szgr 2.0基因 信息
Senese HDAC2靶向DN 133 77 该途径中的所有SZGR 2.0基因
多德鼻咽癌 1821年 933 该途径中的所有SZGR 2.0基因
lastowska神经母细胞瘤副本编号dn 800 473 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Perez TP63目标 355 243 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten EZH2靶向 1037 673 该途径中的所有SZGR 2.0基因
洛佩兹MBD目标 957 597 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Galindo对肠毒素的免疫反应 85 67 该途径中的所有SZGR 2.0基因
胰岛素抵抗时的肉食正常 34 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yamanaka胶质母细胞瘤生存 11 7 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yoshioka肝癌早期复发DN 65 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
wakabayashi脂肪生成PPARG RXRA绑定8D 882 506 该途径中的所有SZGR 2.0基因
巨噬细胞的库马尔病原体负荷 275 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang 1类由EGF瞬时诱导 516 308 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
Let-7/98 259 265 M8 HSA-LET-7A脑 ugagguaguaguauauaguu
HSA-LET-7B脑 ugagguaguagguuguguguguu
HSA-LET-7C脑 ugagguaguagguuguaugguu
HSA-LET-7D脑 agagguaguagguugcauagu
HSA-LET-7E脑 ugagguaggagguuauauagu
HSA-LET-7F脑 ugagguagauuguauauaguu
HSA-MIR-98脑 ugagguaaguuguauuguu
HSA-LET-7GSZ ugagguaguuguuguacagu
HSA-LET-7I脑 ugagguaguugugugugugcugu
mir-129-5p 2045 2051 1a HSA-MIR-129脑 cuuuuugcgguggggcuugc
HSA-MIR-129-5P cuuuuugcgguggggcuugcu
mir-134 2040 2046 1a HSA-MIR-134脑 ugugacuggugaccagaggg
mir-137 2103 2109 1a HSA-MIR-137 uauugcuuaagaauacgcguag
HSA-MIR-137 uauugcuuaagaauacgcguag
mir-21 387 393 M8 HSA-MIR-21脑 uagcuuaucagacugauguuga
HSA-MIR-590 gagcuuauucauaaaaagugcag
mir-31 1475 1482 1A，M8 HSA-MIR-31 Aggcaagaugcuggcauagcug
HSA-MIR-31 Aggcaagaugcuggcauagcug
mir-381 2054 2060 1a HSA-MIR-381 uauacaagggcaagcucucugu