概括
基因 8398
象征 PLA2G6
同义词 cai-pla2 | gvi | inad1 | ipla2-via | nbia2 | nbia2a | nbia2b | park14 | pla2 | pnpla9 | ipla2 | ipla2beta2 | ipla2beta
描述 磷脂酶A2组VI
参考 MIM:603604|HGNC:HGNC:9039|ENSEMBL:ENSG00000184381|HPRD:04675|Vega:Otthumg00000151246
基因类型 蛋白质编码
地图位置 22q13.1
Pascal P值 0.187
Sherlock P值 0.71
胎儿β -0.441
主持人

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
协会 组合的优势比方法(Sun等。2008),协会研究 2 链接到Szgene
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
PPAPDC3 0.85 0.88
ABHD8 0.84 0.83
TMEM38A 0.84 0.84
CTSF 0.83 0.85
necab3 0.82 0.83
rundc3a 0.82 0.82
SH3BP1 0.81 0.81
Tollip 0.81 0.84
PGP 0.81 0.85
itpka 0.81 0.73
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
EIF5B -0.56 -0.64
RBMX2 -0.53 -0.61
UPF3B -0.53 -0.56
thoc2 -0.52 -0.51
GTF3C6 -0.50 -0.53
atad2b -0.50 -0.44
FNBP1L -0.49 -0.33
ZNF326 -0.49 -0.48
ZNF300 -0.49 -0.34
AC011475.1 -0.49 -0.53

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0004623 磷脂酶A2活性 塔斯 9417066
GO:0016787 水解酶活性 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO:0016042 脂质分解代谢过程 IEA -
去:0008219 细胞死亡 IEA -
去:0008152 代谢过程 IEA -
去:0006644 磷脂代谢过程 塔斯 9417066
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005813 中心体 艾达 18029348
去:0005634 艾达 18029348
去:0005737 细胞质 IEA -
去:0016020 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
KEGG甘油磷脂代谢 77 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg醚脂质代谢 33 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kegg蛛网膜酸代谢 58 36 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG亚油酸代谢 29 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
keggα亚麻酸代谢 19 9 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg mapk信号通路 267 205 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg血管平滑肌收缩 115 81 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg vegf信号通路 76 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg fc epsilon ri信号传导途径 79 58 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg fc伽马r介导的吞噬作用 97 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG长期抑郁症 70 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg gnRH信号通路 101 77 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PC的Reactome酰基链重塑 22 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组磷脂代谢 198 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PE的反应组酰基链重塑 21 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组甘油磷脂生物合成 82 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
脂质和脂蛋白的反应组代谢 478 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿霉素的Graessmann凋亡 1142 669 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Graessmann对MC和阿霉素的反应 612 367 该途径中的所有SZGR 2.0基因
riz红细胞分化 77 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RIZ红细胞分化CCNE1 40 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Myc Max目标 775 494 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yagi AML Fab标记 191 131 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RUAN对TNF Troglitazone DN的反应 42 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ramalho Stemness 206 118 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chiba对TSA的反应 52 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RUAN对TNF DN的反应 84 50 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏症疾病 1691年 1088 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染48小时DN 504 323 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伊万诺娃造血细胞和祖细胞 681 420 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伯顿成生成6 189 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bochkis foxa2目标 425 261 该途径中的所有SZGR 2.0基因
级结肠癌 871 505 该途径中的所有SZGR 2.0基因
西肾上腺皮质肿瘤DN 546 362 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由MYC约束 1103 714 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ruan对Troglitazone DN的反应 19 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kasler HDAC7靶向1个 194 133 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FEVR CTNNB1靶向 682 433 该途径中的所有SZGR 2.0基因
wakabayashi脂肪生成PPARG RXRA绑定8D 882 506 该途径中的所有SZGR 2.0基因
wakabayashi脂肪形成PPARG RXRA与H4K20me1标记结合 145 82 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Delacroix Rarg Bound MEF 367 231 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Roessler肝癌转移 107 72 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 1839年 928 该途径中的所有SZGR 2.0基因