基因页：NCALD
Summary？
| GeneID | 83988 |
| Symbol | NCALD |
| 同义词 | - |
| 描述 | Neurolocalcin Delta |
| 参考 | MIM：606722|HGNC：HGNC：7655|ENSEMBL：ENSG00000104490|HPRD：09466|Vega：Otthumg00000164876 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 8Q22.2 |
| Pascal P值 | 0.234 |
| Sherlock P值 | 0.845 |
| 胎儿β | -1.926 |
| DMG | 1（＃研究） |
| 主持人 | 皮质 迈尔斯的顺式和跨性别 元 |
| 支持 | 细胞内信号转导 |
Gene in Data Sources
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 | 1 |
| PMID：cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
| 文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
| go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | Hits with neuro-related keywords: 1 |
Section I. Genetics and epigenetics annotation
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG03031839 | 8 | 103094119 | NCALD | 9.94e-5 | -0.469 | 0.028 | DMG：Wockner_2014 |
EQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS443832 | CHR16 | 83779643 | NCALD | 83988 | 0.1 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
Footnote:
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
Footnote:
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0030276 | 网格蛋白结合 | 艾达 | 突触（GO期限：4） | 11964161 |
| 去：0003779 | 肌动蛋白结合 | 艾达 | 11964161 | |
| 去：0005509 | calcium ion binding | IEA | - | |
| GO：0015631 | 微管蛋白结合 | 艾达 | 11964161 | |
| Biological process | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| GO：0016192 | vesicle-mediated transport | nas | 11964161 | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0005829 | 细胞质 | nas | 11964161 | |
| 去：0005622 | 细胞内 | 艾达 | 11256614 | |
| 去：0030130 | 跨加利基网络囊泡的网格蛋白涂层 | nas | 11964161 |
Section V. Pathway annotation
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-132/212 | 834 | 840 | M8 | HSA-MIR-212SZ | uaacagucuccagucacgccc |
| HSA-MIR-132脑 | UAACAGUCUACAGCCAUGGUCG | ||||
| mir-181 | 875 | 881 | M8 | HSA-MIR-181A脑 | AACAUUCAACGCUGUCGGUGAGU |
| HSA-MIR-181BSZ | aacauucauugcugucggggg | ||||
| HSA-MIR-181C脑 | aacauucaaccugucggugagu | ||||
| HSA-MIR-181D脑 | aacauucauuguugucggggguggguu | ||||
| mir-182 | 1900 | 1907年 | 1A，M8 | HSA-MIR-182 | UUUGGCAAUGGUAGAACUCACA |
| HSA-MIR-182 | UUUGGCAAUGGUAGAACUCACA | ||||
| mir-19 | 909 | 916 | 1A，M8 | HSA-MIR-19A | ugugcaaauaugauaugaaaacuga |
| HSA-MIR-19B | UGUGCAAAUCCAUGCAAAACUGA | ||||
| mir-204/211 | 322 | 328 | 1a | hsa-miR-204脑 | Uucccuuugucauccuaugccu |
| HSA-MIR-211 | uucccuuugucauccuucgccu | ||||
| mir-205 | 2567 | 2573 | 1a | hsa-miR-205 | UCCUUCAUUCCACCGGAGUCUG |
| mir-27 | 559 | 565 | 1a | HSA-MIR-27A脑 | uucacaguggcuaaguuccgc |
| HSA-MIR-27B脑 | uucacaguggcuaaguucugc | ||||
| mir-30-5p | 624 | 630 | 1a | hsa-miR-30a-5p | uguaaaacauccuccugagaag |
| HSA-MIR-30C脑 | UGUAAACAUCCUACACUCUCAGC | ||||
| HSA-MIR-30DSZ | UGUAAACAUCCCCGACUGGAAG | ||||
| HSA-MIR-30BSZ | uguaaacauccuaccucucagcu | ||||
| HSA-MIR-30E-5P | uguaaacauccuugacugga | ||||
| mir-326 | 181 | 187 | M8 | hsa-miR-326 | CCUCUGGGCCCUUCCUCCAG |
| miR-370 | 538 | 544 | M8 | HSA-MIR-370脑 | gccugggggguggaaccugg |
| mir-410 | 941 | 947 | 1a | HSA-MIR-410 | AAUAUAACACAGAUGGCCUGU |
| miR-96 | 80 | 86 | 1a | HSA-MIR-96脑 | uuuggcacuagcacauuuuugc |