概括
基因 8403
象征 Sox14
同义词 Sox28
描述 Sry-Box 14
参考 MIM:604747|HGNC:HGNC:11193|ENSEMBL:ENSG00000168875|HPRD:16067|Vega:Otthumg00000159757
基因类型 蛋白质编码
地图位置 3Q22-Q23
Pascal P值 0.396
胎儿β -0.152

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
简历:Phewas 全球整个关联研究(PHEWAS) 157个与精神分裂症相关的SNP 0
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关的关键字的命中:1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@简历:Phewas

SNP ID 染色体 位置 等位基因 p 功能 基因 向上/向下距离


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
tmeff1 0.86 0.86
GSPT2 0.86 0.85
GTF2E1 0.85 0.84
BFAR 0.85 0.85
METAP2 0.85 0.83
C9orf30 0.85 0.86
焦油 0.85 0.84
FAF1 0.85 0.86
MSH2 0.84 0.86
thumpd3 0.84 0.87
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
MT-CO2 -0.69 -0.79
AF347015.27 -0.69 -0.79
AF347015.31 -0.69 -0.79
AF347015.33 -0.69 -0.79
AF347015.8 -0.68 -0.79
mt-cyb -0.67 -0.77
AF347015.15 -0.67 -0.79
AF347015.2 -0.66 -0.78
HLA-F -0.65 -0.70
tinagl1 -0.64 -0.70

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0003700 转录因子活性 nas -
去:0003700 转录因子活性 塔斯 9925951
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0007399 神经系统的发展 塔斯 神经突(GO期限:5) 9925951
去:0006355 调节转录,DNA依赖性的调节 IEA -
去:0006355 调节转录,DNA依赖性的调节 nas -
去:0006350 转录 IEA -
去:0006325 建立或维护染色质体系结构 nas -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO:0000785 染色质 IEA -
去:0005634 IEA -
去:0005634 nas -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
周炎性反应活DN 384 220 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Suz12目标 1038 678 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath EED目标 1062 725 该途径中的所有SZGR 2.0基因
与H3K27me3的Benporath ES 1118 744 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath PRC2目标 652 441 该途径中的所有SZGR 2.0基因
克拉斯的加沙表观遗传沉默 26 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bonome卵巢癌的生存最佳逃亡 246 152 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shedden肺癌良好生存A12 317 177 该途径中的所有SZGR 2.0基因