基因页:Sox14
概括?
基因 | 8403 |
象征 | Sox14 |
同义词 | Sox28 |
描述 | Sry-Box 14 |
参考 | MIM:604747|HGNC:HGNC:11193|ENSEMBL:ENSG00000168875|HPRD:16067|Vega:Otthumg00000159757 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 3Q22-Q23 |
Pascal P值 | 0.396 |
胎儿β | -0.152 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
简历:Phewas | 全球整个关联研究(PHEWAS) | 157个与精神分裂症相关的SNP | 0 |
go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关的关键字的命中:1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
简历:Phewas
SNP ID | 染色体 | 位置 | 等位基因 | p | 功能 | 基因 | 向上/向下距离 |
---|
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
tmeff1 | 0.86 | 0.86 |
GSPT2 | 0.86 | 0.85 |
GTF2E1 | 0.85 | 0.84 |
BFAR | 0.85 | 0.85 |
METAP2 | 0.85 | 0.83 |
C9orf30 | 0.85 | 0.86 |
焦油 | 0.85 | 0.84 |
FAF1 | 0.85 | 0.86 |
MSH2 | 0.84 | 0.86 |
thumpd3 | 0.84 | 0.87 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
MT-CO2 | -0.69 | -0.79 |
AF347015.27 | -0.69 | -0.79 |
AF347015.31 | -0.69 | -0.79 |
AF347015.33 | -0.69 | -0.79 |
AF347015.8 | -0.68 | -0.79 |
mt-cyb | -0.67 | -0.77 |
AF347015.15 | -0.67 | -0.79 |
AF347015.2 | -0.66 | -0.78 |
HLA-F | -0.65 | -0.70 |
tinagl1 | -0.64 | -0.70 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0003700 | 转录因子活性 | nas | - | |
去:0003700 | 转录因子活性 | 塔斯 | 9925951 | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0007399 | 神经系统的发展 | 塔斯 | 神经突(GO期限:5) | 9925951 |
去:0006355 | 调节转录,DNA依赖性的调节 | IEA | - | |
去:0006355 | 调节转录,DNA依赖性的调节 | nas | - | |
去:0006350 | 转录 | IEA | - | |
去:0006325 | 建立或维护染色质体系结构 | nas | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
GO:0000785 | 染色质 | IEA | - | |
去:0005634 | 核 | IEA | - | |
去:0005634 | 核 | nas | - |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
周炎性反应活DN | 384 | 220 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath Suz12目标 | 1038 | 678 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath EED目标 | 1062 | 725 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
与H3K27me3的Benporath ES | 1118 | 744 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath PRC2目标 | 652 | 441 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
克拉斯的加沙表观遗传沉默 | 26 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bonome卵巢癌的生存最佳逃亡 | 246 | 152 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Shedden肺癌良好生存A12 | 317 | 177 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |