基因页:淫秽
概括?
基因 | 84033 |
象征 | 淫秽 |
同义词 | ARHGEF30 | UNC89 |
描述 | 掩盖蛋白,细胞骨架钙调蛋白和钛相互作用罗格夫 |
参考 | MIM:608616|HGNC:HGNC:15719|ENSEMBL:ENSG00000154358|HPRD:08594|HPRD:10551|Vega:Otthumg0000000039772 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 1Q42.13 |
Sherlock P值 | 0.844 |
胎儿β | 2.163 |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
支持 | COMPOSITESET |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DNM:Fromer_2014 | 整个外显子组测序分析 | 这项研究报道了WES对623个精神分裂症三重奏的研究,该研究使用基因组DNA报告了DNM。 | |
网络 | 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 | PPI网络中最短路径的贡献:0.0024 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
DNM表
基因 | 染色体 | 位置 | 参考 | alt | 成绩单 | AA更改 | 突变类型 | 筛 | CG46 | 特征 | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
淫秽 | CHR1 | 228465539 | G | 一种 | NM_001098623 NM_001271223 NM_052843 |
p.2280r> q p.2709r> q p.2280r> q |
错过 错过 错过 |
精神分裂症 | DNM:Fromer_2014 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS7584986 | CHR2 | 184111432 | 淫秽 | 84033 | 0.11 | 反式 | ||
RS10008800 | CHR4 | 5773180 | 淫秽 | 84033 | 0.17 | 反式 | ||
RS10491487 | CHR5 | 80323367 | 淫秽 | 84033 | 0.01 | 反式 | ||
RS16955618 | CHR15 | 29937543 | 淫秽 | 84033 | 9.804e-5 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/OBSCN_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0000166 | 核苷酸结合 | IEA | - | |
去:0005089 | Rho鸟苷核苷酸交换因子活性 | IEA | - | |
去:0000287 | 镁离子结合 | IEA | - | |
去:0005515 | 蛋白质结合 | IPI | 11448995|12527750 | |
去:0005524 | ATP结合 | IEA | - | |
去:0004674 | 蛋白质丝氨酸/苏氨酸激酶活性 | IEA | - | |
去:0004713 | 蛋白酪氨酸激酶活性 | IEA | - | |
GO:0016740 | 转移酶活性 | IEA | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0006468 | 蛋白氨基酸磷酸化 | IEA | - | |
去:0007275 | 多细胞生物发育 | IEA | - | |
去:0030154 | 细胞分化 | IEA | - | |
GO:0035023 | 调节Rho蛋白信号转导的调节 | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005622 | 细胞内 | IEA | - | |
去:0005737 | 细胞质 | IEA | - |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
pid rhoa reg途径 | 46 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rho GTPases的Reactome信号传导 | 113 | 81 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NGF的Reactome信号传导 | 217 | 167 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome Nrage通过JNK发出死亡的信号 | 43 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome细胞死亡信号通过Nrage NRIF和NADE传导 | 60 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome P75 NTR受体介导的信号传导 | 81 | 61 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
GPCR的反应组信号传导 | 920 | 449 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome G alpha1213信号传导事件 | 74 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome GPCR下游信号传导 | 805 | 368 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Perez TP53目标 | 1174 | 695 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
道格拉斯BMI1靶向 | 566 | 371 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
肝癌DN中的阿塞维多甲基化 | 940 | 425 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Boylan多发性骨髓瘤D聚集 | 27 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Boylan多发性骨髓瘤D | 89 | 62 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Boylan多发性骨髓瘤PCA3 | 80 | 54 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Fortschegger PHF8靶向DN | 784 | 464 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pedrioli mir31靶向 | 221 | 120 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |