概括
基因 84033
象征 淫秽
同义词 ARHGEF30 | UNC89
描述 掩盖蛋白,细胞骨架钙调蛋白和钛相互作用罗格夫
参考 MIM:608616|HGNC:HGNC:15719|ENSEMBL:ENSG00000154358|HPRD:08594|HPRD:10551|Vega:Otthumg0000000039772
基因类型 蛋白质编码
地图位置 1Q42.13
Sherlock P值 0.844
胎儿β 2.163
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别
支持 COMPOSITESET

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DNM:Fromer_2014 整个外显子组测序分析 这项研究报道了WES对623个精神分裂症三重奏的研究,该研究使用基因组DNA报告了DNM。
网络 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 PPI网络中最短路径的贡献:0.0024

第一节遗传学和表观遗传学注释

@DNM表

基因 染色体 位置 参考 alt 成绩单 AA更改 突变类型 CG46 特征 学习
淫秽 CHR1 228465539 G 一种 NM_001098623
NM_001271223
NM_052843
p.2280r> q
p.2709r> q
p.2280r> q
错过
错过
错过
精神分裂症 DNM:Fromer_2014

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS7584986 CHR2 184111432 淫秽 84033 0.11 反式
RS10008800 CHR4 5773180 淫秽 84033 0.17 反式
RS10491487 CHR5 80323367 淫秽 84033 0.01 反式
RS16955618 CHR15 29937543 淫秽 84033 9.804e-5 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0000166 核苷酸结合 IEA -
去:0005089 Rho鸟苷核苷酸交换因子活性 IEA -
去:0000287 镁离子结合 IEA -
去:0005515 蛋白质结合 IPI 11448995|12527750
去:0005524 ATP结合 IEA -
去:0004674 蛋白质丝氨酸/苏氨酸激酶活性 IEA -
去:0004713 蛋白酪氨酸激酶活性 IEA -
GO:0016740 转移酶活性 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0006468 蛋白氨基酸磷酸化 IEA -
去:0007275 多细胞生物发育 IEA -
去:0030154 细胞分化 IEA -
GO:0035023 调节Rho蛋白信号转导的调节 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005622 细胞内 IEA -
去:0005737 细胞质 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
pid rhoa reg途径 46 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rho GTPases的Reactome信号传导 113 81 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NGF的Reactome信号传导 217 167 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome Nrage通过JNK发出死亡的信号 43 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome细胞死亡信号通过Nrage NRIF和NADE传导 60 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome P75 NTR受体介导的信号传导 81 61 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GPCR的反应组信号传导 920 449 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome G alpha1213信号传导事件 74 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome GPCR下游信号传导 805 368 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Perez TP53目标 1174 695 该途径中的所有SZGR 2.0基因
道格拉斯BMI1靶向 566 371 该途径中的所有SZGR 2.0基因
肝癌DN中的阿塞维多甲基化 940 425 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boylan多发性骨髓瘤D聚集 27 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boylan多发性骨髓瘤D 89 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boylan多发性骨髓瘤PCA3 80 54 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Fortschegger PHF8靶向DN 784 464 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pedrioli mir31靶向 221 120 该途径中的所有SZGR 2.0基因