概括
基因 84062
象征 DTNBP1
同义词 bloc1s8 | dbnd | hps7 | my031 | sdy
描述 Dystrobrevin结合蛋白1
参考 MIM:607145|HGNC:HGNC:17328|Ensembl:ENSG0000000047579|HPRD:06190|Vega:Otthumg0000000014295
基因类型 蛋白质编码
地图位置 6p22.3
Pascal P值 0.549
Sherlock P值 0.57
胎儿β 0.755
DMG 1(#研究)
主持人 尾状基底神经节
海马
迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
CV:GWASDB 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 1
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
协会 组合的优势比方法(Sun等。2008),协会研究 3 链接到Szgene
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 PSR:0.0159
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症的关键字相同:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关的关键字的命中:1
网络 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 PPI网络中最短路径的贡献:33.8114

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG23819836 6 15663134 DTNBP1 3.145e-4 -0.197 0.04 DMG:Wockner_2014

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS10508654 Chr10 23104638 DTNBP1 84062 0.14 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005515 蛋白质结合 IEA -
GO:0042802 相同的蛋白质结合 IPI 15102850
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0007601 视觉感知 IEA -
去:0006996 Organelle组织 ISS -
GO:0050896 对刺激的反应 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO:0030424 轴突 ISS 神经元,轴突,神经递质(GO期限:6) -
去:0005634 ISS -
去:0005737 细胞质 IEA -
去:0005737 细胞质 ISS -
GO:0042383 肌膜 ISS -

第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

互动者 别名b 官方全名b 实验 资源 PubMed ID
ABI3 nesh |SSH3BP3 阿比家族,成员3 两个杂交 Biogrid 16189514
arfip2 POR1 ADP-核糖基化因子相互作用蛋白2 两个杂交 Biogrid 16189514
bloc1s1 blos1 |FLJ39337 |FLJ97089 |GCN5L1 |MGC87455 |Micoa |RT14 溶酶体细胞器复合物1,亚基1的生物发生1 亲和力捕获 - 韦斯特恩 Biogrid 15102850
bloc1s2 blos2 |FLJ30135 |MGC10120 |RP11-316M21.4 溶酶体细胞器复合物1,亚基2的生物发生2 - HPRD,Biogrid 15102850
bloc1s3 blos3 |FLJ26641 |FLJ26676 |HPS8 |RP 溶酶体细胞器复合物1,亚基3的生物发生3 亲和力捕获 - 韦斯特恩 Biogrid 15102850
CCND3 - Cyclin D3 两个杂交 Biogrid 16189514
CMYA5 C5orf10 |DKFZP451G182 |DKFZP451G223 |DTNBP2 |spryd2 |Trim76 心肌病相关5 - HPRD 14688250
CNO BCAS4L |FLJ11230 卡布奇诺同源物(鼠标) - HPRD 15102850
DGCR6L FLJ10666 Digeorge综合征关键区域基因6样 两个杂交 Biogrid 16189514
DTNA D18S892E |drp3 |DTN |FLJ96209 |LVNC1 Dystrobrevin,Alpha - HPRD 11316798
DTNB MGC17163 |MGC57126 Dystrobrevin,Beta - HPRD 11316798
静音 DKFZP686E2287 |亩 柔和的同源物(小鼠) 静音与动力难题相互作用。 绑定 15102850
静音 DKFZP686E2287 |亩 柔和的同源物(小鼠) 亲和力捕获 - 韦斯特恩
两个杂交
Biogrid 15102850
PLDN PA |苍白 pallidin同源物(鼠标) pallidin与动物难题相互作用。 绑定 15102850
PLDN PA |苍白 pallidin同源物(鼠标) - HPRD,Biogrid 15102850
Snapin 快照 快速相关的蛋白质 亲和力捕获 - 韦斯特恩
两个杂交
Biogrid 15102850
Snapin 快照 快速相关的蛋白质 Snapin与dysbindin相互作用。 绑定 15102850


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Reactome膜贩运 129 74 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome Trans Golgi网络囊泡芽 60 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome Golgi相关囊泡生物发生 53 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿霉素DN的Graessmann凋亡 1781年 1082 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Graessmann对MC和阿霉素DN的反应 770 415 该途径中的所有SZGR 2.0基因
狮子转移 539 324 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FLI1和DAX1 DN的Garcia目标 176 104 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Stark前额叶皮层22Q11删除DN 517 309 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伊万诺娃造血早期祖先 532 309 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pilon KLF1靶向DN 1972年 1213 该途径中的所有SZGR 2.0基因