基因页:DTNBP1
概括?
基因 | 84062 |
象征 | DTNBP1 |
同义词 | bloc1s8 | dbnd | hps7 | my031 | sdy |
描述 | Dystrobrevin结合蛋白1 |
参考 | MIM:607145|HGNC:HGNC:17328|Ensembl:ENSG0000000047579|HPRD:06190|Vega:Otthumg0000000014295 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 6p22.3 |
Pascal P值 | 0.549 |
Sherlock P值 | 0.57 |
胎儿β | 0.755 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 尾状基底神经节 海马 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
CV:GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 1 |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
协会 | 组合的优势比方法(Sun等。2008),协会研究 | 3 | 链接到Szgene |
GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR:0.0159 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症的关键字相同:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关的关键字的命中:1 | |
网络 | 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 | PPI网络中最短路径的贡献:33.8114 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG23819836 | 6 | 15663134 | DTNBP1 | 3.145e-4 | -0.197 | 0.04 | DMG:Wockner_2014 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS10508654 | Chr10 | 23104638 | DTNBP1 | 84062 | 0.14 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/DTNBP1_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0005515 | 蛋白质结合 | IEA | - | |
GO:0042802 | 相同的蛋白质结合 | IPI | 15102850 | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0007601 | 视觉感知 | IEA | - | |
去:0006996 | Organelle组织 | ISS | - | |
GO:0050896 | 对刺激的反应 | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
GO:0030424 | 轴突 | ISS | 神经元,轴突,神经递质(GO期限:6) | - |
去:0005634 | 核 | ISS | - | |
去:0005737 | 细胞质 | IEA | - | |
去:0005737 | 细胞质 | ISS | - | |
GO:0042383 | 肌膜 | ISS | - |
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | 资源 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|---|
ABI3 | nesh |SSH3BP3 | 阿比家族,成员3 | 两个杂交 | Biogrid | 16189514 |
arfip2 | POR1 | ADP-核糖基化因子相互作用蛋白2 | 两个杂交 | Biogrid | 16189514 |
bloc1s1 | blos1 |FLJ39337 |FLJ97089 |GCN5L1 |MGC87455 |Micoa |RT14 | 溶酶体细胞器复合物1,亚基1的生物发生1 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 15102850 |
bloc1s2 | blos2 |FLJ30135 |MGC10120 |RP11-316M21.4 | 溶酶体细胞器复合物1,亚基2的生物发生2 | - | HPRD,Biogrid | 15102850 |
bloc1s3 | blos3 |FLJ26641 |FLJ26676 |HPS8 |RP | 溶酶体细胞器复合物1,亚基3的生物发生3 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 15102850 |
CCND3 | - | Cyclin D3 | 两个杂交 | Biogrid | 16189514 |
CMYA5 | C5orf10 |DKFZP451G182 |DKFZP451G223 |DTNBP2 |spryd2 |Trim76 | 心肌病相关5 | - | HPRD | 14688250 |
CNO | BCAS4L |FLJ11230 | 卡布奇诺同源物(鼠标) | - | HPRD | 15102850 |
DGCR6L | FLJ10666 | Digeorge综合征关键区域基因6样 | 两个杂交 | Biogrid | 16189514 |
DTNA | D18S892E |drp3 |DTN |FLJ96209 |LVNC1 | Dystrobrevin,Alpha | - | HPRD | 11316798 |
DTNB | MGC17163 |MGC57126 | Dystrobrevin,Beta | - | HPRD | 11316798 |
静音 | DKFZP686E2287 |亩 | 柔和的同源物(小鼠) | 静音与动力难题相互作用。 | 绑定 | 15102850 |
静音 | DKFZP686E2287 |亩 | 柔和的同源物(小鼠) | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 两个杂交 |
Biogrid | 15102850 |
PLDN | PA |苍白 | pallidin同源物(鼠标) | pallidin与动物难题相互作用。 | 绑定 | 15102850 |
PLDN | PA |苍白 | pallidin同源物(鼠标) | - | HPRD,Biogrid | 15102850 |
Snapin | 快照 | 快速相关的蛋白质 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 两个杂交 |
Biogrid | 15102850 |
Snapin | 快照 | 快速相关的蛋白质 | Snapin与dysbindin相互作用。 | 绑定 | 15102850 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Reactome膜贩运 | 129 | 74 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome Trans Golgi网络囊泡芽 | 60 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome Golgi相关囊泡生物发生 | 53 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿霉素DN的Graessmann凋亡 | 1781年 | 1082 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Graessmann对MC和阿霉素DN的反应 | 770 | 415 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
狮子转移 | 539 | 324 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
FLI1和DAX1 DN的Garcia目标 | 176 | 104 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Stark前额叶皮层22Q11删除DN | 517 | 309 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伊万诺娃造血早期祖先 | 532 | 309 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pilon KLF1靶向DN | 1972年 | 1213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |