基因页:NSRP1
概括?
基因 | 84081 |
象征 | NSRP1 |
同义词 | CCDC55 | HSPC095 | NSRP70 |
描述 | 核斑点调节蛋白1 |
参考 | MIM:616173|HGNC:HGNC:25305|ENSEMBL:ENSG00000126653|HPRD:08536|Vega:Otthumg00000132754 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 17q11.2 |
Pascal P值 | 0.094 |
Sherlock P值 | 0.59 |
胎儿β | -0.445 |
主持人 | 小脑 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS3785961 | CHR17 | 27591324 | CCDC55 | 84081 | 0.15 | 顺式 | ||
RS12235266 | Chr9 | 8302478 | CCDC55 | 84081 | 0.12 | 反式 | ||
RS16924671 | Chr9 | 8309533 | CCDC55 | 84081 | 0.06 | 反式 | ||
RS16998308 | Chrx | 32442345 | CCDC55 | 84081 | 0.17 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/NSRP1_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23岁)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
哈马凋亡通过Trail Up | 584 | 356 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nikolsky乳腺癌17q11 Q21 Amplicon | 133 | 78 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nouzova维甲酸和H4乙酰化 | 143 | 85 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伊万诺娃造血干细胞长期 | 302 | 191 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
道格拉斯BMI1靶向DN | 314 | 188 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Katsanou Elavl1靶向DN | 148 | 88 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Fortschegger PHF8靶向 | 279 | 155 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 | 1839年 | 928 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |