基因页:BCAR3
概括?
基因 | 8412 |
象征 | BCAR3 |
同义词 | NSP2 | SH2D3B |
描述 | 乳腺癌抗雌激素抵抗3 |
参考 | MIM:604704|HGNC:HGNC:973|ENSEMBL:ENSG00000137936|HPRD:05268|Vega:Otthumg0000000010301 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 1p22.1 |
Pascal P值 | 0.627 |
Sherlock P值 | 0.188 |
胎儿β | -0.992 |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DNM:Fromer_2014 | 整个外显子组测序分析 | 这项研究报道了WES对623个精神分裂症三重奏的研究,该研究使用基因组DNA报告了DNM。 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
DNM表
基因 | 染色体 | 位置 | 参考 | alt | 成绩单 | AA更改 | 突变类型 | 筛 | CG46 | 特征 | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
BCAR3 | CHR1 | 94057915 | G | 一个 | NM_001261408 NM_001261409 NM_001261410 NM_003567 NR_034091 |
。 。 。 。 。 |
沉默的 沉默的 沉默的 沉默的 npcrna |
精神分裂症 | DNM:Fromer_2014 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS12490747 | CHR3 | 9092889 | BCAR3 | 8412 | 0.04 | 反式 | ||
RS17021996 | CHR4 | 147754818 | BCAR3 | 8412 | 0.13 | 反式 | ||
RS17061935 | CHR6 | 101873751 | BCAR3 | 8412 | 0.08 | 反式 | ||
RS17080825 | CHR6 | 119411222 | BCAR3 | 8412 | 0.13 | 反式 | ||
RS2023879 | CHR7 | 51038201 | BCAR3 | 8412 | 0.11 | 反式 | ||
RS2068673 | CHR12 | 60333402 | BCAR3 | 8412 | 8.293E-5 | 反式 | ||
RS2655880 | CHR12 | 60797980 | BCAR3 | 8412 | 0.13 | 反式 | ||
RS10784054 | CHR12 | 60822443 | BCAR3 | 8412 | 0.15 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/BCAR3_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23岁)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
SBNO1 | 0.93 | 0.93 |
KIAA0232 | 0.93 | 0.94 |
KIAA1109 | 0.92 | 0.94 |
mycbp2 | 0.92 | 0.92 |
Pikfyve | 0.91 | 0.93 |
VPS13D | 0.91 | 0.93 |
DMXL1 | 0.91 | 0.93 |
kif3a | 0.90 | 0.91 |
Ash1l | 0.90 | 0.93 |
kif21a | 0.90 | 0.91 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
C1orf61 | -0.61 | -0.73 |
增强 | -0.61 | -0.66 |
AF347015.21 | -0.60 | -0.57 |
C1orf54 | -0.60 | -0.66 |
Rhoc | -0.59 | -0.65 |
VAMP5 | -0.57 | -0.57 |
Metrn | -0.57 | -0.59 |
higd1b | -0.57 | -0.57 |
DBI | -0.56 | -0.62 |
AF347015.31 | -0.56 | -0.55 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
PID CDC42 REG途径 | 30 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Fulcher炎症反应凝集素与LPS | 579 | 346 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ENK UV响应角质形成细胞DN | 485 | 334 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
林格伦膀胱癌群集3 | 329 | 196 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dacosta UV响应通过ERCC3 DN | 855 | 609 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dacosta UV响应通过ERCC3公共DN | 483 | 336 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Amit EGF响应480 HELA | 164 | 118 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿米特血清反应120 MCF10A | 65 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
克莱因原发性积液淋巴瘤DN | 58 | 42 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
HALMOS CEBPA目标DN | 46 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nouzova维甲酸和H4乙酰化 | 143 | 85 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由组蛋白乙酰化调节的玛丽亚达森 | 83 | 49 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
外邦紫外线响应集群D6 | 37 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
外邦紫外线高剂量DN | 312 | 203 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dazard对UV NHEK DN的反应 | 318 | 220 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
贝尔德糖尿病性肾病DN | 434 | 302 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Durchdewald皮肤致癌DN | 264 | 168 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伽玛辐射8G后的生存率不佳 | 95 | 62 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
营地结肠癌拷贝编号DN | 74 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Boquest干细胞DN | 216 | 143 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 | 1069 | 729 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Fournier腺泡开发2 | 277 | 172 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dorn腺病毒感染12小时 | 29 | 18 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
DORN腺病毒感染24小时DN | 43 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
DORN腺病毒感染32小时DN | 39 | 28 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
DORN腺病毒感染48小时DN | 40 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BHAT ESR1通过AKT1 DN目标 | 82 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bruins通过TP53组A的UVC响应 | 898 | 516 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
棕熊UVC响应很晚 | 317 | 190 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Smad2或Smad3的Koinuma目标 | 824 | 528 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ERBB2同工型的Pedersen转移7 | 403 | 240 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
wakabayashi脂肪生成PPARG RXRA绑定8D | 882 | 506 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
wakabayashi脂肪形成PPARG RXRA与H4K20me1标记结合 | 145 | 82 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang 1类由EGF瞬时诱导 | 516 | 308 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang EGF间隔DN | 214 | 124 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |