基因页:ppp1r1b
概括?
基因 | 84152 |
象征 | ppp1r1b |
同义词 | darpp-32 | darpp32 |
描述 | 蛋白质磷酸酶1调节抑制剂亚基1B |
参考 | MIM:604399|HGNC:HGNC:9287|ENSEMBL:ENSG00000131771|HPRD:05097|Vega:Otthumg00000133210 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 17q12 |
Pascal P值 | 8.688e-4 |
Sherlock P值 | 0.97 |
胎儿β | -0.397 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG22834172 | 17 | 37774349 | ppp1r1b | 2.92E-9 | -0.013 | 2.05E-6 | DMG:JAFFE_2016 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS7098073 | Chr10 | 108641448 | ppp1r1b | 84152 | 0.14 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/PPP1R1B_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0004864 | 蛋白质磷酸酶抑制剂活性 | 塔斯 | 10604473 | |
去:0004860 | 蛋白激酶抑制剂活性 | 塔斯 | 10604473 | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0006350 | 转录 | IEA | - | |
去:0007165 | 信号转导 | 塔斯 | 10604473 | |
去:0007621 | 女性接受性负调节 | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005737 | 细胞质 | nas | - |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Biocarta CK1途径 | 17 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
GPCR的反应组信号传导 | 920 | 449 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome阿片类药物信号传导 | 78 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome darpp 32事件 | 25 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bertucci髓质与导管乳腺癌DN | 169 | 118 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NUP98 HOXA9融合8D DN的Takeda目标 | 205 | 127 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NUP98 HOXA9 Fusion 10D DN的Takeda目标 | 142 | 90 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
pDGFB DN的Johansson神经胶质作用 | 21 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mantovani NFKB目标 | 43 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mantovani病毒GPCR信号向上 | 86 | 54 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Stark前额叶皮层22Q11删除 | 195 | 138 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nikolsky乳腺癌17q11 Q21 Amplicon | 133 | 78 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 | 1069 | 729 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
lu eszh2靶向 | 295 | 155 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CTBP1的Purbey目标不是SATB1 DN | 448 | 282 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
SPI1和FLI1的Juban目标 | 115 | 73 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
前列腺癌模型中的Acevedo FGFR1靶标 | 289 | 184 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
林乳腺干细胞DN | 428 | 246 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
mir-330 | 600 | 607 | 1A,M8 | HSA-MIR-330脑 | GCAAAGCACGGCCUGCAGAGA |