基因页：STX7
Summary？
| 基因ID | 8417 |
| Symbol | STX7 |
| 同义词 | - |
| 描述 | 语法7 |
| 参考 | MIM：603217|HGNC：HGNC：11442|HPRD:04449| |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 6Q23.1 |
| Pascal P值 | 0.073 |
| Sherlock P值 | 0.459 |
| 主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
| 支持 | 细胞内贩运 G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-CONSESUS G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-MOUSE-PSD-CONSUS G2CDB.HUMAN_CLATHRIN G2Cdb.human_Synaptosome |
基因in Data Sources
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| PMID：cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
| Literature | 高通量文献搜索 | Co-occurance with Schizophrenia keywords: schizophrenia,schizophrenias | 点击显示详细信息 |
Section I. Genetics and epigenetics annotation
EQTL注释
EQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | eQTL type |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS712785 | CHR3 | 7485713 | STX7 | 8417 | 0.18 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
时间变化的基因表达（brainspan）
Footnote:
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| HS3ST1 | 0.67 | 0.75 |
| KCNJ11 | 0.66 | 0.82 |
| SCRT1 | 0.66 | 0.79 |
| EPHB6 | 0.66 | 0.75 |
| OSBP2 | 0.65 | 0.81 |
| POU6F1 | 0.64 | 0.80 |
| KLC2 | 0.64 | 0.79 |
| iffo1 | 0.64 | 0.79 |
| LRRC4 | 0.63 | 0.82 |
| ARHGEF11 | 0.63 | 0.84 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| AF347015.21 | -0.46 | -0.67 |
| AF347015.31 | -0.46 | -0.61 |
| ACSF2 | -0.44 | -0.62 |
| MT-CO2 | -0.44 | -0.60 |
| S100A16 | -0.44 | -0.59 |
| AF347015.8 | -0.43 | -0.60 |
| AP002478.3 | -0.43 | -0.63 |
| AF347015.2 | -0.42 | -0.55 |
| AL139819.3 | -0.42 | -0.59 |
| DBI | -0.42 | -0.64 |
第三节。基因本体论注释
| Molecular function | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0005484 | SNAP受体活性 | IEA | - | |
| Biological process | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0006886 | 细胞内蛋白转运 | IEA | - | |
| 去：0006892 | 高尔基囊泡介导的转运 | 助教 | 9358037 | |
| GO：0016192 | vesicle-mediated transport | IEA | - | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0005768 | 内体 | IEA | - | |
| GO:0016020 | 膜 | IEA | - | |
| GO:0016021 | 膜不可或缺 | IEA | - | |
| GO：0031901 | 早期内体膜 | IEA | - |
Section IV. Protein-protein interaction annotation
| Interactors | 别名b | 官方全名b | 实验 | Source | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|---|
| ENTPD2 | CD39L1 |NTPDase-2 | 核苷三磷酸二磷酸2 | - | HPRD | 11591653 |
| 纳帕 | Snapa | N-乙基马来酰亚胺敏感因子附着蛋白，α | - | HPRD，Biogrid | 9417091 |
| SNAP29 | Cednik |FLJ21051 |SNAP-29 | 突触体相关蛋白，29KDA | - | HPRD，Biogrid | 9852078|11423532 |
| STX6 | - | 语法6 | - | HPRD，Biogrid | 11278762 |
| STX8 | 碳水化合物 | 语法8 | - | HPRD，Biogrid | 12175335 |
| VAMP7 | SYBL1 | TI-VAMP | VAMP-7 | vesicle-associated membrane protein 7 | 体外 体内 |
Biogrid | 11278762|12175335 |
| VAMP7 | SYBL1 | TI-VAMP | VAMP-7 | vesicle-associated membrane protein 7 | - | HPRD | 11278762 | 12175335 |
| VAMP8 | EDB | 囊泡相关的膜蛋白8（内折） | - | HPRD，Biogrid | 11278762 |
| VPS11 | end1 |pep5 |RNF108 |HVPS11 | 液泡蛋白排序11个同源物（S. cerevisiae） | VPS11与STX7（Syntaxin-7）相互作用。这种相互作用是基于未指定物种的人VPS11和STX7（Syntaxin-7）之间的相互作用进行建模的。 | 绑定 | 14623309 |
| VPS11 | end1 |pep5 |RNF108 |HVPS11 | 液泡蛋白排序11个同源物（S. cerevisiae） | - | HPRD，Biogrid | 11382755 |
| VPS16 | HVPS16 | vacuolar protein sorting 16 homolog (S. cerevisiae) | - | HPRD | 11382755 |
| VPS18 | KIAA1475 | PEP3 | 液泡蛋白排序18个同源物（酿酒酵母） | VPS18与STX7（Syntaxin-7）相互作用。这种相互作用是基于未指定物种的人类VPS18和STX7（Syntaxin-7）之间的相互作用进行建模的。 | 绑定 | 14623309 |
| VPS18 | KIAA1475 | PEP3 | 液泡蛋白排序18个同源物（酿酒酵母） | - | HPRD，Biogrid | 11382755 |
| VTI1A | mvti1 |VTI1-RP2 | 通过与T-Snares同源1A（酵母）相互作用的囊泡运输 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 11101518 |
| VTI1B | VTI1 |vti1 like |VTI1L |VTI2 | vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B (yeast) | - | HPRD，Biogrid | 12114520|12175335 |
Section V. Pathway annotation
第六节。microRNA注释
| miRNA family | 目标位置 | miRNA ID | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| miR-361 | 163 | 169 | M8 | HSA-MIR-361脑 | uuaucagaaucuccagggguac |