基因页面:CHD6
总结吗?
| GeneID | 84181年 |
| 象征 | CHD6 |
| 同义词 | CHD-6 | CHD5 | RIGB |
| 描述 | chromodomain解旋酶DNA结合蛋白6 |
| 参考 | MIM: 616114|HGNC: HGNC: 19057|运用:ENSG00000124177|HPRD: 13049|织女:OTTHUMG00000032487 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 20日12 |
| 帕斯卡假定值 | 0.127 |
| 夏洛克假定值 | 0.59 |
| 胎儿β | 0.503 |
| DMG | 1(#研究) |
| eGene | 迈尔斯的顺式和反式 |
| 支持 | CompositeSet 达内尔FMRP目标 Ascano FMRP目标 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| DMG: Jaffe_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括2104探针/论文认定与深圳病人(n = 108)比136年控制在Bonferroni-adjusted P < 0.05。 | 1 |
| GO_Annotation | neuro-related关键字映射到基因本体论注释 | 支安打与neuro-related关键词:1 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
不同甲基化基因| 探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| cg21545849 | 20. | 40247209 | CHD6 | 1.55平台以及 | -0.011 | 5 e - | DMG: Jaffe_2016 |
eQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs7084863 | chr10 | 6753797 | CHD6 | 84181年 | 0.06 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
第三部分。基因本体论注释
| 分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去:0000166 | 核苷酸绑定 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0003677 | DNA结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0003682 | 染色质绑定 | NAS | 12592387 | |
| 去:0005524 | ATP结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0016787 | 水解酶活性 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0008026 | ATP-dependent解旋酶的活动 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0007399 | 神经系统发育 | NAS | 神经突(术语层面:5) | 12592387 |
| 去:0006333 | 染色质组装或拆卸 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0006355 | 依赖dna的转录调节 | NAS | 12592387 | |
| 去:0006350 | 转录 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0006338 | 染色质重塑 | NAS | 12592387 | |
| 蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0000785 | 染色质 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0005634 | 核 | NAS | 12592387 |
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 徐gh自分泌目标DN | 142年 | 94年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| KRIGE TOSEDOSTAT反应6小时 | 953年 | 554年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| KRIGE TOSEDOSTAT反应24小时 | 783年 | 442年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DN YOSHIMURA MAPK8目标 | 366年 | 257年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| VANTVEER乳腺癌ESR1 | 167年 | 99年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 棕熊短波紫外线反应通过TP53集团 | 898年 | 516年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 艾布拉姆森与问卷调查 | 45 | 33 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 由1日EGF ZWANG瞬变脉冲 | 1839年 | 928年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
部分VI. microRNA注释
| microrna的家庭 | 目标位置 | microrna的ID | microrna的seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir - 143 | 1562年 | 1568年 | 1 | hsa - mir - 143大脑 | UGAGAUGAAGCACUGUAGCUCA |
| mir - 194 | 1425年 | 1432年 | 1、m8 | hsa - mir - 194 | UGUAACAGCAACUCCAUGUGGA |
| miR-26 | 1296年 | 1302年 | 1 | hsa-miR-26a大脑 | UUCAAGUAAUCCAGGAUAGGC |
| hsa-miR-26b深圳 | UUCAAGUAAUUCAGGAUAGGUU | ||||
| mir - 496 | 1543年 | 1549年 | 1 | hsa - mir - 496 | AUUACAUGGCCAAUCUC |
| mir - 504 | 162年 | 168年 | m8 | hsa - mir - 504 | AGACCCUGGUCUGCACUCUAU |
| mir - 543 | 1548年 | 1554年 | 1 | hsa - mir - 543 | AAACAUUCGCGGUGCACUUCU |