基因页：LTBP4
概括？
| 基因 | 8425 |
| 象征 | LTBP4 |
| 同义词 | ARCL1C | LTBP-4 | LTBP4L | LTBP4S |
| 描述 | 潜在转化生长因子β结合蛋白4 |
| 参考 | MIM：604710|HGNC：HGNC：6717|Ensembl：ENSG00000090006|HPRD：05274|Vega：Otthumg00000182635 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 19Q13.1-Q13.2 |
| Pascal P值 | 0.656 |
| 胎儿β | -0.262 |
| DMG | 1（＃研究） |
| 主持人 | 小脑半球 小脑 迈尔斯的顺式和跨性别 元 |
| 支持 | Ascano FMRP目标 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 | 2 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG24836281 | 19 | 41100790 | LTBP4 | 2.607E-4 | 0.508 | 0.038 | DMG：Wockner_2014 |
| CG18834361 | 19 | 41131889 | LTBP4 | 4.345e-4 | 0.266 | 0.045 | DMG：Wockner_2014 |
EQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS11066476 | CHR12 | 113465366 | LTBP4 | 8425 | 0.01 | 反式 | ||
| RS2444983 | CHR15 | 33443919 | LTBP4 | 8425 | 0.19 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| clasp2 | 0.94 | 0.94 |
| aasdhppt | 0.93 | 0.93 |
| Shoc2 | 0.92 | 0.93 |
| KPNA3 | 0.92 | 0.94 |
| SLC25A36 | 0.92 | 0.93 |
| arfgef1 | 0.92 | 0.94 |
| IBTK | 0.91 | 0.92 |
| Rabgef1 | 0.91 | 0.92 |
| MORC3 | 0.91 | 0.93 |
| FAM160B1 | 0.91 | 0.93 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| MT-CO2 | -0.78 | -0.81 |
| FXYD1 | -0.77 | -0.80 |
| AF347015.31 | -0.76 | -0.79 |
| AF347015.33 | -0.75 | -0.76 |
| AF347015.8 | -0.75 | -0.79 |
| mt-cyb | -0.75 | -0.77 |
| higd1b | -0.74 | -0.79 |
| AF347015.27 | -0.73 | -0.76 |
| AF347015.21 | -0.72 | -0.77 |
| AF347015.2 | -0.72 | -0.75 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 家长mtor信号向上 | 567 | 375 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Davicioni分子臂与ERMS DN | 182 | 111 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 周的炎症反应生活 | 485 | 293 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mullighan NPM1突变签名1 DN | 126 | 86 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mullighan NPM1突变签名2 DN | 77 | 46 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mullighan NPM1签名3 DN | 162 | 116 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 周的炎症反应fima | 544 | 308 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 周炎性反应lps up | 431 | 237 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Berenjeno由Rhoa DN转变 | 394 | 258 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Darwiche皮肤肿瘤启动子 | 142 | 96 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Darwiche Papilloma风险低DN | 165 | 107 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Darwiche Papilloma风险高DN | 180 | 110 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| darwiche鳞状细胞癌 | 146 | 104 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 黄端癌DN | 82 | 53 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Dairkee Tert目标 | 380 | 213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Magrangeas多发性骨髓瘤IgLL与IgLK DN | 24 | 18 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Sansom APC目标DN | 366 | 238 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Taci的Moreaux多发性骨髓瘤 | 412 | 249 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yamazaki TCEB3靶向DN | 215 | 132 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 麦克道尔急性肺损伤DN | 48 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿塞维多肝肿瘤与正常的邻近组织DN | 274 | 165 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Boquest干细胞培养与新鲜 | 425 | 298 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 西肾上腺皮质肿瘤DN | 546 | 362 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 甜肺癌Kras DN | 435 | 289 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| MILI假足趋化性DN | 457 | 302 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Poola侵入性乳腺癌DN | 134 | 83 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Meissner NPC HCP带有H3K4ME2 | 491 | 319 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Bruins通过TP53组B响应UVC响应 | 549 | 316 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 棕熊UVC响应迟到 | 1137 | 655 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lee BMP2目标 | 745 | 475 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| CTBP1的PURBEY目标不是SATB1 | 344 | 215 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 巨噬细胞的库马尔病原体负荷 | 275 | 155 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kumar自噬网络 | 71 | 46 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 林乳腺干细胞向上 | 489 | 314 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| lim乳腺腔内成熟DN | 99 | 74 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| NABA ECM糖蛋白 | 196 | 99 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| NABA核心母质 | 275 | 148 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| NABA矩阵 | 1028 | 559 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |