概括
基因 84251
象征 SGIP1
同义词 -
描述 SH3核蛋白Grb2样(内菲尔)相互作用蛋白1
参考 MIM:611540|HGNC:HGNC:25412|ENSEMBL:ENSG00000118473|HPRD:10910|Vega:Otthumg00000009161
基因类型 蛋白质编码
地图位置 1p31.3
Pascal P值 0.382
Sherlock P值 0.003
胎儿β -0.816
支持 G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-CONSESUS
G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL
G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-MOUSE-PSD-CONSUS
COMPOSITESET
Darnell FMRP目标

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
GSMA_IIA 基因组扫描荟萃分析(所有样品) PSR:0.02692
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005737 细胞质 艾达 11256614

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
多德鼻咽癌DN 1375 806 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rashi对电离辐射6的响应6 84 54 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martoriati MDM4靶向胎儿肝DN 514 319 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伊万诺娃造血干细胞长期 302 191 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CUI TCF21目标2 DN 830 547 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CUI TCF21靶向DN 31 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由HPV31 UP永生 84 55 该途径中的所有SZGR 2.0基因
monnier tradiatiation肿瘤逃脱 393 244 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zheng Foxp3靶标在T淋巴细胞中 12 7 该途径中的所有SZGR 2.0基因
林乳腺干细胞向上 489 314 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang仅通过第二EGF脉冲瞬时向上 1725年 838 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-136 1840年 1847年 1A,M8 HSA-MIR-136 Acuccauuuuuuugaugaugaugga
MiR-200BC/429 156 162 M8 HSA-MIR-200B uaauacugccugguaaugaugac
HSA-MIR-200C uaauacugccggguaaugaugg
HSA-MIR-429 uaauacuguguguguguguaaaaaccgu
mir-204/211 696 703 1A,M8 HSA-MIR-204 Uucccuuugucauccuaugccu
HSA-MIR-211 uucccuuugucauccuucgccu
mir-33 649 655 1a HSA-MIR-33 Gugcauuguuguugcauug
HSA-MIR-33B Gugcauugcuguugcauugca
mir-362 13 19 M8 HSA-MIR-362 aauccuuggaaccuaggugugugugugugagu
mir-452 651 657 M8 HSA-MIR-452 UguuugcaggaaacugagaC
mir-505 325 331 1a HSA-MIR-505 gucaacuugcugguuccuc