基因页面:CHCHD6
总结吗?
| GeneID | 84303年 |
| 象征 | CHCHD6 |
| 同义词 | CHCM1 | Mic25 | PPP1R23 |
| 描述 | coiled-coil-helix-coiled-coil-helix域包含6 |
| 参考 | MIM: 615634|HGNC: HGNC: 28184|运用:ENSG00000159685|HPRD: 13047|织女:OTTHUMG00000159601 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 3 q21.3 |
| 帕斯卡假定值 | 0.057 |
| 夏洛克假定值 | 0.15 |
| 胎儿β | -0.125 |
| DMG | 1(#研究) |
| eGene | 迈尔斯的顺式和反式 |
| 支持 | G2Cdb.human_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-CONSENSUS G2Cdb.human_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL G2Cdb.human_BAYES-COLLINS-MOUSE-PSD-CONSENSUS G2Cdb.human_mitochondria CompositeSet |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| DMG: Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括4641个不同甲基化探针对应2929个独特的基因之间的精神分裂症患者(n = 24)和控制(n = 24)。 | 1 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
不同甲基化基因| 探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| cg00336291 | 3 | 126668519 | CHCHD6 | 2.77 e-5 | 0.29 | 0.018 | DMG: Wockner_2014 |
eQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs4127445 | chr18 | 65421319 | CHCHD6 | 84303年 | 0.2 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 里克曼肿瘤分化好与差 | 236年 | 139年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 松田自然杀伤细胞分化 | 475年 | 313年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 伊万诺娃造血干细胞和祖 | 681年 | 420年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BOYLAN多发性骨髓瘤C D | 139年 | 95年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| YOSHIMURA MAPK8目标了 | 1305年 | 895年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 陈代谢症侯群网络 | 1210年 | 725年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 棕熊短波紫外线反应早期晚了 | 317年 | 190年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| PURBEY CTBP1没有SATB1的目标 | 344年 | 215年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 若林史江脂肪生成PPARG 8 d | 658年 | 397年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |