概括
基因 84310
象征 C7orf50
同义词 YCR016W
描述 染色体7开放阅读框50
参考 HGNC:HGNC:22421|ENSEMBL:ENSG00000146540|HPRD:14413|Vega:Otthumg00000151477
基因类型 蛋白质编码
地图位置 7p22.3
Pascal P值 0.864
Sherlock P值 0.213
胎儿β -0.587
DMG 1(#研究)
主持人 前扣带回皮层BA24
尾状基底神经节
皮质
额叶皮质BA9
海马
伏隔核基底神经节
梭子基底神经节

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 2

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG14525935 7 1105730 C7orf50 2.45e-4 -0.425 0.037 DMG:Wockner_2014
CG16190225 7 1163456 C7orf50 4.452E-4 -0.316 0.045 DMG:Wockner_2014

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS113145978 7 1000578 C7orf50 ENSG00000146540.10 4.223E-9 0 177318 gtex_brain_ba24
RS73257955 7 1007014 C7orf50 ENSG00000146540.10 4.617E-9 0 170882 gtex_brain_ba24
RS78461900 7 1007033 C7orf50 ENSG00000146540.10 4.617E-9 0 170863 gtex_brain_ba24
RS6943665 7 1010909 C7orf50 ENSG00000146540.10 1.513E-10 0 166987 gtex_brain_ba24
RS6462277 7 1011968 C7orf50 ENSG00000146540.10 2.621E-10 0 165928 gtex_brain_ba24
RS56242247 7 1012948 C7orf50 ENSG00000146540.10 2.621E-10 0 164948 gtex_brain_ba24
RS55729719 7 1013180 C7orf50 ENSG00000146540.10 2.569E-10 0 164716 gtex_brain_ba24
RS186969173 7 1013904 C7orf50 ENSG00000146540.10 8.002e-11 0 163992 gtex_brain_ba24
RS112587865 7 1015271 C7orf50 ENSG00000146540.10 2.561E-10 0 162625 gtex_brain_ba24
RS140499695 7 1020176 C7orf50 ENSG00000146540.10 4.579E-9 0 157720 gtex_brain_ba24
RS57492282 7 1021860 C7orf50 ENSG00000146540.10 3.971E-7 0 156036 gtex_brain_ba24
RS73259905 7 1023364 C7orf50 ENSG00000146540.10 3.073E-7 0 154532 gtex_brain_ba24
RS80133931 7 1027286 C7orf50 ENSG00000146540.10 7.524e-11 0 150610 gtex_brain_ba24
RS11438426 7 1027569 C7orf50 ENSG00000146540.10 1.485e-12 0 150327 gtex_brain_ba24
RS60892210 7 1031170 C7orf50 ENSG00000146540.10 3.44e-11 0 146726 gtex_brain_ba24
RS200978047 7 1031824 C7orf50 ENSG00000146540.10 6.693e-11 0 146072 gtex_brain_ba24
RS57858751 7 1032618 C7orf50 ENSG00000146540.10 3.951e-11 0 145278 gtex_brain_ba24
RS56109702 7 1032919 C7orf50 ENSG00000146540.10 2.041E-7 0 144977 gtex_brain_ba24
RS11977 7 1036944 C7orf50 ENSG00000146540.10 7.418e-12 0 140952 gtex_brain_ba24
RS11559183 7 1037025 C7orf50 ENSG00000146540.10 6.137e-11 0 140871 gtex_brain_ba24
RS7798636 7 1038189 C7orf50 ENSG00000146540.10 2.41e-11 0 139707 gtex_brain_ba24
RS60918895 7 1039036 C7orf50 ENSG00000146540.10 2.13e-7 0 138860 gtex_brain_ba24
RS112072378 7 1039400 C7orf50 ENSG00000146540.10 4.185e-9 0 138496 gtex_brain_ba24
RS73264010 7 1040477 C7orf50 ENSG00000146540.10 2.129E-7 0 137419 gtex_brain_ba24
RS146822086 7 1041940 C7orf50 ENSG00000146540.10 4.234E-9 0 135956 gtex_brain_ba24
RS111211004 7 1042579 C7orf50 ENSG00000146540.10 1.651E-9 0 135317 gtex_brain_ba24
RS112369387 7 1044860 C7orf50 ENSG00000146540.10 2.467E-9 0 133036 gtex_brain_ba24
RS73264028 7 1045455 C7orf50 ENSG00000146540.10 2.049E-7 0 132441 gtex_brain_ba24
RS200085503 7 1045631 C7orf50 ENSG00000146540.10 9.876E-9 0 132265 gtex_brain_ba24
RS73264032 7 1045749 C7orf50 ENSG00000146540.10 2.679E-8 0 132147 gtex_brain_ba24
RS75818004 7 1047572 C7orf50 ENSG00000146540.10 4.301E-9 0 130324 gtex_brain_ba24
RS56107018 7 1048112 C7orf50 ENSG00000146540.10 2.467E-9 0 129784 gtex_brain_ba24
RS56097140 7 1048183 C7orf50 ENSG00000146540.10 2.467E-9 0 129713 gtex_brain_ba24
RS79396168 7 1048928 C7orf50 ENSG00000146540.10 4.294E-9 0 128968 gtex_brain_ba24
RS75083636 7 1050800 C7orf50 ENSG00000146540.10 4.287E-9 0 127096 gtex_brain_ba24
RS79396675 7 1055047 C7orf50 ENSG00000146540.10 4.268E-9 0 122849 gtex_brain_ba24
RS73265918 7 1056809 C7orf50 ENSG00000146540.10 8.365e-8 0 121087 gtex_brain_ba24
RS74791540 7 1061913 C7orf50 ENSG00000146540.10 4.287E-9 0 115983 gtex_brain_ba24
RS11768895 7 1063691 C7orf50 ENSG00000146540.10 1.102E-6 0 114205 gtex_brain_ba24
RS11764817 7 1064610 C7orf50 ENSG00000146540.10 1.1E-6 0 113286 gtex_brain_ba24
RS112554101 7 1065535 C7orf50 ENSG00000146540.10 1.41E-6 0 112361 gtex_brain_ba24
RS143361185 7 1067762 C7orf50 ENSG00000146540.10 1.208E-6 0 110134 gtex_brain_ba24
RS111823776 7 1071032 C7orf50 ENSG00000146540.10 6.176E-7 0 106864 gtex_brain_ba24
RS181054388 7 1080878 C7orf50 ENSG00000146540.10 3.07E-7 0 97018 gtex_brain_ba24
RS111645884 7 1005142 C7orf50 ENSG00000146540.10 1.014E-6 0.01 172754 gtex_brain_putamen_basal
RS6462277 7 1011968 C7orf50 ENSG00000146540.10 2.61E-6 0.01 165928 gtex_brain_putamen_basal
RS56242247 7 1012948 C7orf50 ENSG00000146540.10 2.61E-6 0.01 164948 gtex_brain_putamen_basal
RS55729719 7 1013180 C7orf50 ENSG00000146540.10 2.613E-6 0.01 164716 gtex_brain_putamen_basal
RS186969173 7 1013904 C7orf50 ENSG00000146540.10 1.528E-6 0.01 163992 gtex_brain_putamen_basal
RS112587865 7 1015271 C7orf50 ENSG00000146540.10 1.58e-6 0.01 162625 gtex_brain_putamen_basal
RS80133931 7 1027286 C7orf50 ENSG00000146540.10 7.229E-7 0.01 150610 gtex_brain_putamen_basal
RS60892210 7 1031170 C7orf50 ENSG00000146540.10 4.348e-7 0.01 146726 gtex_brain_putamen_basal
RS200978047 7 1031824 C7orf50 ENSG00000146540.10 7.725e-7 0.01 146072 gtex_brain_putamen_basal
RS11977 7 1036944 C7orf50 ENSG00000146540.10 1.85E-6 0.01 140952 gtex_brain_putamen_basal
RS7798636 7 1038189 C7orf50 ENSG00000146540.10 1.806E-6 0.01 139707 gtex_brain_putamen_basal
RS112583257 7 1091001 C7orf50 ENSG00000146540.10 1.089E-6 0.01 86895 gtex_brain_putamen_basal

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23岁)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Tong与PTTG1互动 57 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Koyama Sema3b靶向 292 168 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nikolsky乳腺癌7p22 Amplicon 38 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zhu CMV 24小时DN 91 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zhu CMV全部DN 128 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伊万诺娃造血中间祖先 149 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krige对Tosedostat 6小时DN的响应 911 527 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krige对Tosedostat 24小时DN的反应 1011 592 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多的正常组织与肝肿瘤相邻 174 96 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝癌 973 570 该途径中的所有SZGR 2.0基因
mirlet7a3的Brueckner目标 111 69 该途径中的所有SZGR 2.0基因
尼尔森·吉斯特(Nielsen Gist) 98 66 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gobert少突胶质细胞分化 570 339 该途径中的所有SZGR 2.0基因