基因页：CCDC115
概括？
| 基因 | 84317 |
| 象征 | CCDC115 |
| 同义词 | CDG2O | CCP1 |
| 描述 | 包含115 |
| 参考 | MIM：613734|HGNC：HGNC：28178|ENSEMBL：ENSG00000136710|HPRD：14428|Vega：Otthumg00000131631 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 2q21.1 |
| Pascal P值 | 0.126 |
| Sherlock P值 | 0.112 |
| 胎儿β | -0.071 |
| DMG | 1（＃研究） |
| 主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 元 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG（n = 108），而在Bonferroni调整后的P <0.05时，其中136个对照。 | 1 |
| GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR：0.023 | |
| GSMA_IIA | 基因组扫描荟萃分析（所有样品） | PSR：0.00755 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG06115535 | 2 | 131100015 | CCDC115 | 1.08e-7 | -0.008 | 2.35e-5 | DMG：JAFFE_2016 |
EQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS7132043 | CHR12 | 80968399 | CCDC115 | 84317 | 0.11 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0005764 | 溶酶体 | IEA | - |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 冷吉非替尼抵抗DN | 230 | 115 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 石匠食道癌发生 | 39 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 伊万诺娃造血早期祖先 | 532 | 309 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |