基因页：CCDC77
概括？
| 基因 | 84318 |
| 象征 | CCDC77 |
| 同义词 | - |
| 描述 | 包含77 |
| 参考 | HGNC：HGNC：28203|Ensembl：ENSG00000120647|HPRD：17485|Vega：Otthumg00000129214 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 12p13.33 |
| Pascal P值 | 0.789 |
| Sherlock P值 | 0.119 |
| 胎儿β | 1.614 |
| DMG | 1（＃研究） |
| 主持人 | 前扣带回皮层BA24 尾状基底神经节 小脑半球 皮质 额叶皮质BA9 海马 下丘脑 梭子基底神经节 元 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG（n = 108），而在Bonferroni调整后的P <0.05时，其中136个对照。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG07165616 | 12 | 498868 | CCDC77 | 6.9e-10 | -0.009 | 9.72E-7 | DMG：JAFFE_2016 |
EQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS486098 | 12 | 388657 | CCDC77 | ENSG00000120647.5 | 2.758E-7 | 0.01 | -110481 | gtex_brain_ba24 |
| RS189482670 | 12 | 402955 | CCDC77 | ENSG00000120647.5 | 2.129E-6 | 0.01 | -96183 | gtex_brain_ba24 |
| RS495316 | 12 | 383842 | CCDC77 | ENSG00000120647.5 | 2.629E-6 | 0.01 | -115296 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS1207322 | 12 | 387132 | CCDC77 | ENSG00000120647.5 | 1.628E-6 | 0.01 | -112006 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS507597 | 12 | 397404 | CCDC77 | ENSG00000120647.5 | 1.721E-7 | 0.01 | -101734 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS17800744 | 12 | 400466 | CCDC77 | ENSG00000120647.5 | 1.717E-7 | 0.01 | -98672 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS57022939 | 12 | 402647 | CCDC77 | ENSG00000120647.5 | 1.838E-6 | 0.01 | -96491 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS201806016 | 12 | 404455 | CCDC77 | ENSG00000120647.5 | 8.432e-7 | 0.01 | -94683 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS77854644 | 12 | 405043 | CCDC77 | ENSG00000120647.5 | 1.717E-7 | 0.01 | -94095 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS4980875 | 12 | 407504 | CCDC77 | ENSG00000120647.5 | 1.838E-6 | 0.01 | -91634 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS61906995 | 12 | 408770 | CCDC77 | ENSG00000120647.5 | 1.838E-6 | 0.01 | -90368 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS4980813 | 12 | 414287 | CCDC77 | ENSG00000120647.5 | 1.628E-6 | 0.01 | -84851 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS4980876 | 12 | 418777 | CCDC77 | ENSG00000120647.5 | 1.628E-6 | 0.01 | -80361 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS12582850 | 12 | 421234 | CCDC77 | ENSG00000120647.5 | 1.835E-6 | 0.01 | -77904 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS61906996 | 12 | 425473 | CCDC77 | ENSG00000120647.5 | 1.628E-6 | 0.01 | -73665 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS4980878 | 12 | 427077 | CCDC77 | ENSG00000120647.5 | 1.835E-6 | 0.01 | -72061 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS11608938 | 12 | 428693 | CCDC77 | ENSG00000120647.5 | 1.789E-7 | 0.01 | -70445 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS3213751 | 12 | 432666 | CCDC77 | ENSG00000120647.5 | 1.892E-6 | 0.01 | -66472 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS3815558 | 12 | 433151 | CCDC77 | ENSG00000120647.5 | 2.046E-6 | 0.01 | -65987 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS61907026 | 12 | 433900 | CCDC77 | ENSG00000120647.5 | 2.07E-7 | 0.01 | -65238 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS78998485 | 12 | 434755 | CCDC77 | ENSG00000120647.5 | 2.046E-6 | 0.01 | -64383 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS79839498 | 12 | 440257 | CCDC77 | ENSG00000120647.5 | 1.378E-7 | 0.01 | -58881 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS4980884 | 12 | 442354 | CCDC77 | ENSG00000120647.5 | 2.049E-6 | 0.01 | -56784 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS4980814 | 12 | 443795 | CCDC77 | ENSG00000120647.5 | 1.628E-6 | 0.01 | -55343 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS61907030 | 12 | 452232 | CCDC77 | ENSG00000120647.5 | 2.056E-7 | 0.01 | -46906 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS61907031 | 12 | 452325 | CCDC77 | ENSG00000120647.5 | 2.056E-7 | 0.01 | -46813 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS11615564 | 12 | 457843 | CCDC77 | ENSG00000120647.5 | 1.73E-7 | 0.01 | -41295 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS7135768 | 12 | 460226 | CCDC77 | ENSG00000120647.5 | 2.046E-6 | 0.01 | -38912 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS7965038 | 12 | 466176 | CCDC77 | ENSG00000120647.5 | 1.714E-7 | 0.01 | -32962 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS2041299 | 12 | 468019 | CCDC77 | ENSG00000120647.5 | 1.704E-7 | 0.01 | -31119 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS6489450 | 12 | 470428 | CCDC77 | ENSG00000120647.5 | 2.042E-6 | 0.01 | -28710 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS6489452 | 12 | 471476 | CCDC77 | ENSG00000120647.5 | 1.991E-7 | 0.01 | -27662 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS2098094 | 12 | 485095 | CCDC77 | ENSG00000120647.5 | 2.492E-6 | 0.01 | -14043 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS2159364 | 12 | 485608 | CCDC77 | ENSG00000120647.5 | 1.819E-6 | 0.01 | -13530 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS7977462 | 12 | 485791 | CCDC77 | ENSG00000120647.5 | 1.284E-6 | 0.01 | -13347 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS397743980 | 12 | 488640 | CCDC77 | ENSG00000120647.5 | 1.714E-7 | 0.01 | -10498 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS10744616 | 12 | 489205 | CCDC77 | ENSG00000120647.5 | 1.716E-6 | 0.01 | -9933 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS10774150 | 12 | 493443 | CCDC77 | ENSG00000120647.5 | 1.626E-6 | 0.01 | -5695 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS1860360 | 12 | 493900 | CCDC77 | ENSG00000120647.5 | 1.835E-6 | 0.01 | -5238 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS1011699 | 12 | 494186 | CCDC77 | ENSG00000120647.5 | 2.24e-7 | 0.01 | -4952 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS6489475 | 12 | 495558 | CCDC77 | ENSG00000120647.5 | 1.714E-7 | 0.01 | -3580 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS10774154 | 12 | 496695 | CCDC77 | ENSG00000120647.5 | 2.43e-6 | 0.01 | -2443 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS2253565 | 12 | 497910 | CCDC77 | ENSG00000120647.5 | 1.778E-6 | 0.01 | -1228 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS1155942 | 12 | 501076 | CCDC77 | ENSG00000120647.5 | 3.7e-7 | 0.01 | 1938年 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS7133796 | 12 | 502025 | CCDC77 | ENSG00000120647.5 | 3.071E-7 | 0.01 | 2887 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS201670349 | 12 | 502184 | CCDC77 | ENSG00000120647.5 | 8.306E-7 | 0.01 | 3046 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS2369277 | 12 | 502472 | CCDC77 | ENSG00000120647.5 | 8.39e-7 | 0.01 | 3334 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS9805067 | 12 | 505333 | CCDC77 | ENSG00000120647.5 | 9.973E-7 | 0.01 | 6195 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS1541464 | 12 | 505839 | CCDC77 | ENSG00000120647.5 | 6.39e-7 | 0.01 | 6701 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS1541465 | 12 | 505920 | CCDC77 | ENSG00000120647.5 | 7.155e-7 | 0.01 | 6782 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS4980817 | 12 | 506893 | CCDC77 | ENSG00000120647.5 | 1.117E-6 | 0.01 | 7755 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS7972566 | 12 | 517059 | CCDC77 | ENSG00000120647.5 | 4.241E-7 | 0.01 | 17921年 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS10774170 | 12 | 517521 | CCDC77 | ENSG00000120647.5 | 2.916E-7 | 0.01 | 18383 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS11062803 | 12 | 518303 | CCDC77 | ENSG00000120647.5 | 5.87E-7 | 0.01 | 19165 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS10744627 | 12 | 518795 | CCDC77 | ENSG00000120647.5 | 6.206E-7 | 0.01 | 19657 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS11062813 | 12 | 518986 | CCDC77 | ENSG00000120647.5 | 5.188e-7 | 0.01 | 19848 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS7136116 | 12 | 522975 | CCDC77 | ENSG00000120647.5 | 1.723E-6 | 0.01 | 23837 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS11610457 | 12 | 523350 | CCDC77 | ENSG00000120647.5 | 1.403E-6 | 0.01 | 24212 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS11613357 | 12 | 557394 | CCDC77 | ENSG00000120647.5 | 4.42e-7 | 0.01 | 58256 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS2191159 | 12 | 558019 | CCDC77 | ENSG00000120647.5 | 1.888e-6 | 0.01 | 58881 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS12372234 | 12 | 558423 | CCDC77 | ENSG00000120647.5 | 2.459E-6 | 0.01 | 59285 | gtex_brain_putamen_basal |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域没有共表达基因
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| Ginestier乳腺癌20Q13扩增DN | 180 | 101 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 多德鼻咽癌DN | 1375 | 806 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 罗德里格甲状腺癌的分化不佳 | 633 | 376 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 带有E盒的WEI MYCN目标 | 795 | 478 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 由FOXP3绑定的Marson刺激 | 1022 | 619 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 由Foxp3绑定的Marson未刺激 | 1229 | 713 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mikkelsen ES ICP与H3K4Me3 | 718 | 401 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mikkelsen NPC ICP带有H3K4Me3 | 445 | 257 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gobert少突胶质细胞分化 | 570 | 339 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| wakabayashi脂肪形成PPARG绑定8D | 658 | 397 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Fortschegger PHF8靶向 | 279 | 155 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |