基因页面:DYRK3
总结吗?
GeneID | 8444年 |
象征 | DYRK3 |
同义词 | 红色DYRK5 | | REDK | hYAK3-2 |
描述 | 双特异性酪氨酸磷酸化调节激酶3 |
参考 | MIM: 603497|HGNC: HGNC: 3094|运用:ENSG00000143479|HPRD: 04607|织女:OTTHUMG00000036339 |
基因型 | 蛋白质编码 |
地图上的位置 | 1 q32.1 |
夏洛克假定值 | 0.309 |
胎儿β | 0.164 |
DMG | 1(#研究) |
eGene | 迈尔斯的顺式和反式 |
基因数据来源
基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
DMG: Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括4641个不同甲基化探针对应2929个独特的基因之间的精神分裂症患者(n = 24)和控制(n = 24)。 | 1 |
认为:McCarthy_2014 | 全外显子组测序分析 | 全外显子组测序的57个三人小组与零星或家族性精神分裂症。 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
认为表
基因 | 染色体 | 位置 | 裁判 | Alt | 成绩单 | AA变化 | 突变类型 | 筛选 | CG46 | 特征 | 研究 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
DYRK3 | chr1 | 206820906 | 一个 | G | NM_003582 | p.S121S | 同义SNV | 精神分裂症 | 认为:McCarthy_2014 |
不同甲基化基因
探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
cg09224523 | 1 | 206808529 | DYRK3 | 2.404的军医 | -0.546 | 0.037 | DMG: Wockner_2014 |
eQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
rs443832 | chr16 | 83779643 | DYRK3 | 8444年 | 0.01 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
![不可用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/DYRK3_DE_GTEx.png)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
前10名中的基因 | ||
基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
NOXA1 | 0.47 | 0.48 |
ZSCAN1 | 0.47 | 0.41 |
NPDC1 | 0.47 | 0.45 |
ACCN3 | 0.46 | 0.47 |
SHC2 | 0.46 | 0.49 |
CEMP1 | 0.46 | 0.47 |
SCNN1D | 0.45 | 0.47 |
CCDC24 | 0.45 | 0.43 |
PNKP | 0.44 | 0.41 |
TMEM175 | 0.44 | 0.48 |
十大负面中的基因 | ||
基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
NET1 | -0.26 | -0.24 |
CBWD1 | -0.24 | -0.19 |
RAP1A | -0.23 | -0.19 |
ELTD1 | -0.23 | -0.19 |
GIMAP4 | -0.22 | -0.18 |
PRKY | -0.21 | -0.13 |
PITPNC1 | -0.20 | -0.17 |
GUCY1A2 | -0.20 | -0.14 |
CLIC4 | -0.20 | -0.16 |
TWF1 | -0.20 | -0.12 |
部分诉通路注释
路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
---|---|---|---|
刘SOX4 DN的目标 | 309年 | 191年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
周炎症反应生活 | 485年 | 293年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
周炎症反应费马 | 544年 | 308年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
金赛的目标EWSR1 FLII融合起来 | 1278年 | 748年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
G DN GAUSSMANN MLL AF4融合目标 | 35 | 18 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
DN SCHLOSSER血清反应 | 712年 | 443年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
MARTORIATI MDM4目标胎儿肝脏 | 227年 | 137年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
NUYTTEN EZH2的目标了 | 1037年 | 673年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
布伊泰尔特说光动力治疗压力 | 811年 | 508年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
NIKOLSKY乳腺癌1问扩增子 | 13 | 5 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
白细胞介素6 BROCKE凋亡发生逆转 | 144年 | 98年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
桑塞姆APC目标了 | 126年 | 84年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
佩特洛娃内皮淋巴和血液 | 131年 | 87年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
王顺铂的反应和XPC DN | 228年 | 146年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
桑塞姆APC的目标 | 212年 | 121年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
海勒HDAC目标被甲基化 | 461年 | 298年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
COULOUARN颞TGFB1签名DN | 138年 | 99年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
山中胶质母细胞瘤生存了 | 11 | 7 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
赛对促性腺激素DN | 87年 | 66年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
萨松应对FORSKOLIN DN | 88年 | 68年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
李诱导T自然杀伤 | 307年 | 182年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
棕熊短波紫外线反应中间 | 98年 | 56 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
德拉克洛瓦RAR绑定西文 | 462年 | 273年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
RAO受SALL4 | 227年 | 149年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |