基因页面:SYVN1
总结吗?
| GeneID | 84447年 |
| 象征 | SYVN1 |
| 同义词 | DER3 | HRD1 |
| 描述 | synoviolin 1 |
| 参考 | MIM: 608046|HGNC: HGNC: 20738|运用:ENSG00000162298|HPRD: 07618|织女:OTTHUMG00000165607 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 11个问题 |
| 帕斯卡假定值 | 0.358 |
| 夏洛克假定值 | 0.44 |
| 胎儿β | -0.006 |
| eGene | 迈尔斯的顺式和反式 |
| 支持 | CompositeSet |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| 认为:Fromer_2014 | 全外显子组测序分析 | 本研究报告623年韦斯研究精神分裂症三人小组,报告认为使用基因组DNA。 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
认为表
认为表| 基因 | 染色体 | 位置 | 裁判 | Alt | 成绩单 | AA变化 | 突变类型 | 筛选 | CG46 | 特征 | 研究 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| SYVN1 | chr11 | 64898233 | C | T | NM_032431 NM_172230 |
p.335R > H p.335R > H |
错义 错义 |
精神分裂症 | 认为:Fromer_2014 |
eQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs7972594 | chr12 | 11724913 | SYVN1 | 84447年 | 0.11 | 反式 | ||
| rs10491979 | chr12 | 11727969 | SYVN1 | 84447年 | 0.11 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| KEGG泛素介导的蛋白水解作用 | 138年 | 98年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME糖尿病的途径 | 133年 | 91年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME XBP1S伴侣蛋白基因的激活 | 46 | 34 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME展开蛋白质反应 | 80年 | 51 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 由阿霉素GRAESSMANN细胞凋亡 | 1142年 | 669年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 米利伪足趋化性DN | 457年 | 302年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 米利伪足趋触性DN | 668年 | 419年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 刘VAV3前列腺癌形成DN | 17 | 14 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DN PILON KLF1目标 | 1972年 | 1213年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 约翰斯通PARVB目标3 | 430年 | 288年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| KASLER HDAC7目标1 | 194年 | 133年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |