概括
基因 84448
象征 ablim2
同义词 -
描述 肌动蛋白结合LIM蛋白家族成员2
参考 MIM:612544|HGNC:HGNC:19195|ENSEMBL:ENSG00000163995|Vega:Otthumg00000057427
基因类型 蛋白质编码
地图位置 4P16.1
Pascal P值 0.902
Sherlock P值 0.459
胎儿β -2.431
DMG 1(#研究)
支持 G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL
G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-MOUSE-PSD-CONSUS

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 3

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG00322262 4 8085866 ablim2 8.36e-5 0.675 0.026 DMG:Wockner_2014
CG07136035 4 8081484 ablim2 2.059E-4 0.815 0.035 DMG:Wockner_2014
CG17949969 4 8073790 ablim2 4.871E-4 0.674 0.047 DMG:Wockner_2014


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
KEGG轴突指导 129 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schaeffer前列腺开发48小时DN 428 306 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CERVERA SDHB靶向1个 118 66 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性2 473 224 该途径中的所有SZGR 2.0基因
具有H3K4ME3和H3K27ME3的Meissner NPC HCP 142 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen NPC HCP,带有H3K4ME3和H3K27ME3 210 148 该途径中的所有SZGR 2.0基因