基因页:MEGF10
概括?
基因 | 84466 |
象征 | MEGF10 |
同义词 | emardd |
描述 | 多个EGF类似域10 |
参考 | MIM:612453|HGNC:HGNC:29634|ENSEMBL:ENSG00000145794|HPRD:14384|Vega:Otthumg00000128984 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 5Q33 |
Pascal P值 | 0.018 |
Sherlock P值 | 0.509 |
胎儿β | -0.177 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 1 |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
协会 | 组合的优势比方法(Sun等。2008),协会研究 | 2 | 链接到Szgene |
GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR:0.0032 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
网络 | 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 | PPI网络中最短路径的贡献:0.0086 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG26465611 | 5 | 126626719 | MEGF10 | 2.147E-4 | -0.464 | 0.036 | DMG:Wockner_2014 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS9875049 | CHR3 | 56457469 | MEGF10 | 84466 | 0.11 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/MEGF10_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23岁)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0005515 | 蛋白质结合 | IEA | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0007155 | 细胞粘附 | IEA | - | |
去:0006909 | 吞噬作用 | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
GO:0016021 | 膜不可或缺 | IEA | - | |
去:0005886 | 质膜 | IEA | - | |
GO:0016323 | 基底外侧质膜 | IEA | - |
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | 来源 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|---|
AARS2 | AARSL |KIAA1270 |MT-Alars |mtalars |BA444E17.1 | 乙酰基-TRNA合成酶2,线粒体(推定) | - | HPRD | 12421765 |
施舍1 | ALSS |DKFZP686A118 |DKFZP686D1828 |KIAA0328 | 阿尔斯特罗姆综合症1 | - | HPRD | 12421765 |
AP2M1 | AP50 |clapm1 |Mu2 | 与Adaptor相关的蛋白质复合物2,MU 1亚基 | - | HPRD | 12421765 |
bahd1 | KIAA0945 | Bromo相邻同源域,包含1个 | - | HPRD | 12421765 |
cadps2 | FLJ40851 |KIAA1591 | Ca ++-依赖分泌激活剂2 | - | HPRD | 12421765 |
CEP57 | KIAA0092 |PIG8 |TSP57 | 中心蛋白57KDA | - | HPRD | 12421765 |
Cul7 | KIAA0076 |DJ20C7.5 | 卡林7 | - | HPRD | 12421765 |
DHX16 | dbp2 |DDX16 |Pro2014 |PRP8 | DEAH(ASP-GLU-ALA-HIS)盒多肽16 | - | HPRD | 12421765 |
GRB10 | grb-ir |GRB-10 |IRBP |KIAA0207 |MEG1 |RSS | 生长因子受体结合蛋白10 | - | HPRD | 12421765 |
HDAC4 | HA6116 |HD4 |HDAC-A |hdaca |KIAA0288 | 组蛋白脱乙酰基酶4 | - | HPRD | 12421765 |
ITSN2 | KIAA1256 |Pro2015 |SH3D1B |SH3P18 |SWA |交换 | 截面2 | - | HPRD | 12421765 |
KIAA0564 | FLJ21779 | KIAA0564 | - | HPRD | 12421765 |
KIAA1598 | DKFZP686A0439 |MGC40476 |shotin-1 | KIAA1598 | - | HPRD | 12421765 |
MCF2L2 | DKFZP686K0690 |FLJ42509 |KIAA0861 | MCF.2细胞系导出转换序列样2 | - | HPRD | 12421765 |
RANBP10 | FLJ31165 |KIAA1464 | 运行结合蛋白10 | - | HPRD | 12421765 |
RICS | GC-GAP |砂砾|KIAA0712 |MGC1892 |P200RHOGAP |P250GAP | Rho GTPase激活蛋白 | - | HPRD | 12421765 |
sart3 | DSAP1 |KIAA0156 |MGC138188 |P100 |RP11-13G14 |TIP110 |P110 |P110(NRB) | T细胞识别的鳞状细胞癌抗原3 | - | HPRD | 12421765 |
Scaper | FLJ31533 |FLJ31953 |KIAA1454 |MSTP063 |Znf291 |ZFP291 | S相旋转蛋白A相关蛋白ER中的蛋白 | - | HPRD | 12421765 |
SNRNP200 | ASCC3L1 |brr2 |Helic2 |U5-200KD | 小核核糖核蛋白200KDA(U5) | - | HPRD | 12421765 |
陶克2 | KIAA0881 |MAP3K17 |PSK |PSK1 |tao1 |tao2 | 陶激酶2 | - | HPRD | 12421765 |
TMEM132A | DKFZP547E212 |FLJ20539 |GBP |HSPA5BP1 |MGC138669 | 跨膜蛋白132a | - | HPRD | 12421765 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Sengupta鼻咽癌,LMP1 UP | 408 | 247 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Senese HDAC1和HDAC2靶向 | 238 | 144 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Senese HDAC2靶向 | 114 | 66 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gaussmann MLL AF4融合目标G DN | 35 | 18 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Perez TP53目标 | 1174 | 695 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Ingram SHH靶向DN | 64 | 41 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rozanov MMP14靶向 | 266 | 171 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伊万诺娃造血细胞和祖细胞 | 681 | 420 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
麦凯布(McCabe)由HOXC6绑定 | 469 | 239 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
McCabe Hoxc6靶向DN | 21 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen IPS ICP带有H3K4ME3和H327Me3 | 126 | 83 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PYEON CANER CANCAR HEAD和NECK与宫颈DN | 29 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen ES ICP与H3K4Me3 | 718 | 401 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen NPC ICP带有H3K4Me3 | 445 | 257 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Plasari TGFB1靶向10小时 | 199 | 143 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NABA分泌因素 | 344 | 197 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NABA女性相关 | 753 | 411 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NABA矩阵 | 1028 | 559 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |