概括
基因 84466
象征 MEGF10
同义词 emardd
描述 多个EGF类似域10
参考 MIM:612453|HGNC:HGNC:29634|ENSEMBL:ENSG00000145794|HPRD:14384|Vega:Otthumg00000128984
基因类型 蛋白质编码
地图位置 5Q33
Pascal P值 0.018
Sherlock P值 0.509
胎儿β -0.177
DMG 1(#研究)
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 1
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
协会 组合的优势比方法(Sun等。2008),协会研究 2 链接到Szgene
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 PSR:0.0032
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息
网络 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 PPI网络中最短路径的贡献:0.0086

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG26465611 5 126626719 MEGF10 2.147E-4 -0.464 0.036 DMG:Wockner_2014

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS9875049 CHR3 56457469 MEGF10 84466 0.11 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23岁)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005515 蛋白质结合 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0007155 细胞粘附 IEA -
去:0006909 吞噬作用 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO:0016021 膜不可或缺 IEA -
去:0005886 质膜 IEA -
GO:0016323 基底外侧质膜 IEA -

第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

互动者 别名b 官方全名b 实验 来源 PubMed ID
AARS2 AARSL​​ |KIAA1270 |MT-Alars |mtalars |BA444E17.1 乙酰基-TRNA合成酶2,线粒体(推定) - HPRD 12421765
施舍1 ALSS |DKFZP686A118 |DKFZP686D1828 |KIAA0328 阿尔斯特罗姆综合症1 - HPRD 12421765
AP2M1 AP50 |clapm1 |Mu2 与Adaptor相关的蛋白质复合物2,MU 1亚基 - HPRD 12421765
bahd1 KIAA0945 Bromo相邻同源域,包含1个 - HPRD 12421765
cadps2 FLJ40851 |KIAA1591 Ca ++-依赖分泌激活剂2 - HPRD 12421765
CEP57 KIAA0092 |PIG8 |TSP57 中心蛋白57KDA - HPRD 12421765
Cul7 KIAA0076 |DJ20C7.5 卡林7 - HPRD 12421765
DHX16 dbp2 |DDX16 |Pro2014 |PRP8 DEAH(ASP-GLU-ALA-HIS)盒多肽16 - HPRD 12421765
GRB10 grb-ir |GRB-10 |IRBP |KIAA0207 |MEG1 |RSS 生长因子受体结合蛋白10 - HPRD 12421765
HDAC4 HA6116 |HD4 |HDAC-A |hdaca |KIAA0288 组蛋白脱乙酰基酶4 - HPRD 12421765
ITSN2 KIAA1256 |Pro2015 |SH3D1B |SH3P18 |SWA |交换 截面2 - HPRD 12421765
KIAA0564 FLJ21779 KIAA0564 - HPRD 12421765
KIAA1598 DKFZP686A0439 |MGC40476 |shotin-1 KIAA1598 - HPRD 12421765
MCF2L2 DKFZP686K0690 |FLJ42509 |KIAA0861 MCF.2细胞系导出转换序列样2 - HPRD 12421765
RANBP10 FLJ31165 |KIAA1464 运行结合蛋白10 - HPRD 12421765
RICS GC-GAP |砂砾|KIAA0712 |MGC1892 |P200RHOGAP |P250GAP Rho GTPase激活蛋白 - HPRD 12421765
sart3 DSAP1 |KIAA0156 |MGC138188 |P100 |RP11-13G14 |TIP110 |P110 |P110(NRB) T细胞识别的鳞状细胞癌抗原3 - HPRD 12421765
Scaper FLJ31533 |FLJ31953 |KIAA1454 |MSTP063 |Znf291 |ZFP291 S相旋转蛋白A相关蛋白ER中的蛋白 - HPRD 12421765
SNRNP200 ASCC3L1 |brr2 |Helic2 |U5-200KD 小核核糖核蛋白200KDA(U5) - HPRD 12421765
陶克2 KIAA0881 |MAP3K17 |PSK |PSK1 |tao1 |tao2 陶激酶2 - HPRD 12421765
TMEM132A DKFZP547E212 |FLJ20539 |GBP |HSPA5BP1 |MGC138669 跨膜蛋白132a - HPRD 12421765


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Sengupta鼻咽癌,LMP1 UP 408 247 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Senese HDAC1和HDAC2靶向 238 144 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Senese HDAC2靶向 114 66 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gaussmann MLL AF4融合目标G DN 35 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Perez TP53目标 1174 695 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ingram SHH靶向DN 64 41 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rozanov MMP14靶向 266 171 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伊万诺娃造血细胞和祖细胞 681 420 该途径中的所有SZGR 2.0基因
麦凯布(McCabe)由HOXC6绑定 469 239 该途径中的所有SZGR 2.0基因
McCabe Hoxc6靶向DN 21 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen IPS ICP带有H3K4ME3和H327Me3 126 83 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PYEON CANER CANCAR HEAD和NECK与宫颈DN 29 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen ES ICP与H3K4Me3 718 401 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen NPC ICP带有H3K4Me3 445 257 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Plasari TGFB1靶向10小时 199 143 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA分泌因素 344 197 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA女性相关 753 411 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA矩阵 1028 559 该途径中的所有SZGR 2.0基因