基因页：Cul1
概括？
| 基因 | 8454 |
| 象征 | Cul1 |
| 同义词 | - |
| 描述 | 卡林1 |
| 参考 | MIM：603134|HGNC：HGNC：2551|Ensembl：ENSG00000055130|HPRD：04389|Vega：Otthumg00000152776 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 7q36.1 |
| Pascal P值 | 0.241 |
| Sherlock P值 | 0.823 |
| 胎儿β | 0.039 |
| DMG | 1（＃研究） |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 | 1 |
| DNM：Gulsuner_2013 | 整个外显子组测序分析 | 155 DNM通过外显子组对精神分裂症个体及其父母的三重奏测序确定。 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
DNM表
DNM表| 基因 | 染色体 | 位置 | 参考 | alt | 成绩单 | AA更改 | 突变类型 | 筛 | CG46 | 特征 | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Cul1 | CHR7 | 148484087 | G | 一个 | NM_003592 | p.452v> i | 错过 | 精神分裂症 | DNM：Gulsuner_2013 |
差异甲基化基因
| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG08575682 | 7 | 148455579 | Cul1 | 2.436E-4 | 0.372 | 0.037 | DMG：Wockner_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| MAD2L1 | 0.87 | 0.66 |
| sgol2 | 0.87 | 0.58 |
| HMGB2 | 0.85 | 0.63 |
| RAD51AP1 | 0.85 | 0.51 |
| TMX1 | 0.84 | 0.63 |
| PBK | 0.84 | 0.41 |
| kif18a | 0.84 | 0.41 |
| C12orf48 | 0.84 | 0.55 |
| CDC2 | 0.84 | 0.47 |
| TTK | 0.83 | 0.43 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| SLC9A3R2 | -0.35 | -0.33 |
| tinagl1 | -0.32 | -0.36 |
| FBXW4 | -0.31 | -0.30 |
| Adamtsl5 | -0.31 | -0.32 |
| AF347015.33 | -0.30 | -0.26 |
| LGI4 | -0.30 | -0.28 |
| MT-CO2 | -0.30 | -0.25 |
| AF347015.26 | -0.30 | -0.27 |
| tenc1 | -0.30 | -0.39 |
| AF347015.2 | -0.29 | -0.27 |
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
| 互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | 资源 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|---|
| Btrc | beta-trcp |fbw1a |fbxw1 |fbxw1a |FWD1 |MGC4643 |BTRCP |BTRCP1 |betatrcp | beta-transducin重复含有 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 10531035|10644755 |12609982 |
| CAND1 | DKFZP434M1414 |FLJ10114 |FLJ10929 |FLJ38691 |FLJ90441 |KIAA0829 |TIP120 |TIP120A | 库林相关和neddylation-Dissciped 1 | 亲和力捕获ms 亲和力捕获 - 韦斯特恩 |
Biogrid | 12609982 |
| CDCA3 | grcc8 |MGC2577 |Tome-1 | 细胞分裂周期相关3 | - | HPRD，Biogrid | 12679038 |
| CDK9 | C-2K |cdc2l4 |CTK1 |pitalre |塔 | 细胞周期蛋白依赖性激酶9 | - | HPRD，Biogrid | 11689688|12861003 |
| CDKN1C | BWCR |BWS |kip2 |WBS |p57 | 细胞周期蛋白依赖性激酶抑制剂1C（P57，KIP2） | 生化活动 | Biogrid | 12925736 |
| CDT1 | dup |RIS2 | 染色质许可和DNA复制因子1 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 12840033 |
| commd1 | C2orf5 |MGC27155 |Murr1 | 包含1的铜代谢（MURR1）结构域 | MURR1与CUL1相互作用Cul1-RBX1-SKP1-F盒SCF泛素连接酶复合物的成分。 | 绑定 | 14685242 |
| COPS6 | CSN6 |MOV34-34KD | COP9本构型显微类同源物亚基6（拟南芥） | - | HPRD | 11337588 |
| Cul1 | MGC149834 |MGC149835 | 卡林1 | - | HPRD，Biogrid | 11961546 |
| Cul1 | MGC149834 |MGC149835 | 卡林1 | CUL1 [15-410]与CUL1 [411-776]相互作用，形成了CUL1-RBX1-SKP1-F BOXSKP2 SCF泛素连接酶复合物的一部分。 | 绑定 | 11961546 |
| E2F1 | E2F-1 |RBAP1 |rbbp3 |rbp3 | E2F转录因子1 | - | HPRD，Biogrid | 10559858 |
| FBXL3 | fbl3 |fbl3a |fbxl3a | F-box和富含亮氨酸的重复蛋白3 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 10531035 |
| FBXO18 | FBH1 |FLJ14590 |FBX18 |MGC131916 |MGC141935 |MGC141937 | F-box蛋白，解旋酶，18 | - | HPRD，Biogrid | 11956208 |
| FBXO4 | DKFZP547N213 |FBX4 |FLJ10141 | F-box蛋白4 | 亲和力捕获ms 亲和力捕获 - 韦斯特恩 |
Biogrid | 10531035|17353931 |
| FBXO7 | DKFZP686B08113 |FBX |FBX07 |FBX7 |Park15 |PKPS | F-box蛋白7 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 10531035 |
| FBXW11 | btrc2 |BTRCP2 |fbw1b |fbxw1b |FBW11 |hos |KIAA0696 | F-box和WD重复域包含11 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 10644755 |
| FBXW2 | fbw2 |FWD2 |MGC117371 |MD6 | F-box和WD重复域包含2 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 10531035 |
| FBXW7 | 前|cdc4 |DKFZP686F23254 |fbw6 |fbw7 |FBX30 |FBXO30 |fbxw6 |FLJ16457 |SEL-10 | SEL10 | F-box和WD重复域包含7 | 重构的复合物 | Biogrid | 11585921 |
| GPS1 | COPS1 |CSN1 |MGC71287 | G蛋白途径抑制器1 | - | HPRD | 11337588 |
| park2 | AR-JP |LPRS2 |PDJ |prkn | 帕金森病（常染色体隐性，少年）2，帕金 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 重构的复合物 |
Biogrid | 12628165 |
| PRPF40A | FBP-11 |FBP11 |flaf1 |FLJ20585 |fnbp3 |hip10 |hypa |NY-REN-6 | PRP40前MRNA处理因子40同源物A（酿酒酵母） | - | HPRD | 14603323 |
| Rac2 | EN-7 |GX |HSPC022 | 与RAS相关的C3肉毒纤维毒素底物2（RHO家族，小GTP结合蛋白Rac2） | - | HPRD，Biogrid | 11445862 |
| RBX1 | BA554C12.1 |MGC13357 |MGC1481 |RNF75 |ROC1 | 环框1 | CUL1与ROC1相互作用。 | 绑定 | 11956208 |
| RBX1 | BA554C12.1 |MGC13357 |MGC1481 |RNF75 |ROC1 | 环框1 | - | HPRD，Biogrid | 11961546 |
| RBX1 | BA554C12.1 |MGC13357 |MGC1481 |RNF75 |ROC1 | 环框1 | RBX1与CUL1 [411-776]相互作用，形成了CUL1-RBX1-SKP1-F BOXSKP2 SCF泛素蛋白连接酶配合物的一部分。 | 绑定 | 11961546 |
| RNF7 | CKBBP1 |ROC2 |下垂 | 环手指蛋白7 | - | HPRD，Biogrid | 10230407 |
| RPRM | FLJ90327 |谴责 | 谴责，TP53依赖的G2逮捕调解员候选人 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
| SKP1 | EMC19 |MGC34403 |OCP-II |OCP2 |Skp1a |TCEB1L |P19A | S期激酶相关蛋白1 | - | HPRD | 9827542 |
| SKP1 | EMC19 |MGC34403 |OCP-II |OCP2 |Skp1a |TCEB1L |P19A | S期激酶相关蛋白1 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 9430629|12609982 |12628165 |
| SKP1 | EMC19 |MGC34403 |OCP-II |OCP2 |Skp1a |TCEB1L |P19A | S期激酶相关蛋白1 | SKP1A与CUL1 [15-410]相互作用，形成了CUL1-RBX1-SKP1-F BOXSKP2 SCF泛素连接酶复合物的一部分。 | 绑定 | 11961546 |
| SKP2 | fbl1 |fbxl1 |flb1 |MGC1366 | S期激酶相关蛋白2（P45） | - | HPRD，Biogrid | 9430629 |
| SKP2 | fbl1 |fbxl1 |flb1 |MGC1366 | S期激酶相关蛋白2（P45） | SKP2-FBOX与CUL1 [15-410]相互作用，形成了CUL1-RBX1-SKP1-F BOXSKP2 SCF泛素连接酶配合物的一部分。 | 绑定 | 11961546 |
| TBK1 | FLJ11330 |nak |T2K | 储罐结合激酶1 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 14743216 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| kegg细胞周期 | 128 | 84 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kegg卵母细胞减数分裂 | 114 | 79 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KEGG泛素介导的蛋白水解 | 138 | 98 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| kegg wnt信号通路 | 151 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| kegg tgf beta信号通路 | 86 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Biocarta SKP2E2F途径 | 10 | 6 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Biocarta P27途径 | 13 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID Notch途径 | 59 | 49 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID Beta catenin deg途径 | 18 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID Beta Catenin nuc途径 | 80 | 60 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Wnt的Reactome信号传导 | 65 | 41 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 反应组细胞周期 | 421 | 253 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ERBB4的Reactome信号传导 | 90 | 67 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome催乳素受体信号传导 | 14 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ERBB4的Reactome核信号传导 | 38 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| B细胞受体BCR的Reactome下游信号传导事件 | 97 | 66 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| B细胞中NF Kappab的反应组激活 | 64 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| B细胞受体BCR的反应组信号传导 | 126 | 90 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome Notch1细胞内结构域调节转录 | 46 | 28 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Notch1的Reactome信号传导 | 70 | 46 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome细胞周期有丝分裂 | 325 | 185 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| G1 S转变期间的Reactome Cyclin E相关事件 | 65 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome G1相 | 38 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome G1 S过渡 | 112 | 63 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome有丝分裂G1 G1 S相 | 137 | 79 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 有丝分裂细胞周期的反应组调节 | 85 | 46 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ILS的Reactome信号传导 | 107 | 86 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome IL1信号传导 | 39 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome昼夜节律 | 53 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Notch的Reactome信号传导 | 103 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome SCF Beta TRCP介导的EMI1降解 | 51 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome免疫系统 | 933 | 616 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome适应性免疫系统 | 539 | 350 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 免疫系统中的反应组细胞因子信号传导 | 270 | 204 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome I类MHC介导的抗原加工表现 | 251 | 156 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome抗原加工泛素化蛋白酶体降解 | 212 | 129 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome s阶段 | 109 | 66 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome SCFSKP2介导的P27 P21降解 | 56 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 渡边直肠癌放射疗法反应性DN | 92 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| EWSR1 FLII融合的Kinsey目标 | 1278 | 748 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 多德鼻咽癌DN | 1375 | 806 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ENK UV响应角质形成细胞DN | 485 | 334 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 开罗PML的目标是由Myc Up绑定 | 23 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Schlosser MYC靶标和血清反应DN | 47 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Dacosta UV响应通过ERCC3 DN | 855 | 609 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Dacosta UV响应通过ERCC3公共DN | 483 | 336 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲DN | 584 | 395 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PUJANA BRCA1 PCC网络 | 1652 | 1023 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Koyama Sema3b靶向DN | 411 | 249 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Ross AML带有MLL融合 | 78 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PEART HDAC增殖集群DN | 76 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Cromer转移DN | 81 | 58 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 约瑟夫对丁酸钠DN的反应 | 64 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿尔茨海默氏病dn | 1237 | 837 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yamazaki TCEB3靶向 | 175 | 116 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 由组蛋白乙酰化DN调节的玛丽亚达森 | 54 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 外邦紫外线响应集群D7 | 40 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 外邦紫外线高剂量DN | 312 | 203 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Dazard对UV NHEK DN的反应 | 318 | 220 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| dazard UV响应集群G6 | 153 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| HU遗传毒性损伤4小时 | 35 | 28 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Sansom Wnt途径需要MYC | 58 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Heller HDAC靶向DN | 292 | 189 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Jison Sickle细胞疾病 | 181 | 106 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yagi AML带有Inv 16易位 | 422 | 277 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Sakai慢性肝炎与肝癌 | 83 | 63 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 金双相情感障碍少突胶质细胞密度相关 | 682 | 440 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kim所有疾病Calb1 Corr Up | 548 | 370 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Pilon KLF1靶向DN | 1972年 | 1213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |