概括
基因 84561
象征 SLC12A8
同义词 CCC9
描述 Solute Carrier家族12成员8
参考 MIM:611316|HGNC:HGNC:15595|ENSEMBL:ENSG00000221955|HPRD:11563|Vega:Otthumg00000159483
基因类型 蛋白质编码
地图位置 3Q21.2
Pascal P值 0.001
主持人 前扣带回皮层BA24

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS2945116 3 124840136 SLC12A8 ENSG00000221955.6 2.159E-7 0.01 91572 gtex_brain_ba24
RS2948805 3 124841013 SLC12A8 ENSG00000221955.6 2.159E-7 0.01 90695 gtex_brain_ba24
RS2037236 3 124841350 SLC12A8 ENSG00000221955.6 2.159E-7 0.01 90358 gtex_brain_ba24
RS2037235 3 124841577 SLC12A8 ENSG00000221955.6 2.159E-7 0.01 90131 gtex_brain_ba24
RS2333043 3 124842400 SLC12A8 ENSG00000221955.6 2.159E-7 0.01 89308 gtex_brain_ba24
RS2945120 3 124842456 SLC12A8 ENSG00000221955.6 2.159E-7 0.01 89252 gtex_brain_ba24
RS2948806 3 124842591 SLC12A8 ENSG00000221955.6 2.159E-7 0.01 89117 gtex_brain_ba24
RS2948807 3 124842596 SLC12A8 ENSG00000221955.6 2.159E-7 0.01 89112 gtex_brain_ba24
RS2942811 3 124842736 SLC12A8 ENSG00000221955.6 2.159E-7 0.01 88972 gtex_brain_ba24
RS2942812 3 124842991 SLC12A8 ENSG00000221955.6 2.159E-7 0.01 88717 gtex_brain_ba24
RS2945119 3 124843393 SLC12A8 ENSG00000221955.6 2.159E-7 0.01 88315 gtex_brain_ba24
RS2945118 3 124843489 SLC12A8 ENSG00000221955.6 2.159E-7 0.01 88219 gtex_brain_ba24
RS2942813 3 124843647 SLC12A8 ENSG00000221955.6 2.159E-7 0.01 88061 gtex_brain_ba24
RS2948796 3 124843860 SLC12A8 ENSG00000221955.6 2.159E-7 0.01 87848 gtex_brain_ba24
RS2948795 3 124843991 SLC12A8 ENSG00000221955.6 2.159E-7 0.01 87717 gtex_brain_ba24
RS2981515 3 124844069 SLC12A8 ENSG00000221955.6 2.159E-7 0.01 87639 gtex_brain_ba24
RS2948794 3 124844183 SLC12A8 ENSG00000221955.6 3.149E-7 0.01 87525 gtex_brain_ba24
RS2945113 3 124844757 SLC12A8 ENSG00000221955.6 2.159E-7 0.01 86951 gtex_brain_ba24
RS2981514 3 124844922 SLC12A8 ENSG00000221955.6 2.159E-7 0.01 86786 gtex_brain_ba24
RS2948793 3 124845139 SLC12A8 ENSG00000221955.6 2.159E-7 0.01 86569 gtex_brain_ba24
RS1890407 3 124845944 SLC12A8 ENSG00000221955.6 2.159E-7 0.01 85764 gtex_brain_ba24
RS2945114 3 124846408 SLC12A8 ENSG00000221955.6 2.159E-7 0.01 85300 gtex_brain_ba24

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
NUP98 HOXA9 Fusion 3D的Takeda目标 182 110 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NUP98 HOXA9 Fusion 8D的Takeda目标 157 91 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NUP98 HOXA9 Fusion 16D的Takeda目标 175 108 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Senese HDAC3靶向 501 327 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲状腺癌的Rodrigues分化不佳的DN 805 505 该途径中的所有SZGR 2.0基因
pasqualucci淋巴瘤通过GC阶段 283 177 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Onder CDH1目标2 DN 464 276 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Roeth Tert目标 14 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wang Smarce1靶向 280 183 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bild MYC致癌签名 206 117 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Heller HDAC靶向被甲基化的沉默 461 298 该途径中的所有SZGR 2.0基因
riggi ewing肉瘤祖先DN 191 123 该途径中的所有SZGR 2.0基因
H3K9ME3 DN的Acevedo肝癌 120 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bohn原发性免疫缺陷综合症DN 40 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rutella对CSF2RB和IL4的响应 338 225 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rutella对HGF的反应 418 282 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rutella对HGF与CSF2RB和IL4的反应 408 276 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen IPS LCP带有H3K4Me3 174 100 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zhan多发性骨髓瘤MF DN 41 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen ES LCP带有H3K4Me3 142 80 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FEVR CTNNB1靶向 682 433 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Roessler肝癌转移DN 53 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因