基因页:SLC12A8
概括?
基因 | 84561 |
象征 | SLC12A8 |
同义词 | CCC9 |
描述 | Solute Carrier家族12成员8 |
参考 | MIM:611316|HGNC:HGNC:15595|ENSEMBL:ENSG00000221955|HPRD:11563|Vega:Otthumg00000159483 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 3Q21.2 |
Pascal P值 | 0.001 |
主持人 | 前扣带回皮层BA24 元 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS2945116 | 3 | 124840136 | SLC12A8 | ENSG00000221955.6 | 2.159E-7 | 0.01 | 91572 | gtex_brain_ba24 |
RS2948805 | 3 | 124841013 | SLC12A8 | ENSG00000221955.6 | 2.159E-7 | 0.01 | 90695 | gtex_brain_ba24 |
RS2037236 | 3 | 124841350 | SLC12A8 | ENSG00000221955.6 | 2.159E-7 | 0.01 | 90358 | gtex_brain_ba24 |
RS2037235 | 3 | 124841577 | SLC12A8 | ENSG00000221955.6 | 2.159E-7 | 0.01 | 90131 | gtex_brain_ba24 |
RS2333043 | 3 | 124842400 | SLC12A8 | ENSG00000221955.6 | 2.159E-7 | 0.01 | 89308 | gtex_brain_ba24 |
RS2945120 | 3 | 124842456 | SLC12A8 | ENSG00000221955.6 | 2.159E-7 | 0.01 | 89252 | gtex_brain_ba24 |
RS2948806 | 3 | 124842591 | SLC12A8 | ENSG00000221955.6 | 2.159E-7 | 0.01 | 89117 | gtex_brain_ba24 |
RS2948807 | 3 | 124842596 | SLC12A8 | ENSG00000221955.6 | 2.159E-7 | 0.01 | 89112 | gtex_brain_ba24 |
RS2942811 | 3 | 124842736 | SLC12A8 | ENSG00000221955.6 | 2.159E-7 | 0.01 | 88972 | gtex_brain_ba24 |
RS2942812 | 3 | 124842991 | SLC12A8 | ENSG00000221955.6 | 2.159E-7 | 0.01 | 88717 | gtex_brain_ba24 |
RS2945119 | 3 | 124843393 | SLC12A8 | ENSG00000221955.6 | 2.159E-7 | 0.01 | 88315 | gtex_brain_ba24 |
RS2945118 | 3 | 124843489 | SLC12A8 | ENSG00000221955.6 | 2.159E-7 | 0.01 | 88219 | gtex_brain_ba24 |
RS2942813 | 3 | 124843647 | SLC12A8 | ENSG00000221955.6 | 2.159E-7 | 0.01 | 88061 | gtex_brain_ba24 |
RS2948796 | 3 | 124843860 | SLC12A8 | ENSG00000221955.6 | 2.159E-7 | 0.01 | 87848 | gtex_brain_ba24 |
RS2948795 | 3 | 124843991 | SLC12A8 | ENSG00000221955.6 | 2.159E-7 | 0.01 | 87717 | gtex_brain_ba24 |
RS2981515 | 3 | 124844069 | SLC12A8 | ENSG00000221955.6 | 2.159E-7 | 0.01 | 87639 | gtex_brain_ba24 |
RS2948794 | 3 | 124844183 | SLC12A8 | ENSG00000221955.6 | 3.149E-7 | 0.01 | 87525 | gtex_brain_ba24 |
RS2945113 | 3 | 124844757 | SLC12A8 | ENSG00000221955.6 | 2.159E-7 | 0.01 | 86951 | gtex_brain_ba24 |
RS2981514 | 3 | 124844922 | SLC12A8 | ENSG00000221955.6 | 2.159E-7 | 0.01 | 86786 | gtex_brain_ba24 |
RS2948793 | 3 | 124845139 | SLC12A8 | ENSG00000221955.6 | 2.159E-7 | 0.01 | 86569 | gtex_brain_ba24 |
RS1890407 | 3 | 124845944 | SLC12A8 | ENSG00000221955.6 | 2.159E-7 | 0.01 | 85764 | gtex_brain_ba24 |
RS2945114 | 3 | 124846408 | SLC12A8 | ENSG00000221955.6 | 2.159E-7 | 0.01 | 85300 | gtex_brain_ba24 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/SLC12A8_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
NUP98 HOXA9 Fusion 3D的Takeda目标 | 182 | 110 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NUP98 HOXA9 Fusion 8D的Takeda目标 | 157 | 91 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NUP98 HOXA9 Fusion 16D的Takeda目标 | 175 | 108 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Senese HDAC3靶向 | 501 | 327 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
甲状腺癌的Rodrigues分化不佳的DN | 805 | 505 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
pasqualucci淋巴瘤通过GC阶段 | 283 | 177 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Onder CDH1目标2 DN | 464 | 276 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Roeth Tert目标 | 14 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wang Smarce1靶向 | 280 | 183 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bild MYC致癌签名 | 206 | 117 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Heller HDAC靶向被甲基化的沉默 | 461 | 298 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
riggi ewing肉瘤祖先DN | 191 | 123 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
H3K9ME3 DN的Acevedo肝癌 | 120 | 71 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bohn原发性免疫缺陷综合症DN | 40 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rutella对CSF2RB和IL4的响应 | 338 | 225 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rutella对HGF的反应 | 418 | 282 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rutella对HGF与CSF2RB和IL4的反应 | 408 | 276 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen IPS LCP带有H3K4Me3 | 174 | 100 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zhan多发性骨髓瘤MF DN | 41 | 28 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen ES LCP带有H3K4Me3 | 142 | 80 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
FEVR CTNNB1靶向 | 682 | 433 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Roessler肝癌转移DN | 53 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |