基因页：TNRC18
概括？
| 基因 | 84629 |
| 象征 | TNRC18 |
| 同义词 | CAGL79 | TNRC18A |
| 描述 | 三核苷酸重复包含18 |
| 参考 | HGNC：HGNC：11962|Ensembl：ENSG00000182095|Vega：Otthumg00000151831 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 7p22.1 |
| Pascal P值 | 0.053 |
| TADA P值 | 0.006 |
| 胎儿β | 0.478 |
| DMG | 2（＃研究） |
| 主持人 | 元 |
| 支持 | COMPOSITESET Darnell FMRP目标 Ascano FMRP目标 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| CV：GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG（n = 108），而在Bonferroni调整后的P <0.05时，其中136个对照。 | 3 |
| DMG：Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 | 3 |
| DNM：Fromer_2014 | 整个外显子组测序分析 | 这项研究报道了WES对623个精神分裂症三重奏的研究，该研究使用基因组DNA报告了DNM。 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
DNM表
DNM表| 基因 | 染色体 | 位置 | 参考 | alt | 成绩单 | AA更改 | 突变类型 | 筛 | CG46 | 特征 | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| TNRC18 | CHR7 | 5352158 | C | t | NM_001080495 | p.2788w>* | 废话 | 精神分裂症 | DNM：Fromer_2014 | ||
| TNRC18 | CHR7 | 5415815 | G | 一个 | NM_001080495 | 。 | 沉默的 | 精神分裂症 | DNM：Fromer_2014 |
差异甲基化基因
| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG16718902 | 7 | 5352187 | TNRC18 | 3.53E-6 | 0.414 | 0.009 | DMG：Wockner_2014 |
| CG06778159 | 7 | 5407825 | TNRC18 | 4.111E-4 | 0.257 | 0.044 | DMG：Wockner_2014 |
| CG10392504 | 7 | 5464594 | TNRC18 | 1.5e-8 | -0.008 | 5.7E-6 | DMG：JAFFE_2016 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23岁）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0003677 | DNA结合 | IEA | - |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 乳腺癌腔与基础 | 380 | 215 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| vecchi胃癌早期 | 430 | 232 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 多德鼻咽癌 | 1821年 | 933 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 里克曼肿瘤区分良好，而不是很差 | 236 | 139 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Stark前额叶皮层22Q11删除 | 195 | 138 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Nikolsky乳腺癌7p22 Amplicon | 38 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 马丁内斯对trabectedin的反应 | 71 | 49 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Xu GH1自分泌目标 | 268 | 157 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 米利假足型haptotaxis dn | 668 | 419 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Hoelzel NF1靶向DN | 115 | 73 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Pilon KLF1靶向DN | 1972年 | 1213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Bakker FOXO3靶向DN | 187 | 109 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Delacroix Rarg Bound MEF | 367 | 231 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Delacroix RAR目标DN | 24 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zwang仅通过第二EGF脉冲瞬时向上 | 1725年 | 838 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |