基因页面:USP38
总结吗?
| GeneID | 84640年 |
| 象征 | USP38 |
| 同义词 | HP43.8KD |
| 描述 | 泛素特定肽酶38 |
| 参考 | HGNC: HGNC: 20067|运用:ENSG00000170185|HPRD: 15635|织女:OTTHUMG00000161420 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | - - - - - - |
| 帕斯卡假定值 | 0.349 |
| 夏洛克假定值 | 0.806 |
| 胎儿β | 0.088 |
| DMG | 1(#研究) |
| eGene | 迈尔斯的顺式和反式 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| DMG: vanEijk_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括432个不同甲基化CpG网站对应391精神分裂症患者之间独特的成绩单(n = 260)和对照组(n = 250)的影响。 | 1 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
认为表
认为表| 基因 | 染色体 | 位置 | 裁判 | Alt | 成绩单 | AA变化 | 突变类型 | 筛选 | CG46 | 特征 | 研究 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| USP38 | chr4 | 144135892 | G | 一个 | NM_032557 | 。 | 沉默 | 精神分裂症 | 认为:Fromer_2014 |
不同甲基化基因
| 探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| cg05754631 | 4 | 144258809 | USP38 | 8.517的军医 | -10.181 | DMG: vanEijk_2014 |
eQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs2158837 | chr7 | 107440450 | USP38 | 84640年 | 0.06 | 反式 | ||
| rs9956108 | chr18 | 3042415 | USP38 | 84640年 | 0 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| DN HORIUCHI WTAP目标 | 310年 | 188年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 由阿霉素GRAESSMANN细胞凋亡 | 1142年 | 669年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BYSTRYKH造血干细胞QTL CIS | 128年 | 77年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| CHESLER大脑QTL独联体 | 75年 | 51 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BYSTRYKH造血干细胞和大脑QTL CIS | 65年 | 38 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 伊万诺娃造血干细胞 | 254年 | 164年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 李最近胸腺移民 | 227年 | 128年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 约翰斯通PARVB目标3 DN | 918年 | 550年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 棕熊短波紫外线反应早期晚了 | 317年 | 190年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| ZWANG类1引起的暂时性的EGF | 516年 | 308年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |