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Summary？

基因ID	8467
象征	Smarca5
同义词	ISWI\|SNF2H\|WCRF135\|hISWI\|hSNF2H
描述	SWI/SNF相关，矩阵相关，染色质的肌动蛋白依赖性调节剂，亚家族A，成员5
参考	MIM：603375\|HGNC：HGNC：11101\|ENSEMBL：ENSG00000153147\|HPRD：04538\|Vega：Otthumg00000161474
基因类型	蛋白质编码
地图位置	4Q31.1-Q31.2
Pascal P值	0.005
Sherlock P值	0.857
胎儿β	0.897
DMG	1（＃研究）
主持人	迈尔斯的顺式和跨性别
支持	Ascano FMRP目标染色质重塑基因

基因in Data Sources

基因集名称	基因组方法	描述	信息
简历：PGCNP	全基因组协会研究	GWAS
DMG：Nishioka_2013	全基因组DNA甲基化分析	作者研究了来自18例第一期精神分裂症（FESZ）和15个正常对照的18例外周血细胞中DNA的甲基化谱。	1

Section I. Genetics and epigenetics annotation

差异甲基化基因

探测	染色体	位置	最近的基因	p（dis）	beta（dis）	fdr（dis）	学习
CG16091845	4	144434637	Smarca5		-0.022	0.67	DMG：Nishioka_2013

EQTL注释

SNP ID	染色体	位置	主持人	Gene Entrez ID	QVALUE	EQTL类型
RS6599250	CHR3	38784028	Smarca5	8467	0.17	反式
RS4491879	CHR3	189373908	Smarca5	8467	0.12	反式
RS6046959	CHR20	20588433	Smarca5	8467	0.18	反式

第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

Footnote:
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

Footnote:
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因	皮尔逊的相关性	斯皮尔曼的相关性
mmadhc	0.94	0.94
DRG1	0.93	0.89
PSMD14	0.93	0.90
PPA1	0.93	0.90
MRPL3	0.92	0.90
TXNL1	0.92	0.90
OLA1	0.92	0.90
CCT4	0.92	0.94
ATP5A1	0.92	0.90
MRPS35	0.92	0.90

前10个负共表达基因
基因	皮尔逊的相关性	斯皮尔曼的相关性
AF347015.26	-0.73	-0.76
AF347015.8	-0.73	-0.74
AF347015.2	-0.73	-0.73
mt-cyb	-0.73	-0.73
MT-CO2	-0.73	-0.71
AF347015.33	-0.72	-0.74
AF347015.15	-0.72	-0.74
AF347015.31	-0.70	-0.69
AF347015.27	-0.68	-0.70
AF347015.18	-0.65	-0.74

第四节. Protein-protein interaction annotation

互动者	别名b	官方全名b	实验	Source	PubMed ID
Alb	DKFZP779N1935 \|Pro0883 \|Pro0903 \|Pro1341	白蛋白	SNF2H interacts with the Albumin gene.	绑定	15616580
baz1a	ACF1 \| DKFZp586E0518 \| FLJ14383 \| WALp1 \| WCRF180 \| hACF1	与锌指域相邻的溴结构域，1A	-	HPRD，Biogrid	10655480\|10880450 \|11980720
baz1a	ACF1 \| DKFZp586E0518 \| FLJ14383 \| WALp1 \| WCRF180 \| hACF1	与锌指域相邻的溴结构域，1A	SNF2H与HACF1相互作用。	绑定	15780937
baz1b	WBSCR10 \|WBSCR9 \|WSTF	与锌指域相邻的溴结构域，1B	-	HPRD，Biogrid	11980720
baz2a	DKFZP781B109 \|FLJ13768 \|FLJ13780 \|FLJ45876 \|KIAA0314 \|tip5 \|WALP3	与锌指域相邻的溴结构域，2A	-	HPRD，Biogrid	11532953
CHD3	Mi-2a \|mi2-alpha \|ZFH	染色体群酶DNA结合蛋白3	Co-purification	Biogrid	12198550
chrac1	charc1 \|charc15 \|chrac15 \|YCL1	染色质可及性复合物1	-	HPRD	12434153
chrac1	charc1 \|charc15 \|chrac15 \|YCL1	染色质可及性复合物1	亲和力捕获 - 韦斯特恩 Co-purification	Biogrid	10880450
DNMT3B	ICF \|M.Hsaiiib	DNA（胞嘧啶-5-） - 甲基转移酶3β	Co-purification	Biogrid	15148359
DNMT3B	ICF \|M.Hsaiiib	DNA（胞嘧啶-5-） - 甲基转移酶3β	DNMT3B与HSNF2H相互作用。	绑定	15120635
H3F3A	H3.3a \|H3F3 \|MGC87782 \|MGC87783	H3组蛋白，家庭3a	H3F3A（组蛋白3）与SMARCA5（SNF2H）相互作用。	绑定	15616580
HDAC2	RPD3 \|yaf1	组蛋白脱乙酰基酶2	SMARCA5（SNF2H）与HDAC2相互作用。	绑定	15775975
HDAC2	RPD3 \|yaf1	组蛋白脱乙酰基酶2	Co-purification	Biogrid	12198550
HNF1A	HNF1 \| LFB1 \| MODY3 \| TCF1	HNF1 homeobox A	SNF2H与HNF-1基因相互作用。	绑定	15616580
PHC3	dkfzp313k1221 \|EDR3 \|FLJ12729 \|FLJ12967 \|HPH3 \|MGC88144	多瘤同源物3（果蝇）	-	HPRD	12167701
POLE3	CANCAN17 \|Chrac17 \|ybl1 \|P17	polymerase (DNA directed), epsilon 3 (p17 subunit)	亲和力捕获 - 韦斯特恩 Co-purification	Biogrid	10880450
RAD21	FLJ25655 \|FLJ40596 \|HR21 \|hrad21 \|KIAA0078 \|MCD1 \|NXP1 \|SCC1 \|HHR21	RAD21同源物（S. Pombe）	-	HPRD，Biogrid	12198550
RBBP4	NURF55 \|RBAP48	retinoblastoma binding protein 4	Co-purification	Biogrid	12198550
SATB1	-	SATB HONEOBOX 1	-	HPRD，Biogrid	12374985
SMC1A	CDLS2 \|DKFZP686L19178 \|DXS423E \|KIAA0178 \|MGC138332 \|SB1.8 \|SMC1 \|SMC1L1 \|smc1alpha \|SMCB	structural maintenance of chromosomes 1A	Co-purification	Biogrid	12198550
SMC3	bam \|BMH \|CDLS3 \|CSPG6 \|HCAP \|SMC3L1	染色体的结构维护3	Co-purification	Biogrid	12198550

V.途径注释

路径名	路径大小	＃szgr 2.0基因	信息
反应组细胞周期	421	253	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome染色体维护	122	80	All SZGR 2.0 genes in this pathway
新CENPA的反应组沉积在丝粒处含有核小体	64	43	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Onken Uveal黑色素瘤	783	507	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Davicioni分子臂与ERMS	332	228	All SZGR 2.0 genes in this pathway
迪亚兹慢性巨态性白血病	1382	904	All SZGR 2.0 genes in this pathway
tien肠益生菌24小时	557	331	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Baris甲状腺癌DN	59	45	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Schlosser血清反应DN	712	443	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Dacosta UV响应通过ERCC3 DN	855	609	All SZGR 2.0 genes in this pathway
PUJANA BRCA1 PCC网络	1652	1023	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Pujana ATM PCC网络	1442	892	All SZGR 2.0 genes in this pathway
PUJANA CHEK2 PCC网络	779	480	All SZGR 2.0 genes in this pathway
SCHAEFFER PROSTATE DEVELOPMENT 6HR DN	514	330	All SZGR 2.0 genes in this pathway
SCHAEFFER SOX9 TARGETS IN PROSTATE DEVELOPMENT DN	45	33	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Stark前额叶皮层22Q11删除	195	138	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Shen Smarca2目标	424	268	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Mori未成熟B淋巴细胞DN	90	55	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Zhan多发性骨髓瘤CD1和CD2 UP	89	51	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Wang Smarce1靶向DN	371	218	All SZGR 2.0 genes in this pathway
马丁内斯对trabectedin dn的反应	271	175	All SZGR 2.0 genes in this pathway
RIGGINS TAMOXIFEN RESISTANCE DN	220	147	All SZGR 2.0 genes in this pathway
克拉斯的iwanaga致癌作用	170	107	All SZGR 2.0 genes in this pathway
张乳腺癌祖细胞	425	253	All SZGR 2.0 genes in this pathway
张TLX目标36小时DN	185	116	All SZGR 2.0 genes in this pathway
winnepenninckx黑色素瘤转移	162	86	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Ongusaha BRCA1靶向DN	14	9	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Johnstone Parvb目标3 DN	918	550	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Lee BMP2靶向DN	882	538	All SZGR 2.0 genes in this pathway
FEVR CTNNB1靶向DN	553	343	All SZGR 2.0 genes in this pathway

基因页：Smarca5