基因页:ACC
概括?
基因 | 84680 |
象征 | ACC |
同义词 | ACS | PHAC |
描述 | 1-氨基丙烷-1-羧酸盐合酶同源物(无活性) |
参考 | MIM:608405|HGNC:HGNC:23989|ENSEMBL:ENSG00000110455|HPRD:10524|Vega:Otthumg00000166427 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 11P11 |
Pascal P值 | 0.088 |
胎儿β | -0.2 |
主持人 | 尾状基底神经节 小脑半球 小脑 皮质 额叶皮质BA9 海马 下丘脑 伏隔核基底神经节 梭子基底神经节 迈尔斯的顺式和跨性别 元 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS10994209 | Chr10 | 61877705 | ACC | 84680 | 0.18 | 反式 | ||
RS178501 | 11 | 44081716 | ACC | ENSG00000110455.9 | 3.621E-8 | 0 | -5759 | gtex_brain_putamen_basal |
RS178502 | 11 | 44082356 | ACC | ENSG00000110455.9 | 2.386E-6 | 0 | -5119 | gtex_brain_putamen_basal |
RS178504 | 11 | 44083650 | ACC | ENSG00000110455.9 | 1.731E-9 | 0 | -3825 | gtex_brain_putamen_basal |
。 | 11 | 44084573 | ACC | ENSG00000110455.9 | 2.613E-6 | 0 | -2902 | gtex_brain_putamen_basal |
RS178505 | 11 | 44084849 | ACC | ENSG00000110455.9 | 7.967E-10 | 0 | -2626 | gtex_brain_putamen_basal |
RS178506 | 11 | 44085369 | ACC | ENSG00000110455.9 | 4.106E-9 | 0 | -2106 | gtex_brain_putamen_basal |
RS2074038 | 11 | 44087989 | ACC | ENSG00000110455.9 | 2.407E-6 | 0 | 514 | gtex_brain_putamen_basal |
RS3923808 | 11 | 44117122 | ACC | ENSG00000110455.9 | 1.766E-6 | 0 | 29647 | gtex_brain_putamen_basal |
RS12365753 | 11 | 44117424 | ACC | ENSG00000110455.9 | 1.625E-6 | 0 | 29949 | gtex_brain_putamen_basal |
RS10838235 | 11 | 44131354 | ACC | ENSG00000110455.9 | 2.762E-6 | 0 | 43879 | gtex_brain_putamen_basal |
RS7102268 | 11 | 44144643 | ACC | ENSG00000110455.9 | 1.195E-6 | 0 | 57168 | gtex_brain_putamen_basal |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/ACCS_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
阿塞维多肝癌DN | 540 | 340 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿塞维多肝肿瘤与正常的邻近组织DN | 274 | 165 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yoshimura mapk8靶向 | 1305 | 895 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Chang Core血清反应DN | 209 | 137 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
棕熊UVC响应迟到 | 1137 | 655 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |