概括
基因 84690
象征 Spata22
同义词 NYD-SP20 | NYDSP20
描述 精子发生相关22
参考 HGNC:HGNC:30705|ENSEMBL:ENSG00000141255|HPRD:14862|Vega:Otthumg00000177609
基因类型 蛋白质编码
地图位置 17p13.3
Pascal P值 0.953
胎儿β 0.086
主持人 皮质
伏隔核基底神经节
支持 COMPOSITESET

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DNM:XU_2012 整个外显子组测序分析 在这项研究中,通过795个样品的外显子组测序鉴定了4个基因的从头突变

第一节遗传学和表观遗传学注释

@DNM表

基因 染色体 位置 参考 alt 成绩单 AA更改 突变类型 CG46 特征 学习
Spata22 CHR17 3352372 C t NM_001170695
NM_001170696
NM_001170697
NM_001170698
NM_001170699
NM_032598
p.134r> q
p.91r> q
p.134r> q
p.134r> q
p.134r> q
p.134r> q
错过
错过
错过
错过
错过
错过
精神分裂症 DNM:XU_2012


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
韦伯甲基化的HCP成纤维细胞DN 42 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
精子中的韦伯甲基化的HCP 20 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen IPS HCP与H3未甲基化 80 50 该途径中的所有SZGR 2.0基因