基因页:Spata22
概括?
基因 | 84690 |
象征 | Spata22 |
同义词 | NYD-SP20 | NYDSP20 |
描述 | 精子发生相关22 |
参考 | HGNC:HGNC:30705|ENSEMBL:ENSG00000141255|HPRD:14862|Vega:Otthumg00000177609 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 17p13.3 |
Pascal P值 | 0.953 |
胎儿β | 0.086 |
主持人 | 皮质 伏隔核基底神经节 |
支持 | COMPOSITESET |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DNM:XU_2012 | 整个外显子组测序分析 | 在这项研究中,通过795个样品的外显子组测序鉴定了4个基因的从头突变 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
DNM表
基因 | 染色体 | 位置 | 参考 | alt | 成绩单 | AA更改 | 突变类型 | 筛 | CG46 | 特征 | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Spata22 | CHR17 | 3352372 | C | t | NM_001170695 NM_001170696 NM_001170697 NM_001170698 NM_001170699 NM_032598 |
p.134r> q p.91r> q p.134r> q p.134r> q p.134r> q p.134r> q |
错过 错过 错过 错过 错过 错过 |
精神分裂症 | DNM:XU_2012 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/SPATA22_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
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韦伯甲基化的HCP成纤维细胞DN | 42 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
精子中的韦伯甲基化的HCP | 20 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen IPS HCP与H3未甲基化 | 80 | 50 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |